Genome-wide සංගම් විශ්ලේෂණය
කාර්ය ප්රවාහය
සේවා වාසි
●පුළුල් ප්‍රවීණතා සහ ප්රකාශන වාර්තා: GWAS හි සමුච්චිත අත්දැකීම් සහිතව, BMKGene ජනගහන GWAS පර්යේෂණයේ විශේෂ ව්‍යාපෘති සිය ගණනක් සම්පූර්ණ කර ඇති අතර, ලිපි 100කට වඩා ප්‍රකාශයට පත් කිරීමට පර්යේෂකයන්ට සහාය වූ අතර සමුච්චිත බලපෑම් සාධකය 500 දක්වා ළඟා විය.
● සවිස්තරාත්මක ජෛව තොරතුරු විශ්ලේෂණය: කාර්ය ප්‍රවාහයට SNP-ගුණාංග ආශ්‍රිත විශ්ලේෂණය, අපේක්ෂක ජාන කට්ටලයක් ලබා දීම සහ ඒවාට අනුරූප ක්‍රියාකාරී විවරණ ඇතුළත් වේ.
●ඉහළ කුසලතා සහිත ජෛව තොරතුරු කණ්ඩායම සහ කෙටි විශ්ලේෂණ චක්‍රය: උසස් ප්‍රවේණි විද්‍යා විශ්ලේෂණවල විශිෂ්ට පළපුරුද්දක් ඇති BMKGene කණ්ඩායම වේගවත් හැරවුම් කාලයකින් විස්තීරණ විශ්ලේෂණ ඉදිරිපත් කරයි.
●අලෙවියෙන් පසු සහාය:අපගේ කැපවීම ව්‍යාපෘති නිම කිරීමෙන් ඔබ්බට මාස 3ක අලෙවියෙන් පසු සේවා කාලයක් සමඟින් විහිදේ. මෙම කාලය තුළ, අපි ව්‍යාපෘති පසු විපරම්, දෝශ නිරාකරණ සහාය, සහ ප්‍රතිඵලවලට අදාළ ඕනෑම විමසීමක් විසඳීමට ප්‍රශ්න සහ පිළිතුරු සැසි පිරිනමන්නෙමු.
සේවා පිරිවිතර සහ අවශ්යතා
| අනුපිළිවෙලෙහි වර්ගය | නිර්දේශිත ජනගහන පරිමාණය | අනුපිළිවෙල උපාය | නියුක්ලියෝටයිඩ අවශ්යතා |
| සම්පූර්ණ ජෙනෝම අනුක්‍රමණය | සාම්පල 200 ක් | 10x | සාන්ද්‍රණය: ≥ 1 ng/ µL මුළු මුදල≥ 30ng සීමිත හෝ පිරිහීමක් හෝ දූෂණයක් නොමැත |
| විශේෂිත-ලොකස් ඇම්ප්ලිෆයිඩ් ෆ්‍රාග්මන්ට් (SLAF) | ටැග් ගැඹුර: 10x ටැග් ගණන: < 400 Mb: WGS නිර්දේශ කෙරේ < 1Gb: 100K ටැග් 1Gb > 2Gb: 300K ටැග් උපරිම ටැග් 500k | සාන්ද්‍රණය ≥ 5 ng/µL මුළු මුදල ≥ 80 ng නැනෝඩ්‍රොප් OD260/280=1.6-2.5 ඇගරෝස් ජෙල්: නැත හෝ සීමිත පිරිහීම හෝ දූෂණය
|
ද්රව්ය තෝරාගැනීම
විවිධ ප්‍රභේද, උප විශේෂ, ගොඩබිම්/ජාන බැංකු/මිශ්‍ර පවුල්/වන සම්පත්
විවිධ වර්ග, උප විශේෂ, ඉඩම් වර්ග
අර්ධ-සබ් පවුල/සම්පූර්ණ-සිබ් පවුල/වන සම්පත්
සේවා වැඩ ප්රවාහය
අත්හදා බැලීම් නිර්මාණය
සාම්පල භාරදීම
RNA නිස්සාරණය
පුස්තකාල ඉදිකිරීම
අනුපිළිවෙල
දත්ත විශ්ලේෂණය
අලෙවියෙන් පසු සේවා
පහත විශ්ලේෂණය ඇතුළත් වේ:
- Genome-wide සම්බන්ධ විශ්ලේෂණය: LM, LMM, EMMAX, FASTLMM ආකෘතිය
- අපේක්ෂක ජානවල ක්‍රියාකාරී විවරණ
SNP-trait Association analysis - Manhattan කුමන්ත්රණය
SNP-ගුණාංග සංගම් විශ්ලේෂණය - QQ කුමන්ත්රණය
සකස් කළ ප්රකාශන එකතුවක් හරහා BMKGene's de GWAS සේවාවන් මගින් පහසුකම් සපයන දියුණුව ගවේෂණය කරන්න:
Lv, L. et al. (2023) 'ජීනෝමය-පුළුල් සංගම් අධ්‍යයනයෙන් රේසර් ක්ලැම් සිනොනොවාකුලා කොන්ස්ට්‍රික්ටා හි ඇමෝනියා ඉවසීමේ ප්‍රවේණික පදනම පිළිබඳ අවබෝධය',ජලජීවී වගාව, 569, පි. 739351. doi: 10.1016/J.AQUACULTURE.2023.739351.
Li, X. et al. (2022) 'ෆොක්ස්ටේල් මෙනේරි ප්‍රවේශයන් 398 ක බහු-ඕමික්ස් විශ්ලේෂණය ගෘහස්ථකරණය, පරිවෘත්තීය ලක්ෂණ සහ ප්‍රති-ගිනි අවුලුවන බලපෑම් හා සම්බන්ධ ප්‍රවේණික කලාප හෙළි කරයි',අණුක ශාකය, 15(8), පිටු 1367-1383. doi: 10.1016/j.molp.2022.07.003.
Li, J. et al. (2022) 'නියඟ පරිසරයේ හල්ලස් යන්තම් ෆීනෝටයිප්ස් ජෙනෝම්-වයිඩ් ඇසෝසියේෂන් සිතියම්ගත කිරීම',ශාක විද්‍යාවේ මායිම්, 13, පි. 924892. doi: 10.3389/FPLS.2022.924892/BIBTEX.
Zhao, X. et al. (2021) 'Sulfotransferase සංකේතනය කරන GmST1, සෝයා බෝංචි මොසෙයික් වෛරස් වික්‍රියා G2 සහ G3 සඳහා ප්‍රතිරෝධය ලබා දෙයි',ශාක, සෛල සහ පරිසරය, 44(8), පිටු 2777-2792. doi: 10.1111/PCE.14066.
