Anter එක්-නැවතුම් විසඳුමක බහු අනුක්රමික ආකෘති සේවා ඒකාබද්ධ කිරීම:
ජෙනෝම් ප්රමාණය තක්සේරු කිරීම සඳහා inlumina සමඟ ජෙනෝම් සමීක්ෂණය සහ පසුව පියවර ගෙන ඒම;
දිගු කියවීමේ අනුක්රමයඩි නවෝසංක්ෂිප්ත එකලස් කිරීම;
සයි-සී වර්ණදේහ නැංගුරම් දැමීම සඳහා අනුක්රැප් කිරීම;
යානා විවරණය කිරීම සඳහා එම්ආර්එන්ඒ අනුක්රමණය කිරීම;
එක්රැස්වීම වලංගු කිරීම.
Firecy උනන්දුවක් දක්වන විශේෂ සඳහා පවත්නා යොමු ජාන නිපදවන නව ජාන සකස් කිරීම හෝ වැඩි දියුණු කිරීම සඳහා සුදුසු සේවාව.
අනුක්රමික වේදිකා සහ ජෛව තොරතුරු තාක්ෂණයේ සංවර්ධනයඩි නවෝජෙනෝම් එකලස් කිරීම
(අමරසිංහ එස්එල් සහ වෙනත්.,ජෙනේම් ජීව විද්යාව, 2020)
●පුළුල් විශේෂ ise තාව සහ ප්රකාශන වාර්තාව: බී.එම්.කේ.ජන් ඩිප්ලොයිඩ් ජෙනෝම් සහ බහු සංකීර්ණ බහු සංකීර්ණ හා ඇල්ලෝපොලොලයිට් විශේෂ ද ඇතුළුව විවිධ විශේෂවල උසස් තත්ත්වයේ ජාතීන් එක්රැස්වීමේ දැවැන්ත අත්දැකීම් සමූහයක් රැස් කර ගෙන තිබේ. 2018 සිට, අපි ඒ සඳහා දායක වී සිටිමුඉහළ බලපෑම් ප්රකාශන 300 ක් වන අතර ඒවායින් 20+ සොබාදහම ජාන විද්යාව තුළ ප්රකාශයට පත් කෙරේ.
● එක්-නැවතුම් විසඳුමක්: අපගේ ඒකාබද්ධ ප්රවේශය බහු අනුක්රමික තාක්ෂණයන් සහ ජෛව තොරතුරු තාක්ෂණ විශ්ලේෂණයන් සමග ජුවිනෝමය මූලාශ්ර විශ්ලේෂණයන් ඒකාබද්ධ කරමින් උසස් තත්ත්වයේ එක්රැස් කළ හැකි ජෙනෝමය ලබා දෙයි.
●ඔබේ අවශ්යතාවන්ට ගැලපෙන පරිදි: අපගේ සේවා කාර්ය ප්රවාහය අභිරුචිකරණය කළ හැකි අතර, විවිධාකාර අංග සහ විශේෂිත පර්යේෂණ අවශ්යතා සහිත ජාන සඳහා අනුවර්තනය වීමට ඉඩ සලසයි. යෝධ ජෙනෝෂ්, පොලිප්ලොලොයිඩ් ජාන, අතිශයින්ම විෂමජාසිචාශීය ජානමය හා තවත් බොහෝ දේ මෙයට ඇතුළත් වේ.
●ඉහළ දක්ෂ ජෛව තොරතුරු හා කම්කරු කණ්ඩායම: සංකීර්ණ ජෙනෝම් එක්රැස්වීම් සහ පේටන්ට් බලපත්ර සහ මෘදුකාංග ප්රකාශන ලිපි මාලාවක් සහ පේටන්ට් බලපත්ර සහ මෘදුකාංග ප්රකාශන මාලාවක් පිළිබඳ පර්යේෂණාත්මක හා ජෛව තොරතුරු කලාපයේ විශාල අත්දැකීමක් සමඟ.
