යොමු නොවන mRNA අනුක්‍රමණය-NGS
විශේෂාංග
● පුස්තකාලය සකස් කිරීමට පෙර බහු mRNA ග්‍රහණය කර ගැනීම
● ඕනෑම යොමු ජෙනෝමයකින් ස්වාධීන: පිටපත්වල de novo එකලස් කිරීම මත පදනම්ව, බහු දත්ත සමුදායන් (NR, Swiss-Prot, COG, KOG, eggNOG, Pfam, GO, KEGG) සමඟින් සටහන් කර ඇති යුනිජීන ලැයිස්තුවක් ජනනය කිරීම
● ජාන ප්‍රකාශනය සහ පිටපත් ව්‍යුහය පිළිබඳ සවිස්තරාත්මක ජෛව තොරතුරු විශ්ලේෂණය
සේවා වාසි
●පුළුල් විශේෂඥතාව: BMKGENE හි සාම්පල 600,000කට අධික ප්‍රමාණයක් සැකසීමේ වාර්තාවක් සමඟින්, සෛල සංස්කෘතීන්, පටක සහ ශරීර තරල වැනි විවිධ නියැදි වර්ග විහිදුවමින්, අපගේ කණ්ඩායම සෑම ව්‍යාපෘතියකටම අත්දැකීම් සම්භාරයක් ගෙන එයි. අපි විවිධ පර්යේෂණ වසම්වල mRNA-Seq ව්‍යාපෘති 100,000කට වඩා සාර්ථකව වසා දමා ඇත.
●දැඩි තත්ත්ව පාලනය: අපි නියැදි සහ පුස්තකාල සැකසීමේ සිට අනුක්‍රමණය කිරීම සහ ජෛව තොරතුරු විද්‍යාව දක්වා සියලුම අදියරයන් හරහා මූලික පාලන ලක්ෂ්‍ය ක්‍රියාත්මක කරමු. මෙම සුපරික්ෂාකාරී අධීක්‍ෂණය අඛණ්ඩව උසස් තත්ත්වයේ ප්‍රතිඵල ලබා දීම සහතික කරයි.
● සවිස්තරාත්මක විවරණයක්: අපි වෙනස් ලෙස ප්‍රකාශිත ජාන (DEGs) ක්‍රියාකාරීව විවරණය කිරීමට සහ අනුරූප සුපෝෂන විශ්ලේෂණය සිදු කිරීමට බහු දත්ත සමුදායන් භාවිතා කරමු, පිටපත් කිරීමේ ප්‍රතිචාරයට පාදක වන සෛලීය සහ අණුක ක්‍රියාවලීන් පිළිබඳ අවබෝධයක් ලබා දෙන්නෙමු.
●අලෙවියෙන් පසු සහාය: අපගේ කැපවීම ව්‍යාපෘති නිම කිරීමෙන් ඔබ්බට මාස 3ක අලෙවියෙන් පසු සේවා කාලයක් සමඟින් දීර්ඝ වේ. මෙම කාලය තුළ, අපි ව්‍යාපෘති පසු විපරම්, දෝශ නිරාකරණ සහාය, සහ ප්‍රතිඵලවලට අදාළ ඕනෑම විමසීමක් විසඳීමට ප්‍රශ්න සහ පිළිතුරු සැසි පිරිනමන්නෙමු.
නියැදි අවශ්‍යතා සහ භාරදීම
| පුස්තකාලය | අනුපිළිවෙල උපාය | නිර්දේශිත දත්ත | තත්ත්ව පාලනය |
| Poly A පොහොසත් | Illumina PE150 DNBSEQ-T7 | 6-10 Gb | Q30≥85% |
නියැදි අවශ්‍යතා:
නියුක්ලියෝටයිඩ:
| Conc.(ng/μl) | මුදල (μg) | පිරිසිදුකම | අඛණ්ඩතාව |
| ≥ 10 | ≥ 0.2 | OD260/280=1.7-2.5 OD260/230=0.5-2.5 සීමිත හෝ ප්‍රෝටීන් හෝ DNA දූෂණය ජෙල් මත නොපෙන්වයි. | පැල සඳහා: RIN≥4.0; සතුන් සඳහා: RIN≥4.5; 5.0≥28S/18S≥1.0; සීමිත හෝ මූලික උන්නතාංශයක් නොමැත |
● පැල:
මූල, කඳ හෝ පෙති: 450 mg
කොළ හෝ බීජ: 300 mg
පළතුරු: 1.2 ග්රෑම්
● සත්ව:
හදවත හෝ අන්ත්රය: 300 mg
අභ්යන්තර අවයව හෝ මොළය: 240 mg
මාංශ පේශි: 450 mg
අස්ථි, හිසකෙස් හෝ සම: 1g
● ආත්‍රපෝඩාවන්:
කෘමීන්: 6g
Crustacea: 300 mg
● සම්පූර්ණ රුධිරය: 1 නලයක්
● සෛල: 106 සෛල
නිර්දේශිත සාම්පල භාරදීම
බහාලුම්: 2 ml කේන්ද්රාපසාරී නළය (ටින් තීරු නිර්දේශ නොකරයි)
නියැදි ලේබල් කිරීම: සමූහ+ප්‍රතිනිර්මාණය උදා: A1, A2, A3; B1, B2, B3.
නැව්ගත කිරීම:
1. වියළි අයිස්: සාම්පල බෑග්වල අසුරා වියළි අයිස්වල තැන්පත් කළ යුතුය.
2. RNA ස්ථායී නල: RNA සාම්පල RNA ස්ථායීකරණ නලයෙන් වියළා ගත හැකිය (උදා: RNAstable®) සහ කාමර උෂ්ණත්වයේ දී නැව්ගත කළ හැක.
සේවා වැඩ ප්රවාහය
අත්හදා බැලීම් නිර්මාණය
සාම්පල භාරදීම
RNA නිස්සාරණය
පුස්තකාල ඉදිකිරීම
අනුපිළිවෙල
දත්ත විශ්ලේෂණය
අලෙවියෙන් පසු සේවා
ජෛව තොරතුරු
පිටපත් කිරීමේ එකලස් කිරීම සහ යුනිජීන් තේරීම
යුනිජීන් විවරණය
නියැදි සහසම්බන්ධය සහ ජීව විද්‍යාත්මක අනුරූ වල තක්සේරුව
වෙනස් ලෙස ප්‍රකාශිත ජාන (DEGs)
DEG වල ක්‍රියාකාරී විවරණ
DEG වල ක්‍රියාකාරී පොහොසත් කිරීම
සකස් කරන ලද ප්රකාශන එකතුවක් හරහා BMKGene හි යුකැරියෝටික් NGS mRNA අනුක්‍රමික සේවා මගින් පහසුකම් සපයන දියුණුව ගවේෂණය කරන්න.
Shen, F. et al. (2020) 'De novo පිටපත් කිරීමේ එකලස් කිරීම සහ Amur catfish (Silurus asotus) ගෝනඩ් වල ලිංගික-පක්ෂග්‍රාහී ජාන ප්‍රකාශනය', Genomics, 112(3), pp. 2603–2614. doi: 10.1016/J.YGENO.2020.01.026.
Zhang, C. et al. (2016) 'ළූණු වල බල්බ ඉදිමීම සහ සංවර්ධනය අතරතුර සුක්‍රෝස් පරිවෘත්තීය පිළිබඳ පිටපත් විශ්ලේෂණය (Allium cepa L.)', Frontiers in Plant Science, 7(සැප්තැම්බර්), පි. 212763. doi: 10.3389/FPLS.2016.01425/BIBTEX.
Zhu, C. et al. (2017) 'De novo එකලස් කිරීම, Sarcocheilichthys sinensis පිටපත සඳහා චරිත නිරූපණය සහ විවරණ', PLoS ONE, 12(2). doi: 10.1371/JOURNAL.PONE.0171966.
Zou, L. et al. (2021) 'De novo ට්‍රාන්ස්ක්‍රිප්ටෝම් විශ්ලේෂණය මගින් ලවණතා ආතතිය යටතේ Podocarpus macrophyllus හි ලුණු ඉවසීම පිළිබඳ අවබෝධයක් ලබා දේ', BMC ශාක ජීව විද්‍යාව, 21(1), 1-17 පිටු. doi: 10.1186/S12870-021-03274-1/FIGURES/9.
