සම්පූර්ණ ජෙනෝම බයිසල්ෆයිට් අනුක්‍රමණය (WGBS)
සම්පූර්ණ ජෙනෝම් බයිසල්ෆයිට් අනුක්‍රමණය (WGBS) යනු DNA මෙතිලේෂන් ගැඹුරින් ගවේෂණය කිරීම සඳහා වන රන්-සම්මත ක්‍රමය ලෙසයි, විශේෂයෙන් ජාන ප්‍රකාශනයේ සහ සෛලීය ක්‍රියාකාරකම්වල ප්‍රධාන නියාමකයක් වන සයිටොසීන් (5-mC) හි පස්වන ස්ථානය. ඩබ්ලිව්ජීබීඑස් හි මූලික මූලධර්මය බයිසල්ෆයිට් ප්‍රතිකාරය ඇතුළත් වන අතර, මෙතිලේටඩ් සයිටොසීන් නොවෙනස්ව තබමින් යුරේසිල් (සී සිට යූ දක්වා) බවට පරිවර්තනය කිරීම ප්‍රේරණය කරයි. මෙම තාක්‍ෂණය තනි-පාදක විභේදනය ලබා දෙන අතර, පර්යේෂකයන්ට මෙතිලෝම පුළුල් ලෙස විමර්ශනය කිරීමට සහ විවිධ තත්වයන්ට, විශේෂයෙන් පිළිකා සමඟ සම්බන්ධ අසාමාන්‍ය මෙතිලේෂන් රටා අනාවරණය කිරීමට ඉඩ සලසයි. WGBS භාවිතා කිරීමෙන්, විද්‍යාඥයින්ට විවිධ ජීව විද්‍යාත්මක ක්‍රියාවලීන් සහ රෝග වලට පාදක වන අපිජෙනටික් යාන්ත්‍රණයන් පිළිබඳ සියුම් අවබෝධයක් ලබා දෙමින් ජාන-පුළුල් මෙතිලේෂන් භූ දර්ශන පිළිබඳ අසමසම අවබෝධයක් ලබා ගත හැකිය.
සේවා විශේෂාංග
● යොමු ජෙනෝමයක් අවශ්‍ය වේ.
● Bisulfite පරිවර්තන කාර්යක්ෂමතාව නිරීක්ෂණය කිරීම සඳහා Lambda DNA එකතු කරනු ලැබේ.
● Illumina NovaSeq හි අනුපිළිවෙල.
සේවා වාසි
●DNA මෙතිලේෂන් පර්යේෂණ සඳහා රන් ප්‍රමිතිය: මෙම පරිණත මෙතිලේෂන් පරිවර්තන සැකසුම් තාක්ෂණයට ඉහළ නිරවද්‍යතාවයක් සහ හොඳ ප්‍රතිනිෂ්පාදනයක් ඇත.
●පුළුල් ආවරණය සහ තනි-පාදක විභේදනය:ජානමය මට්ටමින් මෙතිලේෂන් ස්ථාන හඳුනා ගැනීම.
●සම්පූර්ණ වේදිකාව:නියැදි සැකසීම, පුස්තකාල ඉදිකිරීම, අනුපිළිවෙලින් ජෛව තොරතුරු විශ්ලේෂණය දක්වා එක්-නැවතුම් විශිෂ්ට සේවාවක් සපයයි.
●පුළුල් විශේෂඥතාව: WGBS අනුක්‍රමික ව්‍යාපෘති සමඟින් විවිධ වූ විශේෂ පරාසයක් හරහා සාර්ථකව නිම කරන ලද BMKGENE දශකයකට වැඩි පළපුරුද්දක්, ඉහළ නිපුණතා විශ්ලේෂණ කණ්ඩායමක්, විස්තීරණ අන්තර්ගතයක් සහ විශිෂ්ට අලෙවියෙන් පසු සහයක් ගෙන එයි.