●පශ්චාත් විකුණුම් සහාය:අපගේ කැපවීම මාස 3 ක විකුණුම් සේවා කාලයක් සමඟ ව්යාපෘතිය නිම කිරීමෙන් ඔබ්බට විහිදේ. මෙම කාලය තුළ, ප්රති .ල හා සම්බන්ධ ඕනෑම විමසුමක් විසඳීම සඳහා අපි ව්යාපෘති පසු විපරම්, දෝශ නිරාකරණ ආධාර සහ ප්රශ්න හා සැසිවාර ඉදිරිපත් කරමු.
ජෙනේම් සමීක්ෂණය | ජෙනෝම් එකලස් කිරීම | වර්ණදේහ මට්ටම | ජෙනෝමය විවරණය |
50x ඉලුමිනා නවසීක් PE150
| 30x පැක්බියෝ සීසීඑස් හයිෆි කියවයි | 100X Hi-c | Rna-seq inumina pe150 10 GB + (අත්යවශ්ය නොවේ) සම්පූර්ණ දිග rna-seq pacbio 40 gb හෝ නැනෝපෝර් 12 ජීබී |
ජෙනියම් සමීක්ෂණය සඳහා, ජෙනෝම් එකලස් කිරීම සහ හයි-සී එක්රැස්වීම සඳහා:
පටක හෝ උපුටා ගත් න්යෂ්ටික අම්ල | ජෙනේම් සමීක්ෂණය | පැක්බියෝ සමඟ ජෙනෝම් එකලස් කිරීම | හායි-සී එක්රැස්වීම |
සත්ව වීසෙරා | 0.5-1 g
| 3.3 ග්රෑම් 3.5 | ≥2 g |
සත්ව මාංශ පේශි | ≥ 5 g | ||
ක්ෂීරපායී රුධිරය | 1.5 මිලි
| ≥ 5 මිලි | ≥2 ml |
කුකුළු මස් / මාළු රුධිරය | ≥ 0.5 මිලි | ||
ශාක- නැවුම් කොළ | 1-2 g | ≥ 5 g | ≥ 4 g |
සංස්කෘතික සෛල |
| ≥ 1x108 | ≥ 1x107 |
කෘමීන් | 0.5-1 g | ≥ 3 g | ≥ 2 g |
උපුටා ගත් ඩීඑන්ඒ | සාන්ද්රණය: ≥1 ng / μl මුදල ≥ 30 ng සීමිත හෝ පිරිහීමක් හෝ අපවිත්ර වීමක් නොමැත | සාන්ද්රණය: ≥ 50 ng / μl මුදල: 10 μg / ප්රවාහ සෛල / නියැදිය OD260 / 280 = 1.7-2.2 OD260 / 230 = 1.8-2.5 සීමිත හෝ පිරිහීමක් හෝ අපවිත්ර වීමක් නොමැත |
-
|
යකඩ වික්රමය සමඟ ජෙනියම් විවරය සඳහා:
පටක හෝ උපුටා ගත් න්යෂ්ටික අම්ල | ඉලුමිනා පිටපත් කිරීම | පැක්බියෝ පිටපත් කිරීම | නැනෝපෝර් පිටපත් කිරීම |
ශාක- මූල / කඳ / පෙටල් | 450 mg | 600 mg | |
ශාක - කොළ / බීජ | 300 mg | 300 mg | |
ශාකය - පළතුරු | 1.2 උ | 1.2 උ | |
සත්ව හෘදය / අන්තරාය | 300 mg | 300 mg | |
සත්ව දෘශ්ය / මොළය | 240 mg | 240 mg | |
සත්ව මාංශ පේශි | 450 mg | 450 mg | |
සත්ව අස්ථි / හිසකෙස් / සම | 1 ග්රෑම් | 1 ග්රෑම් | |
ආත්රපෝඩ් - කෘමීන් | 6 | 6 | |
ආත්රපෝඩ් --crustaecacea | 300 mg | 300 mg | |
සම්පූර්ණ රුධිරය | 1 නල | 1 නල | |
උපුටා ගත් ආර්එන්ඒ | සාන්ද්රණය: ≥ 20 ng / μl මුදල ≥ 0.3 μg OD260 / 280 = 1.7-2.5 OD260 / 230 = 0.5-2.5 රින්≥ 6 5≥28s / 18s≥1 | සාන්ද්රණය: ≥ 100 ng / μl මුදල ≥ 0.75 μg OD260 / 280 = 1.7-2.5 OD260 / 230 = 0.5-2.5 රින්8 8 5≥28s / 18s≥1 | සාන්ද්රණය: ≥ 100 ng / μl මුදල ≥ 0.75 μg OD260 / 280 = 1.7-2.5 OD260 / 230 = 0.5-2.5 රින්7. 5 7.5 5≥28s / 18s≥1 |
කන්ටේනරය: 2 ml කේන්ද්රීය නල (ටින් තීරු නිර්දේශ නොකරයි)
(බොහෝ සාම්පල සඳහා, අපි නැවත එතනෝල් තුළ ආරක්ෂා නොකිරීමට අපි නිර්දේශ කරමු.)
