条形බැනරය-03

නිෂ්පාදන

සංසන්දනාත්මක ජාන විද්යාව

සංසන්දනාත්මක ප්‍රවේණි විද්‍යාවට විවිධ විශේෂ අතර සමස්ත ජාන අනුපිළිවෙල සහ ව්‍යුහයන් පරීක්ෂා කිරීම සහ සංසන්දනය කිරීම ඇතුළත් වේ. මෙම ක්ෂේත්‍රය විවිධ ජීවීන් හරහා සංරක්‍ෂිත හෝ අපසාරී අනුක්‍රමික ව්‍යුහයන් සහ මූලද්‍රව්‍ය හඳුනා ගැනීමෙන් විශේෂවල පරිණාමය හෙළිදරව් කිරීමට, ජාන ක්‍රියාකාරකම් විකේතනය කිරීමට සහ ජාන නියාමන යාන්ත්‍රණයන් පැහැදිලි කිරීමට උත්සාහ කරයි. විස්තීර්ණ සංසන්දනාත්මක ප්‍රවේණි විද්‍යා අධ්‍යයනයක් ජාන පවුල්, පරිණාමීය සංවර්ධනය, සම්පූර්ණ-ප්‍රවේණි අනුපිටපත් සිදුවීම් සහ වරණීය පීඩනයේ බලපෑම වැනි විශ්ලේෂණ ඇතුළත් වේ.


සේවා විස්තර

Demo ප්‍රතිඵල

සිද්ධි අධ්‍යයනය

සේවා වාසි

1 සංසන්දනාත්මක-ප්‍රවේණි විද්‍යාව

පුළුල් ප්‍රවීණතා සහ ප්‍රකාශන වාර්තා: සමුච්චිත වීමත් සමඟ BMKGene විසින් සංසන්දනාත්මක ප්‍රවේණි විද්‍යා ව්‍යාපෘති 90කට අධික ප්‍රමාණයක් සම්පූර්ණ කර ඇති අතර සමුච්චිත බලපෑම් සාධකය 900 දක්වා ළඟා විය.

සවිස්තරාත්මක ජෛව තොරතුරු විශ්ලේෂණය: විශ්ලේෂණ පැකේජයේ බහුලව අවශ්‍ය වන විශ්ලේෂණ අට අඩංගු වන අතර, හොඳින් සැලසුම් කර ඇති ප්‍රකාශනයට සූදානම් සංඛ්‍යා සපයමින් ප්‍රතිඵල පහසුවෙන් අර්ථකථනය කිරීමට ඉඩ සලසයි.

ඉහළ කුසලතා සහිත ජෛව තොරතුරු කණ්ඩායම සහ කෙටි විශ්ලේෂණ චක්‍රය: සංසන්දනාත්මක ප්‍රවේණි විද්‍යා විශ්ලේෂණයේ විශිෂ්ට අත්දැකීම් ඇති BMKGene කණ්ඩායම කෙටි කාලයකදී විවිධ පුද්ගලාරෝපිත විශ්ලේෂණ ඉල්ලීම් ඉටු කරයි.

අලෙවියෙන් පසු සහාය:අපගේ කැපවීම ව්‍යාපෘති නිම කිරීමෙන් ඔබ්බට මාස 3ක අලෙවියෙන් පසු සේවා කාලයක් සමඟින් විහිදේ. මෙම කාලය තුළ, අපි ව්‍යාපෘති පසු විපරම්, දෝශ නිරාකරණ සහාය, සහ ප්‍රතිඵලවලට අදාළ ඕනෑම විමසීමක් විසඳීමට ප්‍රශ්න සහ පිළිතුරු සැසි පිරිනමන්නෙමු.

සේවා පිරිවිතර

ඇස්තමේන්තුගත හැරවුම් කාලය

විශේෂ ගණන

විශ්ලේෂණය කරයි

වැඩ කරන දින 30 යි

6 - 12

ජාන පවුල් පොකුරු

ජාන පවුලේ ව්යාප්තිය සහ හැකිලීම

Phylogenetic ගස් ඉදිකිරීම

අපසාරී කාලය ඇස්තමේන්තු (ෆොසිල ක්රමාංකනය අවශ්ය)

LTR ඇතුළත් කිරීමේ කාලය (ශාක සඳහා)

සම්පූර්ණ ජෙනෝම අනුපිටපත් කිරීම (ශාක සඳහා)

වරණීය පීඩනය

සංශ්ලේෂණ විශ්ලේෂණය

ජෛව තොරතුරු විශ්ලේෂණය

● ජාන ​​පවුල

● Phylogenetics

● අපසරන කාලය

● වරණීය පීඩනය

● Synteny විශ්ලේෂණය

流程图 සංසන්දනාත්මක ජාන විද්යාව

නියැදි අවශ්‍යතා සහ භාරදීම

නියැදි අවශ්‍යතා:

ජාන අනුක්‍රමණය සහ එකලස් කිරීම සඳහා පටක හෝ DNA

පටක සඳහා

විශේෂ

පටක

සමීක්ෂණය

PacBio CCS

සත්ව

අභ්යන්තර පටක

0.5 ~ 1 ග්රෑම්

≥ 3.5 ග්රෑම්

මාංශ පේශි පටක

≥ 5.0 ග්රෑම්

≥ 5.0 මිලි

ක්ෂීරපායී රුධිරය

≥ 0.5 මිලි

කුකුළු මස් / මාළු ලේ

පැලය

නැවුම් කොළ

1 ~ 2 ග්රෑම්

≥ 5.0 ග්රෑම්

 

පෙති / කඳ

1 ~ 2 ග්රෑම්

≥ 10.0 ග්රෑම්

 

මූල / බීජ

1 ~ 2 ග්රෑම්

≥ 20.0 ග්රෑම්

සෛල

සංස්කෘතික සෛලය

-

≥ 1 x 108

දත්ත

සමීපව සම්බන්ධ විශේෂවල ප්‍රවේණි අනුක්‍රමික ගොනු(.fasta) සහ විවරණ ගොනු (.gff3)

සේවා වැඩ ප්රවාහය

සාම්පල QC

අත්හදා බැලීම් නිර්මාණය

නියැදි බෙදා හැරීම

සාම්පල භාරදීම

පුස්තකාලය සකස් කිරීම

පුස්තකාල ඉදිකිරීම

අනුපිළිවෙල

අනුපිළිවෙල

දත්ත විශ්ලේෂණය

දත්ත විශ්ලේෂණය

අලෙවියෙන් පසු සේවා

අලෙවියෙන් පසු සේවා


  • පෙර:
  • ඊළඟ:

  • *මෙහි පෙන්වා ඇති ආදර්ශන ප්‍රතිඵල සියල්ල Biomarker Technologies සමඟ ප්‍රකාශිත ජෙනෝම වලින් වේ

    1.LTR ඇතුළු කිරීමේ කාලය ඇස්තමේන්තු කිරීම: අනෙකුත් විශේෂ හා සසඳන විට, වයිනිං රයි ජෙනෝමය තුළ LTR-RTs ඇතුළත් කිරීමේ වේලාවන්හි අද්විතීය ද්විමාධ්‍ය ව්‍යාප්තියක් රූපයේ දැක්වේ. මෑත කාලීන මුදුන වසර මිලියන 0.5 කට පමණ පෙර දර්ශනය විය.

    3LTR-ඇතුළත් කිරීමේ-කාලය-ඇස්තමේන්තුව-හි-වයිනිං-රයි

    Li Guang et al.,ස්වභාවික ජාන විද්යාව, 2021

     

     

    2.චායෝටේ (Sechium edule) මත Phylogeny සහ ජාන පවුල් විශ්ලේෂණය : chayote සහ ජාන පවුලේ අනෙකුත් ආශ්‍රිත විශේෂ 13 විශ්ලේෂණය කිරීමෙන්, Chayote සර්ප කරවිල (Trichosanthes anguina) සමඟ වඩාත් සමීප සම්බන්ධයක් ඇති බව සොයා ගන්නා ලදී. 27-45 Mya දී සර්ප කරවිල වලින් ලබාගත් Chayote සහ 25±4 Mya හි chayote හි සම්පූර්ණ ජෙනෝම අනුපිටපත් (WGD) නිරීක්ෂණය කරන ලදී, එය cucuibitaceae හි තුන්වන WGD සිදුවීම වේ.

    4 Phylogenetic-tree-of-chayote

    Fu A et al.,ගෙවතු වගා පර්යේෂණ, 2021

     

     

    3.Synteny විශ්ලේෂණය: පලතුරු වර්ධනයේ දී phytohormones සම්බන්ධ සමහර ජාන චයෝටේ, සර්ප කරවිල සහ ස්කොෂ් වල දක්නට ලැබේ. චයෝට් සහ ස්කොෂ් අතර සහසම්බන්ධය චයෝටේ සහ සර්ප කරවිල අතර ඇති සම්බන්ධතාවයට වඩා තරමක් වැඩි ය.

    4 Phylogenetic-tree-of-chayote

    Fu A et al.,ගෙවතු වගා පර්යේෂණ, 2021

     

     

    4.ජාන පවුල් විශ්ලේෂණය: G.thurberi සහ G.davidsonii ජෙනෝමවල ජාන පවුල් ව්‍යාප්තිය සහ හැකිලීම පිළිබඳ KEGG සුපෝෂණය මගින් ස්ටෙරොයිඩ් ජෛව සංස්ලේෂණය සහ බ්‍රැසිනොස්ටෙරොයිඩ් ජෛව සංස්ලේෂණය ආශ්‍රිත ජාන පුළුල් වී ඇති බව පෙන්නුම් කරයි.

