විශේෂිත-ලොකගේ විස්තාරණ කැබලි අනුක්රමණය කිරීම (SLAF-SEQ)
වැඩ ප්රවාහය
තාක්ෂණික යෝජනා ක්රමය
සේවා විශේෂාංග
Pe pe150 සමඟ නවසීක් හි අනුක්රමික වීම.
Drain ද්විත්ව තීරු කට්ටල සමඟ පුස්තකාලය සකස් කිරීම, සාම්පල 1000 කට වඩා සංචලනය කිරීම.
නඩුව සඳහාම විවිධ ජෛව තොරතුරු තාක්ෂණ නල මාර්ග සහිතව හෝ නොගැලපීමක් සමඟ මෙම තාක්ෂණය යොමු කළ හැකිය:
යොමු ජෙනෝමය සමඟ: එස්එන්පී සහ ඉන්ඩෙල් සොයාගැනීම
යොමු නොමැතිව ජෙනෝමය: නියැදි පොකුරු සහ SNP සොයා ගැනීම
There හිසිලිකෝ හිපූර්ව සැලසුම් අවධිය බහු සීමාන් එන්සයිම සංයෝජන ජෙනෝමය දිගේ SLAF ටැග් ඒකාකාරව බෙදා හැරීම ජනනය කරයි.
අත්හදා බැලීමේදී, ශ්රී ලංකා පුස්තකාල 9 ක් උත්පාදනය කිරීම සඳහා එන්සයිම සංයෝජන 3 ක් සාම්පල තුනකින් පරීක්ෂා කරනු ලබන අතර ව්යාපෘතිය සඳහා ප්රශස්ත ලද සීමාව එන්සිම් සංයෝජනය තෝරා ගැනීම සඳහා මෙම තොරතුරු භාවිතා කරයි.
සේවා වාසි
●අධි ජානමය සලකුණු සොයාගැනීම: ඉහළ-ආදාන ද්විත්ව තීරු කේත පද්ධතියක් ඒකාබද්ධ කිරීම විශාල ජනගහනයක් එකවර අනුපිළිවෙල සඳහා ඉඩ සලසයි, සහ භූගත-විශේෂිත විස්තාරණය කාර්යක්ෂමතාව වැඩි කරයි, TAG අංක විවිධ පර්යේෂණ ප්රශ්න වල විවිධ අවශ්යතා සපුරාලන බව සහතික කරයි.
● ජෙනෝමය මත අඩු යැපීම: එය යොමු ජෙනෝමය සහිත හෝ නැතිව විශේෂ සඳහා යෙදිය හැකිය.
●නම්යශීලී යෝජනා ක්රමය නිර්මාණය: තනි එන්සයිම, ද්විත්ව එන්සයිම, බහු එන්සයිම ජීර්ණය කිරීම සහ විවිධ පර්යේෂණ අරමුණු හෝ විශේෂ සඳහා විවිධ වර්ගයේ එන්සයිම තෝරා ගත හැකිය. ඒසිලිකෝ හිප්රශස්ත එන්සයිම මෝස්තරයක් සහතික කිරීම සඳහා පූර්ව සැලසුම සිදු කරනු ලැබේ.
● එන්සයික් ජීර්ණයේ ඉහළ කාර්යක්ෂමතාවයක්: සරුවල් කිරීමසිලිකෝ හික්රෝමොම් (1 SLAF TAG / 4KB) SLAF ටැග් බෙදා හැරීමත් සමඟ පෙර සැලසුම් කිරීම සහ පූර්ව අත්හදා බැලීමකට පෙර අත්හදා බැලීමේ ප්රශස්ත නිර්මාණ (1 SLAF TAG / 4KB අඩු කිරීම (<5%).
●පුළුල් විශේෂ ise තාව: අපේ කණ්ඩායම සෑම ව්යාපෘතියකටම අත්දැකීම් රාශියක් ගෙන එන්නේ ශාක, ක්ෂීරපායින්, කුරුල්ලන්, සහ කෘමීන් සහ ජලජ ජීවීන් ඇතුළු විශේෂ සිය ගණනක SLAF-SEQ ව්යාපෘති 5000 කට අධික සංඛ්යාවක් වසා දැමීමේ වාර්තාවකි.