නියැදි ලේබල් කිරීම: සාම්පල පැහැදිලිව ලේබල් කර ඇති අතර ඉදිරිපත් කරන ලද නියැදි තොරතුරු පෝරමයට සමාන විය යුතුය.
නැව්ගත කිරීම: වියළි-අයිස්: සාම්පල පළමුව බෑග්වල ඇසුරුම් කළ යුතු අතර වියළි අයිස්වල වළලනු ලැබේ.
සම්පූර්ණ ජෛව තොරතුරු තාක්ෂණ විශ්ලේෂණය, පියවර 4 කින් වෙන් කර ඇත:
1) එන්ජීඑස් කියවන K-FER විශ්ලේෂණය මත පදනම්ව ජෙනෝම් සමීක්ෂණය:
ජෙනෝම් ප්රමාණය තක්සේරු කිරීම
හීටරෝසෙගොසයිටි ඇස්තමේන්තු කිරීම
පුනරාවර්තන කලාපවල ඇස්තමේන්තුව
2) පැක්බියෝ හයිෆි සමඟ ජෙනියම් එකලස් කිරීම:
ඩි නවෝඑකලස් කිරීම
එකලස් කිරීමේ තක්සේරුව: ජෙනෝමය සම්පූර්ණ කිරීම සඳහා සහ එන්.ජී.එස්. පිටුපසට සිතියම්ගත කිරීම සඳහා බුස්කෝ විශ්ලේෂණය ඇතුළුව
3) හයි-සී එක්රැස්වීම:
HI-C Simxy QC: වලංගු Hi-c අන්තර්ක්රියා ඇස්තමේන්තු කිරීම
හයි-සී එකලස් කිරීම: කණ්ඩායම් වශයෙන් සංක්ෂිප්තව පොළඹවා ගැනීම, එක් එක් කණ්ඩායම තුළ අනුබල දීම සහ බලස්තාව දිශානතිය පැවරීම
Hi-c ඇගයීම
4) ජානමය විවරණය:
කේතී නොගෙන ආර්එන්ඒ පුරෝකථනය
පුනරාවර්තන අනුපිළිවෙල හඳුනා ගැනීම (ට්රාන්ස්පොෂූන්ස් සහ ටැන්ඩම් පුනරාවර්තනයන්)
ජාන අනාවැකි
§ඩි නවෝ: AB ආරම්භක ඇල්ගොරිතම
Sommer සමජාතීයතාව මත පදනම්ව
Yes est අක්ෂර වින්යාසය මත පදනම්ව, දිගු හා කෙටි කියවීම් සහිත: කියවීම් වේඩි නවෝකෙටුම්පත් ජෙනෝෆෝට් එකලස් කිරීම හෝ සිතියම් ගත කිරීම
You බහු දත්ත සමුදායන් සහිත පුරෝකථනය කරන ලද ජාන විවරණය කිරීම
1) ජෙනේම් සමීක්ෂණය - K-MER විශ්ලේෂණය
2) ජෙනියම් එක්රැස්වීම
2) ජෙනියම් එකලස් කිරීම - පැක්බියෝ හයිෆි කෙටුම්පත් එකලස් කිරීම සඳහා සිතියම්ගත කිරීම කියවයි
2) හයි-සී එකලස් කිරීම - හයි-සී වලංගු අන්තර්ක්රියා යුගල ඇස්තමේන්තු කිරීම
3) හයි-සී පශ්චාත් එකලස් කිරීමේ ඇගයීම
4) ජෙනියම් විවරණය - පුරෝකථනය කරන ලද ජාන ඒකාබද්ධ කිරීම
4) ජානමය විවරණය - පුරෝකථනය කරන ලද ජාන විවරණය