    4 Phylogenetic-tree-of-chayote

    Yang Z et al.,BMC ජීව විද්යාව, 2021

     

     

    5.සම්පූර්ණ ප්‍රවේණි අනුපිටපත් විශ්ලේෂණය: 4DTV සහ Ks බෙදාහැරීමේ විශ්ලේෂණය සම්පූර්ණ ජෙනෝම අනුපිටපත් කිරීමේ සිදුවීම පෙන්වයි. අනුපිටපත් සිදුවීම් පෙන්නුම් කරන අන්තර් විශේෂවල මුදුන්. අන්තර් විශේෂවල උච්ච විශේෂ සිදුවීම් පෙන්වයි. විශ්ලේෂණයෙන් පෙන්නුම් කළේ සමීපව සම්බන්ධ අනෙකුත් විශේෂ තුන සමඟ සසඳන විට, O. europaea වඩාත් මෑතක දී මහා පරිමාණ ජාන අනුපිටපත් කිරීමකට ලක් වූ බවයි.

    4 Phylogenetic-tree-of-chayote

    රාඕ ජී සහ අල්.ගෙවතු වගා පර්යේෂණ, 2021

    BMK නඩුව

    කටු නැති රෝස: තෙතමනය අනුවර්තනයට සම්බන්ධ ජානමය තීක්ෂ්ණ බුද්ධිය

    ප්‍රකාශිත: ජාතික විද්‍යා සමාලෝචනය, 2021

    අනුපිළිවෙල උපාය:

    'බසිගේකටු නැති(ආර්.විචුරයිනන්) ජෙනෝමය:
    ආසන්න වශයෙන්. 93 X PacBio + දළ වශයෙන්. 90 X Nanopore + 267 X Illumina

    ප්රධාන ප්රතිඵල

    1.උසස් තත්ත්වයේ R.wichuraiana ජෙනෝමය තනන ලද්දේ දිගු-කියවන අනුක්‍රමික ක්‍රමවේදයන් භාවිතයෙන් වන අතර එමඟින් 530.07 Mb එකලස් කිරීමක් ලබා දෙයි (ඇස්තමේන්තුගත ජෙනෝම ප්‍රමාණය ප්‍රවාහ සයිටෝමිතිය මගින් 525.9 Mb සහ ජාන සමීක්ෂණය මගින් 525.5 Mb පමණ විය). Heterozygosity3% පමණ විය. BUSCO ඇස්තමේන්තුගත ලකුණු 93.9% කි. "Old blush" (haploOB) සමඟ සසඳන විට, මෙම ජෙනෝමයේ ගුණාත්මක භාවය සහ සම්පූර්ණත්වය පාදක තනි-පාදක නිරවද්‍යතාවය සහ LTR එකලස් කිරීමේ දර්ශකය (LAI=20.03) මගින් තහවුරු කරන ලදී. R.wichuraiana ජෙනෝමයේ ප්‍රෝටීන් කේතීකරණ ජාන 32,674 ක් අඩංගු වේ.

    2.Multi-omics ඒකාබද්ධ විශ්ලේෂණය, සංසන්දනාත්මක ජෙනොමික්ස්, ට්‍රාන්ස්ක්‍රිප්ටොමික්ස්, ප්‍රවේණික ජනගහනය පිළිබඳ QTL විශ්ලේෂණය, R. wichuraiana සහ Rosa chinensis අතර තීරණාත්මක විශේෂණය හෙළිදරව් කරන ලදී. එසේම, QTL හි අදාළ ජානවල ප්‍රකාශන විචලනය කඳේ කටු රටා සමඟ සම්බන්ධ වීමට ඉඩ ඇත.

    7KEGG-පොහොසත් කිරීම-ජාන-පවුල-ප්‍රසාරණය-සහ-හැකිලීම

    Basye;s Thornless සහ Rosa chinensis අතර සංසන්දනාත්මක ප්‍රවේණි විද්‍යාව විශ්ලේෂණය, සංශ්ලේෂණ විශ්ලේෂණය, ජාන පවුල් පොකුර, ප්‍රසාරණය සහ හැකිලීම විශ්ලේෂණය, රෝස මල් වල තීරණාත්මක ගති ලක්ෂණ වලට සම්බන්ධ විශාල වෙනස්කම් රාශියක් අනාවරණය කර ඇත. NAC සහ FAR1/FRS ජාන පවුලේ අද්විතීය ව්‍යාප්තිය කළු ලප වලට ප්‍රතිරෝධය සමඟ සම්බන්ධ වීමට බොහෝ දුරට ඉඩ තිබුණි.

    81BT-සහ-OB අතර සංසන්දනාත්මක-ජෙනොමික්ස්-විශ්ලේෂණ 82BT-සහ-OB අතර සංසන්දනාත්මක-ජෙනොමික්ස්-විශ්ලේෂණ 83BT-සහ-OB අතර සංසන්දනාත්මක-ජෙනොමික්ස්-විශ්ලේෂණ

    BT සහ haploOB ජාන අතර සංසන්දනාත්මක ජාන විද්‍යා විශ්ලේෂණය.

    යොමුව

    ෂොං, එම්., සහ අල්. "කුරුලෑ රහිත රෝස: තෙතමනය අනුවර්තනයට සම්බන්ධ ජානමය තීක්ෂ්ණ බුද්ධිය"ජාතික විද්‍යා සමාලෝචනය, 2021;, nwab092.

    උපුටා ගැනීමක් ලබා ගන්න

    ඔබගේ පණිවිඩය මෙහි ලියා අප වෙත එවන්න

    ඔබගේ පණිවිඩය අපට එවන්න: