-
මෙවලම් කට්ටල
BMKCloud යනු වෛද්‍ය, කෘෂිකාර්මික, පාරිසරික යනාදී විවිධ ක්ෂේත්‍රවල පර්යේෂකයන් විසින් පුළුල් ලෙස විශ්වාස කරන ජානමය වැඩසටහන් සඳහා එක්-නැවතුම් විසඳුමක් සපයන ප්‍රමුඛ පෙළේ ජෛව තොරතුරු වේදිකාවකි. BMKCloud ජෛව තොරතුරු විශ්ලේෂණ වේදිකා සහ මෙවලම් ඇතුළු ඒකාබද්ධ, විශ්වාසදායක සහ කාර්යක්ෂම සේවාවන් සැපයීමට කැපවී සිටී. , පරිගණක සම්පත්, පොදු දත්ත සමුදාය, ජෛව තොරතුරු මාර්ගගත පාඨමාලා, ආදිය. BMKCloud සතුව ජාන ඇතුළු විවිධ නිතර භාවිතා වන ජෛව තොරතුරු මෙවලම් ඇත. විවරණ, පරිණාමීය ජාන මෙවලම්, ncRNA, දත්ත තත්ත්ව පාලනය, එකලස් කිරීම, පෙළගැස්වීම, දත්ත නිස්සාරණය, විකෘති, සංඛ්‍යාලේඛන, රූප උත්පාදක, අනුක්‍රමික විශ්ලේෂණය, ආදිය.
-
De novo බැක්ටීරියා ජෙනෝම එකලස් කිරීම
අපි සම්පූර්ණ බැක්ටීරියා ජෙනෝම එකලස් කිරීමේ සේවාවක් සපයන අතර, 0 හිඩැස් සහතික කරමු. එකලස් කිරීම සඳහා Nanopore සහ PacBio වැනි දිගු-කියවන අනුක්‍රමික තාක්ෂණයන් සහ Illumina සමඟ කෙටි කියවීමේ අනුක්‍රමය එකලස් කිරීම වලංගු කිරීම සහ ONT කියවීම් වල දෝෂ නිවැරදි කිරීම සඳහා ඒකාබද්ධ කිරීමෙන් මෙය කළ හැකිය. අපගේ සේවාව නිශ්චිත පර්යේෂණ ඉලක්ක සපුරා ගනිමින් එකලස් කිරීම, ක්‍රියාකාරී විවරණ සහ උසස් ජෛව තොරතුරු විශ්ලේෂණයෙන් සම්පූර්ණ ජෛව තොරතුරු කාර්ය ප්‍රවාහය සපයයි. විවිධ ප්‍රවේණික සහ ප්‍රවේණික අධ්‍යයනයන් සඳහා නිරවද්‍ය විමර්ශන ප්‍රවේණික වර්ධනයට මෙම සේවාව මඟින් හැකියාව ලැබේ. මීට අමතරව, එය වික්‍රියා ප්‍රශස්තිකරණය, ජාන ඉංජිනේරු විද්යාව සහ ක්ෂුද්‍රජීවී තාක්‍ෂණ සංවර්ධනය වැනි යෙදුම් සඳහා පදනම සකසයි, විද්‍යාත්මක තීක්ෂ්ණ බුද්ධිය සහ ජෛව තාක්‍ෂණික නවෝත්පාදනයන් ඉදිරියට ගෙන යාම සඳහා තීරණාත්මක විශ්වාසදායක සහ පරතරයකින් තොර ජානමය දත්ත සහතික කරයි.
-
කුඩා RNA
කුඩා RNA යනු miRNA, siRNA සහ piRNA ඇතුළුව සාමාන්‍ය දිග 18-30 nt සහිත කෙටි කේතීකරණය නොවන RNA වර්ගයකි. මෙම කුඩා RNAs mRNA ක්ෂය වීම, පරිවර්තන නිෂේධනය, heterochromatin ගොඩනැගීම වැනි විවිධ ජීව විද්‍යාත්මක ක්‍රියාවලීන් සඳහා විශාල වශයෙන් සම්බන්ධ වී ඇති බව වාර්තා වී ඇත. කුඩා RNA අනුක්‍රමික විශ්ලේෂණය සත්ව/ශාක සංවර්ධනය, රෝග, වෛරස් ආදිය පිළිබඳ අධ්‍යයනයන්හි බහුලව භාවිතා වේ. අනුක්‍රමික විශ්ලේෂණ වේදිකාව සම්මත විශ්ලේෂණය සහ උසස් දත්ත කැණීම් වලින් සමන්විත වේ. RNA-seq දත්ත මත පදනම්ව, සම්මත විශ්ලේෂණයට miRNA හඳුනාගැනීම සහ අනාවැකිය, miRNA ඉලක්ක ජාන අනාවැකිය, විවරණ සහ ප්‍රකාශන විශ්ලේෂණය ලබා ගත හැක. උසස් විශ්ලේෂණය මඟින් අභිරුචිකරණය කළ miRNA සෙවීම සහ නිස්සාරණය, Venn රූප සටහන් උත්පාදනය, miRNA සහ ඉලක්කගත ජාන ජාල ගොඩනැගීම සක්‍රීය කරයි.
-
NGS-WGS (Illumina/BGI)
NGS-WGS යනු Biomarker Technologies හි පොහොසත් අත්දැකීම් මත සංවර්ධනය කරන ලද සම්පූර්ණ ජාන ප්‍රති-අනුක්‍රමික විශ්ලේෂණ වේදිකාවකි. මෙම භාවිතයට පහසු වේදිකාව Illumina වේදිකාව සහ BGI අනුක්‍රමික වේදිකාව යන දෙකෙන්ම ජනනය කරන DNA අනුක්‍රමික දත්ත සඳහා ගැලපෙන මූලික පරාමිති කිහිපයක් සැකසීමෙන් ඒකාබද්ධ විශ්ලේෂණ කාර්ය ප්‍රවාහයක් ඉක්මනින් ඉදිරිපත් කිරීමට ඉඩ සලසයි. මෙම වේදිකාව ඉතා සීමිත කාලයක් තුළ ඉතා කාර්යක්ෂම දත්ත විශ්ලේෂණය බල ගන්වන ඉහළ කාර්ය සාධන පරිගණක සේවාදායකයක් මත යොදවා ඇත. විකෘති ජාන විමසුම, PCR ප්‍රාථමික නිර්මාණය යනාදිය ඇතුළුව සම්මත විශ්ලේෂණයේ පදනම මත පුද්ගලීකරණය කළ දත්ත කැණීම් ලබා ගත හැකිය.
-
mRNA(යොමු)
පිටපත් කිරීම යනු ප්‍රවේණික ප්‍රවේණික තොරතුරු සහ ජීව විද්‍යාත්මක ක්‍රියාකාරිත්වයේ ප්‍රෝටියෝමය අතර සම්බන්ධයයි. පිටපත් කිරීමේ මට්ටමේ නියාමනය යනු ජීවීන්ගේ වඩාත්ම වැදගත් සහ වඩාත් පුළුල් ලෙස අධ්‍යයනය කරන ලද නියාමන ක්‍රමයයි. පිටපත් කිරීමේ අනුපිළිවෙලට තනි නියුක්ලියෝටයිඩයකට නිවැරදි විභේදනයකින් ඕනෑම වේලාවක හෝ ඕනෑම කොන්දේසියක් යටතේ පිටපත අනුපිළිවෙලට අනුපිළිවෙල කළ හැක. ජාන පිටපත් කිරීමේ මට්ටම ගතිකව පරාවර්තනය කිරීමට, දුර්ලභ හා සාමාන්‍ය පිටපත් එකවර හඳුනාගෙන ප්‍රමාණ කිරීමට සහ ව්‍යුහාත්මක තොරතුරු සැපයිය හැකිය. නියැදි විශේෂිත පිටපත්.
වර්තමානයේදී, පිටපත් කිරීමේ අනුක්‍රමික තාක්‍ෂණය කෘෂි විද්යාව, වෛද්‍ය විද්යාව සහ සත්ව හා ශාක සංවර්ධන නියාමනය, පාරිසරික අනුවර්තනය, ප්‍රතිශක්තිකරණ අන්තර්ක්‍රියා, ජාන ස්ථානගත කිරීම, විශේෂ ජාන පරිණාමය සහ පිළිකා සහ ජානමය රෝග හඳුනාගැනීම ඇතුළු අනෙකුත් පර්යේෂණ ක්ෂේත්‍රවල බහුලව භාවිතා වේ.
-
Metagenomics (NGS)
මෙම විශ්ලේෂණ වේදිකාව නිර්මාණය කර ඇත්තේ වසර ගණනාවක අත්දැකීම් මත වෙඩි බෙහෙත් metagenomic දත්ත විශ්ලේෂණය සඳහා ය. දත්ත සැකසීම, විශේෂ මට්ටමේ අධ්‍යයනය, ජාන ක්‍රියාකාරී මට්ටමේ අධ්‍යයනය, මෙටජෙනෝමය බැඳීම, යනාදිය ඇතුළුව පොදුවේ අවශ්‍ය විවිධ මෙටාජෙනොමික්ස් විශ්ලේෂණ අඩංගු ඒකාබද්ධ කාර්ය ප්‍රවාහයකින් එය සමන්විත වේ. ඊට අමතරව, ජාන සහ විශේෂ විමසුම ඇතුළුව සම්මත විශ්ලේෂණ කාර්ය ප්‍රවාහය මත අභිරුචිගත කළ දත්ත කැණීම් මෙවලම් ලබා ගත හැකිය. , පරාමිති සැකසීම, පුද්ගලාරෝපිත රූප උත්පාදනය, ආදිය.
-
LncRNA
දිගු කේතීකරණය නොවන RNA (lncRNA) යනු ප්‍රෝටීන කේත කිරීමට නොහැකි nt 200 ට වඩා දිග පිටපත් වර්ගයකි. සමුච්චිත සාක්ෂි වලින් පෙනී යන්නේ බොහෝ lncRNAs ක්‍රියාකාරී වීමට බොහෝ දුරට ඉඩ ඇති බවයි. ඉහළ කාර්යක්ෂම අනුක්‍රමික තාක්ෂණයන් සහ ජෛව තොරතුරු විශ්ලේෂණ මෙවලම් මඟින් lncRNA අනුක්‍රම හෙළි කිරීමට සහ තොරතුරු වඩාත් කාර්යක්ෂමව ස්ථානගත කිරීමට සහ තීරණාත්මක නියාමන ක්‍රියාකාරකම් සහිත lncRNA සොයා ගැනීමට අපව බලගන්වයි. වේගවත්, විශ්වාසදායක සහ නම්‍යශීලී lncRNA විශ්ලේෂණයක් ලබා ගැනීම සඳහා අපගේ පාරිභෝගිකයින්ට lncRNA අනුක්‍රමික විශ්ලේෂණ වේදිකාවක් සැපයීම BMKCloud ආඩම්බර වේ.
-
GWAS
Genome-wide ආශ්‍රිත අධ්‍යයනය (GWAS) අරමුණු කරන්නේ විශේෂිත ගතිලක්ෂණ (ෆීනෝටයිප්) සමඟ සම්බන්ධ වන ප්‍රවේණි ප්‍රභේද (ප්‍රවේණික) හඳුනා ගැනීමයි. GWA අධ්‍යයනයන් මගින් පුද්ගලයන් විශාල සංඛ්‍යාවකගේ සම්පූර්ණ ජෙනෝමය හරහා ජානමය සලකුණු විමර්ශනය කරන අතර ජනගහන මට්ටමින් සංඛ්‍යානමය විශ්ලේෂණය මගින් ප්‍රවේණි-රූපී සංගම් පුරෝකථනය කරයි. සම්පූර්ණ-ප්‍රවේණි අනුපිළිවෙලට සියලුම ජානමය ප්‍රභේද සොයා ගත හැක. ෆීනෝටයිපික් දත්ත සමඟ සම්බන්ධ කිරීම, නවීන සත්ව/ශාක අභිජනනය ප්‍රබල ලෙස උපස්ථ කරන ෆීනෝටයිප් සම්බන්ධ SNPs, QTLs සහ අපේක්ෂක ජාන හඳුනා ගැනීමට GWAS සැකසිය හැක. SLAF යනු ස්වයං-සංවර්ධිත සරල කළ ප්‍රවේණි අනුක්‍රමික උපාය මාර්ගයකි, එය ජෙනෝමය පුරා බෙදා හරින ලද සලකුණු, SNP සොයා ගනී. මෙම SNPs, අණුක ජානමය සලකුණු ලෙස, ඉලක්කගත ගතිලක්ෂණ සමඟ ආශ්‍රිත අධ්‍යයනයන් සඳහා සැකසිය හැක. එය සංකීර්ණ ගති ලක්ෂණ ආශ්‍රිත ප්‍රවේණික විචලනයන් හඳුනාගැනීමේ ලාභදායී උපාය මාර්ගයකි.