කැටයම් ප්රකාශන එකතුවක් හරහා BMKgene හි ඩි ඩි නාමික එකලස් කිරීමේ සේවාවන් සඳහා පහසුකම් සපයන දියුණුව ගවේෂණය කරන්න:
LI, C. සහ වෙනත් අල්. (2021) 'ජෙනෝමය අනුපිළිවෙල ගෝලීය විසුරුවා හරින මාර්ග හෙළි කරන අතර මුහුදු අශ්වයන් පරිණාමයේ අභිසාරී ජාන අනුවර්තනයන් යෝජනා කරයි', සොබාදහම් සන්නිවේදනය, 12 (1). ඩෝයි: 10.1038 / S41467-021-21379-X.
Li, y. et අල්. (2023) 'මහා පරිමාණ වර්ණදේහ වෙනස්කම්, ජානමය මට්ටමේ ප්රකාශිත වෙනස් කිරීම්, පාරිසරික (BOS පෙරලියන්ගේ), අණුක ජීව විද්යාව සහ පරිණාමය, 40 (1). doi: 10.1093 / molbev / msad006.
ටියාන්, ටී සහ වෙනත් අල්. (2023) 'සොබාදහමේ ජාන විද්යාව 2023 55: 3, 55 (3), පි. 496-506, පි. ඩෝයි: 10.1038 / S41588-023-01297-Y.
ෂැං, එෆ්. සහ වෙනත් අල්. (2023) 'ට්රොපේන් ඇල්කොලොයිඩ් ජෛව තුනීවල පරිණාමය හෙළි කිරීම සොලනාසී පවුලේ 2023 14: 1, 14 (1), පි. 1-18 පි. ඩෝයි: 10.1038 / s41467-023713733-4.
අභියෝගාත්මක සිද්ධි අධ්යයන:
ටෙලෝමෙරේ සිට ටෙලමියර් එක්රැස්වීම:ෆු, ඒ. වෙනත් අය. (2023) ටෙලර් කොමඩු (මොමෝර්ඩිකා චරන්ටිය එල්. doi: 10.1093 / hr / uhac228.
හැප්ලොටිඩේ එකලස් කිරීම:හූ, ඩබ්ලිව්. සහ වෙනත් අල්. (2021) 'ඇලෙලා-නිර්වචනය කරන ලද ජෙනෝවක අණුක බලාගාරය, 14 (6), පි. 851-854 පි. ඩෝයි: 10.1016 / J.molp.202.04.009.
යෝධ ජෙනෝම් එකලස් කිරීම:යුවාන්, ජේ. සහ වෙනත් අල්. (2022) 'ගිගා-වර්ණදේනවල ජෙනෝම සහ ගිගා-ජෙනෝයි ගිගා-ජෙනෝයි, සොබාදහමේ සන්නිවේදන 2022: 1, 13 (1), පි. 1-16 පි. ඩෝයි: 10.1038 / S41467-022235063-1.
පොලිප්ලොයිඩ් ජෙනෝම් එකලස් කිරීම:ෂැං, ප්රශ්නය - සහ වෙනත් අල්. (2022) 'මෑතදී ඔටෝපොලොයිඩ් උක් සරුකර් ස්පොකියුනියම්', නේචර් ජාන විද්යාව 2025: 6, 54 (6), පි. 885-896 පි. ඩෝයි: 10.1038 / S41588-022-01084-1.