-
BMKMANU S3000_Spatial Transscriptome
අවකාශීය පිටපත් විද්යාව විද්‍යාත්මක නවෝත්පාදනයේ ඉදිරියෙන්ම සිටින අතර, ඒවායේ අවකාශීය සන්දර්භය ආරක්ෂා කර ගනිමින් පටක තුළ ඇති සංකීර්ණ ජාන ප්‍රකාශන රටා ගැන සොයා බැලීමට පර්යේෂකයන් බල ගන්වයි. විවිධ වේදිකා මධ්‍යයේ, BMKGene විසින් BMKManu S3000 අවකාශීය ට්‍රාන්ස්ක්‍රිප්ටම් චිපය සංවර්ධනය කර ඇති අතර, 3.5µm ක වැඩි දියුණු කළ විභේදනයක් ගැන පුරසාරම් දොඩමින්, උප සෛල පරාසයට ළඟා වෙමින්, සහ බහු මට්ටමේ විභේදන සැකසුම් සක්‍රීය කරයි. S3000 චිපය, දළ වශයෙන් මිලියන 4 ක ලප සහිත, අවකාශීය තීරු කේත සහිත ග්‍රහණ පරීක්ෂණවලින් පටවන ලද පබළු සහිත ස්තර සහිත මයික්‍රෝවේල් භාවිතා කරයි. අවකාශීය තීරු කේත වලින් පොහොසත් cDNA පුස්තකාලයක් S3000 චිපයෙන් සකස් කර පසුව Illumina NovaSeq වේදිකාවේ අනුපිළිවෙලට සකස් කර ඇත. අවකාශීය තීරු කේත සහිත සාම්පල සහ UMI වල සංයෝජනය ජනනය කරන ලද දත්තවල නිරවද්‍යතාවය සහ නිශ්චිතභාවය සහතික කරයි. BMKManu S3000 චිපය අතිශයින් බහුකාර්ය වන අතර, විවිධ පටක වලට සියුම්ව සුසර කළ හැකි බහු මට්ටමේ විභේදන සැකසුම් සහ අවශ්‍ය විස්තර මට්ටම් ඉදිරිපත් කරයි. මෙම අනුවර්තනය වීමේ හැකියාව චිපය විවිධ අවකාශීය පිටපත් කිරීමේ අධ්‍යයනයන් සඳහා විශිෂ්ට තේරීමක් ලෙස ස්ථානගත කරයි, අවම ශබ්දයක් සහිත නිරවද්‍ය අවකාශීය පොකුරු කිරීම සහතික කරයි. BMKManu S3000 සමඟ සෛල ඛණ්ඩනය කිරීමේ තාක්ෂණය භාවිතයෙන් සෛලවල මායිම් වෙත පිටපත් කිරීමේ දත්ත සීමා කිරීම සක්‍රීය කරයි, ප්‍රතිඵලයක් ලෙස සෘජු ජීව විද්‍යාත්මක අර්ථයක් ඇති විශ්ලේෂණයක් සිදු වේ. තවද, S3000 හි වැඩි දියුණු කළ විභේදනය හේතුවෙන් සෛලයකට වැඩි ජාන සහ UMIs සංඛ්‍යාවක් අනාවරණය වන අතර, අවකාශීය පිටපත් කිරීමේ රටා සහ සෛල පොකුරු පිළිබඳ වඩාත් නිවැරදි විශ්ලේෂණයක් කිරීමට හැකි වේ.
-
තනි-න්යෂ්ටික RNA අනුක්රමය
තනි-සෛල ග්‍රහණය සහ අභිරුචි පුස්තකාල ඉදිකිරීම් ශිල්පීය ක්‍රම දියුණු කිරීම, ඉහළ-නිලධාරී අනුපිළිවෙල සමඟ සම්බන්ධ වී, සෛල මට්ටමින් ජාන ප්‍රකාශන අධ්‍යයනයේ විප්ලවීය වෙනසක් සිදු කර ඇත. මෙම ප්‍රගමනය මගින් සංකීර්ණ සෛල ජනගහන ගැඹුරින් හා වඩා විස්තීර්ණ විශ්ලේෂණයක් සිදු කිරීමට ඉඩ සලසයි, සියලුම සෛල මත සාමාන්‍ය ජාන ප්‍රකාශනය හා සම්බන්ධ සීමාවන් මඟහරවා ගැනීම සහ මෙම ජනගහනය තුළ සැබෑ විෂමජාතිය ආරක්ෂා කරයි. තනි සෛල RNA අනුක්‍රමණය (scRNA-seq) ප්‍රතික්ෂේප කළ නොහැකි වාසි ඇති අතර, එය තනි සෛල අත්හිටුවීමක් නිර්මාණය කිරීම දුෂ්කර වන අතර නැවුම් සාම්පල අවශ්‍ය වන ඇතැම් පටකවල අභියෝගවලට මුහුණ දෙයි. BMKGene හි දී, අපි අති නවීන 10X Genomics Chromium තාක්ෂණය භාවිතයෙන් තනි-න්යෂ්ටික RNA අනුක්‍රමණය (snRNA-seq) ලබා දීමෙන් මෙම බාධාව විසඳන්නෙමු. මෙම ප්‍රවේශය තනි සෛල මට්ටමින් පිටපත් කිරීමේ විශ්ලේෂණයට සුදුසු සාම්පල වර්ණාවලිය පුළුල් කරයි.
න්‍යෂ්ටීන් හුදකලා කිරීම නව්‍ය 10X ජෙනොමික්ස් ක්‍රෝමියම් චිපය හරහා සිදු කෙරේ, ද්විත්ව හරස් මාර්ග සහිත නාලිකා අටක ක්ෂුද්‍ර තරල පද්ධතියක් ඇතුළත් වේ. මෙම පද්ධතිය තුළ, බාර්කෝඩ්, ප්‍රයිමර්, එන්සයිම සහ තනි න්‍යෂ්ටියක් ඇතුළත් ජෙල් පබළු නැනෝලිටර ප්‍රමාණයේ තෙල් බිංදු වල කොටු කර Gel Bead-in-Emulsion (GEM) සාදයි. GEM සෑදීමෙන් පසුව, එක් එක් GEM තුළ සෛල ඛාදනය සහ තීරු කේතය මුදා හැරීම සිදු වේ. පසුව, mRNA අණු cDNAs වෙත ප්‍රතිලෝම පිටපත් කිරීම සිදු කරයි, 10X තීරු කේත සහ අද්විතීය අණුක හඳුනාගැනීම් (UMIs) ඇතුළත් වේ. මෙම cDNAs පසුව සම්මත අනුක්‍රමික පුස්තකාල ඉදිකිරීමට යටත් වන අතර, තනි සෛල මට්ටමින් ජාන ප්‍රකාශන පැතිකඩ පිළිබඳ ශක්තිමත් සහ විස්තීර්ණ ගවේෂණයකට පහසුකම් සපයයි.
වේදිකාව: 10× Genomics Chromium සහ Illumina NovaSeq වේදිකාව
-
10x Genomics Visium අවකාශීය පිටපත් කිරීම
අවකාශීය පිටපත් කිරීම යනු පර්යේෂකයන්ට ඒවායේ අවකාශීය සන්දර්භය ආරක්ෂා කරමින් පටක තුළ ජාන ප්‍රකාශන රටා විමර්ශනය කිරීමට ඉඩ සලසන අති නවීන තාක්‍ෂණයකි. මෙම වසමේ එක් ප්‍රබල වේදිකාවක් වන්නේ 10x Genomics Visium සහ Illumina අනුපිළිවෙලයි. 10X Visium හි මූලධර්මය පටක කොටස් තැන්පත් කර ඇති නම් කරන ලද ග්‍රහණ ප්‍රදේශයක් සහිත විශේෂිත චිපයක් මත පිහිටා ඇත. මෙම ග්‍රහණ ප්‍රදේශයේ තීරු කේත සහිත ලප අඩංගු වන අතර, ඒ සෑම එකක්ම පටක තුළ ඇති අද්විතීය අවකාශීය ස්ථානයකට අනුරූප වේ. පටක වලින් අල්ලා ගන්නා ලද RNA අණු පසුව ප්‍රතිලෝම පිටපත් කිරීමේ ක්‍රියාවලියේදී අද්විතීය අණුක හඳුනාගැනීම් (UMIs) සමඟ ලේබල් කරනු ලැබේ. මෙම තීරු කේත සහිත ලප සහ UMI මගින් නිශ්චිත අවකාශීය සිතියම්ගත කිරීම සහ තනි සෛල විභේදනයකදී ජාන ප්‍රකාශනය ප්‍රමාණ කිරීම සක්‍රීය කරයි. අවකාශීය තීරු කේත සහිත සාම්පල සහ UMI වල සංයෝජනය ජනනය කරන ලද දත්තවල නිරවද්‍යතාවය සහ නිශ්චිතභාවය සහතික කරයි. මෙම අවකාශීය පිටපත් කිරීමේ තාක්ෂණය භාවිතා කිරීමෙන්, පර්යේෂකයන්ට සෛලවල අවකාශීය සංවිධානය සහ පටක තුළ සිදුවන සංකීර්ණ අණුක අන්තර්ක්‍රියා පිළිබඳ ගැඹුරු අවබෝධයක් ලබා ගත හැකි අතර, ඔන්කොලොජි, ස්නායු විද්යාව, සංවර්ධන ජීව විද්යාව, ප්‍රතිශක්ති විද්යාව ඇතුළු විවිධ ක්ෂේත්‍රවල ජීව විද්‍යාත්මක ක්‍රියාවලීන්ට යටින් පවතින යාන්ත්‍රණයන් පිළිබඳ අගනා අවබෝධයක් ලබා දිය හැකිය. , සහ උද්භිද අධ්යයන.
වේදිකාව: 10X Genomics Visium සහ Illumina NovaSeq
