Hi-C පදනම් වූ ක්‍රොමැටින් අන්තර්ක්‍රියා
සේවා විශේෂාංග
● PE150 සමඟ Illumina NovaSeq හි අනුපිළිවෙල.
● සේවාව සඳහා නිස්සාරණය කරන ලද න්‍යෂ්ටික අම්ල වෙනුවට පටක සාම්පල අවශ්ය වේ, formaldehyde සමඟ හරස් සම්බන්ධ කිරීමට සහ DNA-ප්‍රෝටීන් අන්තර්ක්‍රියා සංරක්ෂණය කිරීමට.
● Hi-C පරීක්‍ෂණයට බයෝටින් සමඟ ඇලෙන සුළු කෙළවර සීමා කිරීම සහ අවසන් කිරීම ඇතුළත් වන අතර ඉන් පසුව අන්තර්ක්‍රියා ආරක්ෂා කරමින් ප්‍රතිඵලයක් ලෙස මොට කෙළවර චක්‍රලේඛනය කිරීම ඇතුළත් වේ. DNA පසුව ස්ට්‍රෙප්ටාවිඩින් පබළු සමඟ පහළට ඇද, පසුව පුස්තකාලය සකස් කිරීම සඳහා පවිත්‍ර කරනු ලැබේ.
සේවා වාසි
●Optimal Restriction Enzyme Design: 93% දක්වා වලංගු අන්තර්ක්‍රියා යුගල සහිත විවිධ විශේෂවල ඉහළ Hi-C කාර්යක්ෂමතාවයක් සහතික කිරීම.
●පුළුල් ප්‍රවීණතා සහ ප්‍රකාශන වාර්තා:BMKGene හට විවිධ විශේෂ 800කින් සහ විවිධ පේටන්ට් බලපත්‍ර වලින් >2000 Hi-C අනුක්‍රමික ව්‍යාපෘති සමඟ විශාල අත්දැකීමක් ඇත. 900 ට වැඩි සමුච්චිත බලපෑම් සාධකයක් සහිත ප්‍රකාශිත සිද්ධි 100 කට වඩා.
●ඉහළ නිපුණතා සහිත ජෛව තොරතුරු කණ්ඩායම:Hi-C අත්හදා බැලීම් සහ දත්ත විශ්ලේෂණය සහ ස්වයං-සංවර්ධිත දෘශ්‍යකරණ දත්ත මෘදුකාංගයක් සඳහා අභ්‍යන්තර පේටන්ට් බලපත්‍ර සහ මෘදුකාංග ප්‍රකාශන හිමිකම් සමඟ.
●අලෙවියෙන් පසු සහාය:අපගේ කැපවීම ව්‍යාපෘති නිම කිරීමෙන් ඔබ්බට මාස 3ක අලෙවියෙන් පසු සේවා කාලයක් සමඟින් විහිදේ. මෙම කාලය තුළ, අපි ව්‍යාපෘති පසු විපරම්, දෝශ නිරාකරණ සහාය, සහ ප්‍රතිඵලවලට අදාළ ඕනෑම විමසීමක් විසඳීමට ප්‍රශ්න සහ පිළිතුරු සැසි පිරිනමන්නෙමු.
●විස්තීර්ණ විවරණයක්: අපි හඳුනාගත් වෙනස්කම් සහිත ජාන ක්‍රියාකාරී ලෙස විවරණය කිරීමට සහ බහු පර්යේෂණ ව්‍යාපෘති පිළිබඳ තීක්ෂ්ණ බුද්ධිය ලබා දෙමින් අනුරූප සුපෝෂන විශ්ලේෂණය සිදු කිරීමට බහු දත්ත සමුදායන් භාවිතා කරමු.
සේවා පිරිවිතර
| පුස්තකාලය | අනුක්‍රමික උපාය මාර්ගය | නිර්දේශිත දත්ත ප්‍රතිදානය | Hi-C සංඥා විභේදනය |
| Hi-C පුස්තකාලය | Illumina PE150 | ක්‍රොමැටින් ලූප්: 150x TAD: 50x | ක්‍රොමැටින් ලූප්: 10Kb TAD: 40Kb |
සේවා අවශ්යතා
| නියැදි වර්ගය | අවශ්ය ප්රමාණය |
| සත්ව පටක | ≥2 ග්රෑම් |
| සම්පූර්ණ රුධිරය | ≥2mL |
| දිලීර | ≥1g |
| ශාක - තරුණ පටක | 1g/aliquot, aliquotes 2-4 නිර්දේශිතයි |
| සංස්කෘතික සෛල | ≥1x107 |
පහත විශ්ලේෂණය ඇතුළත් වේ:
● අමු දත්ත QC;
● සිතියම්ගත කිරීම සහ Hi-C පුස්තකාලය QC: වලංගු අන්තර්ක්‍රියා යුගල සහ අන්තර්ක්‍රියා ක්ෂය ඝාතක (IDEs);
● Genome-wide Interaction Profiling: cis/trans විශ්ලේෂණය සහ Hi-C අන්තර්ක්‍රියා සිතියම;
● A/B මැදිරි බෙදාහැරීමේ විශ්ලේෂණය;
● TADs සහ chromatin loops හඳුනාගැනීම;
● සාම්පල අතර ත්‍රිමාණ ක්‍රොමැටින් ව්‍යුහ මූලද්රව්ය පිළිබඳ අවකල විශ්ලේෂණය සහ ආශ්‍රිත ජානවල අනුරූප ක්‍රියාකාරී විවරණ.
Cis සහ ට්‍රාන්ස් සමානුපාතික ව්‍යාප්තිය
සාම්පල අතර වර්ණදේහ අන්තර්ක්‍රියා වල තාප සිතියම
A/B මැදිරි ජෙනෝමය පුරා ව්‍යාප්තිය
ක්‍රොමැටින් ලූප වල ජෙනෝමය පුරා ව්‍යාප්තිය
TADs දෘශ්‍යකරණය
සකස් කරන ලද ප්‍රකාශන එකතුවක් හරහා BMKGene හි Hi-C අනුක්‍රමික සේවා මගින් පහසුකම් සපයන පර්යේෂණ දියුණුව ගවේෂණය කරන්න.
Meng, T. et al. (2021) 'සංසන්දනාත්මක ඒකාබද්ධ බහු-ඕමික්ස් විශ්ලේෂණයක් මගින් CA2 chordoma සඳහා නව ඉලක්කයක් ලෙස හඳුනා ගනී',ස්නායු-ඔන්කොලොජි, 23(10), පි. 1709-1722. doi: 10.1093/NEUONC/NOAB156.
Xu, L. et al. (2021) 'ත්‍රිමාණ අසංවිධානාත්මක කිරීම සහ ජෙනෝමය ප්‍රතිසංවිධානය කිරීම ඒකාබද්ධ Hi-C, Nanopore සහ RNA අනුක්‍රමණය මගින් NAFLD හි ව්‍යාධිජනකය පිළිබඳ අවබෝධයක් සපයයි',Acta Pharmaceutica Sinica B, 11(10), පි. 3150-3164. doi: 10.1016/J.APSB.2021.03.022.