●පිටපත් කිරීමේ විශ්ලේෂණය සමඟ සම්බන්ධ වීමේ හැකියාව: RNA-seq වැනි අනෙකුත් omics දත්ත සමඟ WGBS ඒකාබද්ධ විශ්ලේෂණයට ඉඩ සලසයි.
නියැදි පිරිවිතර
| පුස්තකාලය | අනුක්‍රමික උපාය මාර්ගය | නිර්දේශිත දත්ත ප්‍රතිදානය | තත්ත්ව පාලනය |
| Bisulfite ප්රතිකාර | Illumina PE150 | 30x ගැඹුර | Q30 ≥ 85% Bisulfite පරිවර්තනය > 99% |
නියැදි අවශ්යතා
| සාන්ද්රණය (ng/µL) | මුළු මුදල (µg) | අමතර අවශ්යතා | |
| ජානමය DNA | ≥ 5 | ≥ 400 ng | සීමිත පිරිහීම හෝ දූෂණය |
සේවා වැඩ ප්රවාහය
සාම්පල භාරදීම
DNA නිස්සාරණය
පුස්තකාල ඉදිකිරීම
අනුපිළිවෙල
දත්ත විශ්ලේෂණය
දත්ත බෙදා හැරීම
පහත විශ්ලේෂණය ඇතුළත් වේ:
● අමු අනුපිළිවෙල තත්ත්ව පාලනය;
● යොමු ජෙනෝමය වෙත සිතියම්ගත කිරීම;
● 5mC මෙතිලේටඩ් භෂ්ම හඳුනාගැනීම;
● මෙතිලේෂන් ව්‍යාප්තිය සහ විවරණ විශ්ලේෂණය;
● වෙනස් ලෙස මෙතිලේටඩ් කලාප (DMRs) විශ්ලේෂණය;
● DMR වලට සම්බන්ධ ජානවල ක්‍රියාකාරී විවරණ.
5mC මෙතිලේෂන් හඳුනාගැනීම: මෙතිලේටඩ් අඩවි වර්ග
මෙතිලේෂන් සිතියම. 5mC මෙතිලේෂන් ජෙනෝමය පුරා ව්‍යාප්තිය
අධික මෙතිල්කරණය වූ කලාපවල විවරණය
වෙනස් ලෙස මෙතිලේටඩ් කලාප: ආශ්‍රිත ජාන
වෙනස් ලෙස මෙතිලේටඩ් කලාප: ආශ්‍රිත ජානවල විවරණ (ජාන ඔන්ටොලොජි)
සකස් කරන ලද ප්‍රකාශන එකතුවක් හරහා BMKGene හි සම්පූර්ණ ජෙනෝම බයිසල්ෆයිට් අනුක්‍රමික සේවා මගින් පහසුකම් සපයන පර්යේෂණ දියුණුව ගවේෂණය කරන්න.
Fan, Y. et al. (2020) 'සම්පූර්ණ ජෙනෝම බයිසල්ෆයිට් අනුක්‍රමණය භාවිතා කරමින් බැටළු අස්ථි මාංශ පේශි වර්ධනය කිරීමේදී DNA මෙතිලේෂන් පැතිකඩ විශ්ලේෂණය කිරීම',BMC ජෙනොමික්ස්, 21(1), පි. 1-15. doi: 10.1186/S12864-020-6751-5.
Zhao, X. et al. (2022) 'වයිනයිල් ක්ලෝරයිඩ් වලට නිරාවරණය වන කම්කරුවන් තුළ නව ඩිඔක්සිරයිබොනියුක්ලික් අම්ල මෙතිලේෂන් කැළඹීම්',විෂ විද්යාව සහ කාර්මික සෞඛ්යය, 38(7), පි. 377-388. doi: 10.1177/07482337221098600
Zuo, J. et al. (2020) 'ජෙනෝමය මෙතිල්කරණය, කේතීකරණය නොවන RNA මට්ටම්, තක්කාලි ගෙඩි ඉදවීමේදී mRNA සහ පරිවෘත්තීය අතර සම්බන්ධතා',ශාක සඟරාව, 103(3), පි. 980-994. doi: 10.1111/TPJ.14778.