● ස්වයං-සංවර්ධිත ජෛව තොරතුරු තාක්ෂණමය වැඩ ප්රවාහය: BMKGENE විසින් අවසාන ප්රතිදානයේ විශ්වසනීයත්වය සහ නිරවද්යතාවය සහතික කිරීම සඳහා SLAF-SEQ සඳහා ඒකාබද්ධ ජෛව සම්මිශ්රණයක් සහිත ජෛව සම්මිශ්රීය වැඩ ප්රවාහයක් ඇති කළේය.
සේවා පිරිවිතර
| විශ්ලේෂණ වර්ගය | නිර්දේශිත ජනගහන පරිමාණය | අනුක්රමික උපාය | |
| ටැගයේ ගැඹුර අනුක්රමණය | ටැග් අංකය | ||
| ජාන සිතියම් | 2 දෙමාපියන් සහ> 110 දරුවන් | දෙමාපියන්: 20x ඩබ්ලිව්. ඕෆ්සිං: 10x | ජෙනේම් ප්රමාණය: <400 MB: WGS නිර්දේශ කෙරේ <1GB: 100K ටැග් 1-2gb :: 200k ටැග් > 2GB: 300k ටැග් උපරිම 500k ටැග් |
| ජෙනේම්පු පුළුල් කිරීමේ සංගමයේ අධ්යයන (GWAS) | ≥200 සාම්පල | 10x | |
| ජානමය පරිණාමය | ≥30 සාම්පල, එක් එක් උප සමූහයකින් සාම්පල 10 ක් ඇත | 10x | |
සේවා අවශ්යතා
සාන්ද්රණය ≥ 5 Ng / μl
මුළු මුදල ≥ 80 ng
Nanodrop od260 / 280 = 1.6-2.5
Agarose ජෙල්: සීමිත හා සීමිත හායාවක් හෝ අපවිත්ර වීමක් නැත
නිර්දේශිත නියැදි භාරදීම
කන්ටේනරය: 2 ml කේන්ද්රීය නල
(බොහෝ සාම්පල සඳහා, එතනෝල් තුළ සංරක්ෂණය නොකිරීමට අපි නිර්දේශ කරමු)
නියැදි ලේබල් කිරීම: සාම්පල පැහැදිලිව ලේබල් කර සාම්පල තොරතුරු පෝරමය සඳහා සමාන විය යුතුය.
නැව්ගත කිරීම: වියළි-අයිස්: සාම්පල පළමුව බෑග්වල ඇසුරුම් කළ යුතු අතර වියළි අයිස්වල වළලනු ලැබේ.
සේවා වැඩ ප්රවාහය
නියැදි QC
නියමු අත්හදා බැලීම
SLAF අත්හදා බැලීම
පුස්තකාල සකස් කිරීම
අනුක්රමණය
දත්ත විශ්ලේෂණය
පසු විකුණුම් සේවා
පහත දැක්වෙන විශ්ලේෂණය ඇතුළත් වේ:
- දත්ත QC අනුක්රමික
- SLAF TAG සංවර්ධනය
යොමු ලෙස ජෙනෝමය වෙත සිතියම් ගත කිරීම
යොමු යෙදුම් නොමැතිව: පොකුරු කිරීම
- SLAF ටැග් විශ්ලේෂණය: සංඛ්යාලේඛන, ජෙනෝමය හරහා බෙදා හැරීම
- මාර්කර් ඩිස්කවරි: එස්එන්පී, ඉන්ඩෙල්, එස්එන්වී, සීවී කැඳවීම සහ විවීම
වර්ණදේහ මත SLAF ටැග් බෙදා හැරීම:
වර්ණදේහ මත එස්එන්පී බෙදා හැරීම:
SNP විවරණය
| අවුරුද්ද | ජර්නලය | IF | මාතෘකාව | අයදුම්පත් |
| 2022 | සොබාදහම සන්නිවේදනය | 17.694 | ගිගා-වර්ණදේමේ ජෙනෝමික් පදනම ගස peyony හි ගිගා-ජෙනෝයි Peeonia ostii | SLAF-GWAS |
| 2015 | නව ෆයිටොලොජිස්ට් | 7.433 | ගෘහස්ථ පාෂාණ කෘෂි විද්යාත්මක වැදගත්කමක් ඇති ජානමය කලාපයන් නැංගුරම් සෝයා බෝංචි | SLAF-GWAS |
| 2022 | උසස් පර්යේෂණ පිළිබඳ ජර්නලය | 12.822 | ජෙනෝමයක් වන ගොසියාවේ බාබඩෙන්ස් හි ජී. හර්ටම් වෙත ආභරණ කපු තන්තු වල ගුණාත්මකභාවය සහ අස්වැන්න එකවර වැඩිදියුණු කිරීම සඳහා උසස් ලොක් හෙළි කරන්න ගති ලක්ෂණ | SLAF-පරිණාමීය ජාන විද්යාව |
| 2019 | අණුක ශාකය | 10.81 | ජනගහන ජෙනෝමික් විශ්ලේෂණය සහ ඩි නවෝ එකලස් කිරීම වල්චි වල ආරම්භය හෙළි කරයි සහල් පරිණාමීය ක්රීඩාවක් ලෙස | SLAF-පරිණාමීය ජාන විද්යාව |
| 2019 | නේචර් ජාන විද්යාව | 31.616 | ජෙනෝමය අනුක්රමය සහ පොදු කාප්, සයිප්රිනස් කාපියෝ පොදු | SLAF-Linkage සිතියම |
| 2014 | නේචර් ජාන විද්යාව | 25.455 | වගා කරන ලද රටකජුවල ජෙනෝම් රනිල කුලදෝටොටිඩේ, පොලිප්ලොයිඩ් පිළිබඳ අවබෝධයක් ලබා දෙයි පරිණාමය සහ බෝග හීලෑ කිරීම. | SLAF-Linkage සිතියම |
| 2022 | ශාක ජෛව තාක්ෂණික සඟරාව | 9.803 | ST1 හඳුනා ගැනීම බීජීය රූප විද්යාව හචිං සම්බන්ධ තේරීමක් හෙළි කරයි සෝයා බෝංචි හීලෑ කිරීම අතරතුර තෙල් අන්තර්ගතය | SLAF Marker සංවර්ධනය |
| 2022 | අණුක විද්යා පිළිබඳ ජාත්යන්තර සඟරාව | 6.208 | තිරිඟු-ලෙමයිමස් මොලිස් මොලිස් 2ns (2D) සඳහා හඳුනා ගැනීම සහ ඩීඑන්ඒ සලකුණු සංවර්ධනය විකාරරූපී වර්ණදේහ ආදේශනය | SLAF Marker සංවර්ධනය |
| අවුරුද්ද | ජර්නලය | IF | මාතෘකාව | අයදුම්පත් |
| 2023 | ශාක විද්යාවේ දේශසීමා | 6.735 | පයිරස් පිරිෆොලියාවේ පළතුරු ඉදවීම අතරතුර සීනි අන්තර්ගතය පිළිබඳ QTL සිතියම්ගත කිරීම සහ සීනි අන්තර්ගතය පිළිබඳ විශ්ලේෂණය | ජානමය සිතියම |
| 2022 | ශාක ජෛව තාක්ෂණික සඟරාව | 8.154 | එස්.ටී. 1 හඳුනා ගැනීමෙන් සෝයා බෝංචි හීලෑ කිරීම අතරතුර බීජ රූප විද්යාව හා තෙල් අන්තර්ගතයන් හිචිං සම්බන්ධ තේරීමක්
| එස්එන්පී කැඳවීම |
| 2022 | ශාක විද්යාවේ දේශසීමා | 6.623 | නියඟ පරිසරවල හල් රහිත තමන් සහිත ෆීනෝටයිසේන් ජෙනේම් පුළුල් හාෂුය ආශ්රය කිරීම.
| GWAS |