-
නැනෝපෝර් පූර්ණ-දිග පිටපත් කිරීම
ජීවීන්ගේ සංකීර්ණ සහ විචල්‍ය විකල්ප සමස්ථානික ජාන ප්‍රකාශනය සහ ප්‍රෝටීන් විවිධත්වය නියාමනය කිරීම සඳහා වැදගත් ජාන යාන්ත්‍රණයකි. පිටපත් ව්‍යුහයන් නිවැරදිව හඳුනා ගැනීම ජාන ප්‍රකාශන නියාමන රටා ගැඹුරින් අධ්‍යයනය කිරීම සඳහා පදනම වේ. නැනෝපෝර් අනුක්‍රමික වේදිකාව සාර්ථකව පිටපත් අධ්‍යයනය සමස්ථානික මට්ටමට ගෙන එයි. මෙම විශ්ලේෂණ වේදිකාව නිර්මාණය කර ඇත්තේ නැනෝපෝර් වේදිකාවේ ජනනය කරන ලද RNA-Seq දත්ත සමුද්දේශ ප්‍රවේණික පදනම මත විශ්ලේෂණය කිරීම සඳහා වන අතර එමඟින් ජාන මට්ටම සහ පිටපත් මට්ටම යන දෙකෙහිම ගුණාත්මක හා ප්‍රමාණාත්මක විශ්ලේෂණයන් සිදු වේ.
-
circ-RNA
චක්‍ර RNA (circRNA) යනු කේතීකරණය නොවන RNA වර්ගයකි, ඒවා සංවර්ධනය, පාරිසරික ප්‍රතිරෝධය යනාදිය සම්බන්ධ නියාමන ජාල වල වැදගත් කාර්යභාරයක් ඉටු කරන බව මෑතකදී සොයා ගන්නා ලදී. රේඛීය RNA අණු වලින් වෙනස්, උදා mRNA, lncRNA, 3′ සහ 5′ CircRNA හි කෙළවර එකට එකතු වී වෘත්තාකාර ව්‍යුහයක් සාදයි, එමඟින් ඒවා exonuclease ජීර්ණයෙන් ආරක්ෂා වන අතර වැඩි වේ. බොහෝ රේඛීය RNA වලට වඩා ස්ථායී වේ. CircRNA ජාන ප්‍රකාශනය නියාමනය කිරීමේදී විවිධ ක්‍රියාකාරකම් ඇති බව සොයාගෙන ඇත. CircRNA හට miRNA ස්පොන්ජ් ලෙස හඳුන්වන miRNA තරඟකාරී ලෙස බැඳ තබන ceRNA ලෙස ක්‍රියා කළ හැක. CircRNA අනුක්‍රමික විශ්ලේෂණ වේදිකාව CircRNA ව්‍යුහය සහ ප්‍රකාශන විශ්ලේෂණය, ඉලක්ක පුරෝකථනය සහ අනෙකුත් RNA අණු සමඟ ඒකාබද්ධ විශ්ලේෂණය බල ගන්වයි
-
BSA
තොග වෙන් කරන ලද විශ්ලේෂණ වේදිකාව එක්-පියවර සම්මත විශ්ලේෂණයකින් සහ අභිරුචිකරණය කළ පරාමිති සැකසුම සහිත උසස් විශ්ලේෂණයකින් සමන්විත වේ. BSA යනු ෆීනෝටයිප් ආශ්‍රිත ප්‍රවේණි සලකුණු ඉක්මනින් හඳුනා ගැනීමට භාවිතා කරන තාක්‍ෂණයකි. BSA හි ප්‍රධාන කාර්ය ප්‍රවාහයේ අඩංගු වන්නේ: 1. අතිශයින් ප්‍රතිවිරුද්ධ ෆීනෝටයිප් සහිත පුද්ගලයන් කණ්ඩායම් දෙකක් තෝරා ගැනීම; 2. DNA තොග දෙකක් සෑදීම සඳහා සියලුම පුද්ගලයන්ගේ DNA, RNA හෝ SLAF-seq (Biomarker විසින් සංවර්ධනය කරන ලදී) එකතු කිරීම; 3. යොමු ජෙනෝමයට එරෙහිව අවකල අනුක්‍රම හඳුනා ගැනීම හෝ ඒ අතර, 4. ED සහ SNP-දර්ශක ඇල්ගොරිතම මගින් අපේක්ෂක සම්බන්ධිත කලාප පුරෝකථනය කිරීම; 5. අපේක්ෂක කලාපවල ජාන පිළිබඳ ක්‍රියාකාරී විශ්ලේෂණය සහ සුපෝෂණය යනාදිය. ජාන සලකුණු පිරික්සීම සහ ප්‍රාථමික සැලසුම් ඇතුළු දත්තවල වඩාත් දියුණු කැණීම් ද පවතී.
-
ඇම්ප්ලිකන් (16S/18S/ITS)
Amplicon (16S/18S/ITS) වේදිකාව සංවර්ධනය කර ඇත්තේ ක්ෂුද්‍රජීවී විවිධත්ව ව්යාපෘති විශ්ලේෂණයේ වසර ගණනාවක පළපුරුද්ද සමඟින්, එහි ප්‍රමිතිගත මූලික විශ්ලේෂණය සහ පුද්ගලාරෝපිත විශ්ලේෂණය අඩංගු වේ: මූලික විශ්ලේෂණය වත්මන් ක්ෂුද්‍රජීවී පර්යේෂණවල ප්‍රධාන ධාරාවේ විශ්ලේෂණ අන්තර්ගතය ආවරණය කරයි, විශ්ලේෂණ අන්තර්ගතය පොහොසත් සහ විස්තීර්ණ වේ. සහ විශ්ලේෂණ ප්රතිඵල ව්යාපෘති වාර්තා ආකාරයෙන් ඉදිරිපත් කරනු ලැබේ; පුද්ගලාරෝපිත විශ්ලේෂණයේ අන්තර්ගතය විවිධාකාර වේ. පුද්ගලාරෝපිත අවශ්‍යතා සාක්ෂාත් කර ගැනීම සඳහා මූලික විශ්ලේෂණ වාර්තාව සහ පර්යේෂණ අරමුණ අනුව නියැදි තෝරා ගත හැකි අතර පරාමිති නම්‍යශීලීව සැකසිය හැක. වින්ඩෝස් මෙහෙයුම් පද්ධතිය, සරල සහ වේගවත්.
-
පරිණාමීය ජාන විද්යාව
පරිණාමීය ජාන විද්යාව යනු SNPs, InDels, SVs, සහ CNVs ඇතුළුව ජානමය වෙනස්කම් මත පදනම්ව, විශාල පුද්ගලයින් පිරිසක් තුළ පරිණාමය පිළිබඳ තීක්ෂ්ණාත්මක අර්ථකථනයක් ලබා දීම සඳහා නිර්මාණය කර ඇති විස්තීරණ අනුක්‍රමික සේවාවකි. ජනගහන ව්‍යුහය, ජාන විවිධත්වය සහ ෆයිලොජෙනටික් සම්බන්ධතා තක්සේරු කිරීම ඇතුළුව, ජනගහනයේ පරිණාමීය මාරුවීම් සහ ජානමය ලක්ෂණ පැහැදිලි කිරීමට අවශ්‍ය සියලුම අත්‍යවශ්‍ය විශ්ලේෂණ මෙම සේවාවට ඇතුළත් වේ. එපමනක් නොව, එය ඵලදායී ජනගහන ප්‍රමාණය සහ අපසරන කාලය පිළිබඳ ඇස්තමේන්තු සක්‍රීය කරමින් ජාන ප්‍රවාහය පිළිබඳ අධ්‍යයනයන් වෙත යොමු කරයි. පරිණාමීය ප්‍රවේණි විද්‍යා අධ්‍යයනයන් විශේෂවල මූලාරම්භය සහ අනුවර්තනයන් පිළිබඳ වටිනා අවබෝධයක් ලබා දෙයි.
BMKGENE හි දී, අපි විශාල ජනගහනයක් මත පරිණාමීය ප්‍රවේණික අධ්‍යයනයන් සිදු කිරීම සඳහා මාර්ග දෙකක් පිරිනමන්නෙමු: සම්පූර්ණ-ප්‍රවේණි අනුක්‍රමය (WGS) භාවිතා කිරීම හෝ අඩු කරන ලද නියෝජන ප්‍රවේණි අනුක්‍රමික ක්‍රමයක් තෝරා ගැනීම, අභ්‍යන්තර-සංවර්ධිත විශේෂිත-ලොකස් ඇම්ප්ලිෆයිඩ් ෆ්‍රාග්මන්ට් (SLAF). WGS කුඩා ජෙනෝම වලට ගැලපෙන අතර, SLAF දිගු ජෙනෝම සහිත විශාල ජනගහනයක් අධ්‍යයනය කිරීම සඳහා පිරිවැය-ඵලදායී විකල්පයක් ලෙස මතු වේ, ඵලදායී ලෙස අනුක්‍රමික පිරිවැය අවම කරයි.
