BMKMANU S1000 අවකාශීය පිටපත
BMKMANU S1000 අවකාශීය පිටපත් කිරීමේ තාක්ෂණික යෝජනා ක්‍රමය
විශේෂාංග
● විභේදනය: 5 µM
● ලප විෂ්කම්භය: 2.5 µM
● ස්ථාන ගණන: ආසන්න වශයෙන් මිලියන 2ක්
● 3 හැකි ග්‍රහණ ප්‍රදේශ ආකෘති: 6.8 mm * 6.8 mm, 11 mm * 11 mm හෝ 15 mm * 20 mm
● සෑම තීරු කේතයක්ම කොටස් 4 කින් සමන්විත ප්‍රයිමර් වලින් පටවා ඇත:
mRNA ප්‍රාථමිකකරණය සහ cDNA සංස්ලේෂණය සඳහා පොලි(dT) වලිගය
විස්තාරණ නැඹුරුව නිවැරදි කිරීමට අද්විතීය අණුක හඳුනාගැනීම (UMI).
අවකාශීය තීරු කේතය
අර්ධ කියවීම 1 අනුක්‍රමික ප්‍රාථමිකයේ බන්ධන අනුපිළිවෙල
● H&E සහ කොටස්වල ප්‍රතිදීප්ත පැල්ලම්
● භාවිතා කිරීමට ඇති හැකියාවසෛල ඛණ්ඩනය කිරීමේ තාක්ෂණය: H&E staining, fluorescent staining, සහ RNA අනුක්‍රමණය ඒකාබද්ධ කිරීම එක් එක් සෛලයේ මායිම් තීරණය කිරීම සහ එක් එක් සෛලයට ජාන ප්රකාශනය නිවැරදිව පැවරීම.
BMKMANU S1000 හි වාසි
●උප සෛල විභේදනය: සෑම ග්‍රහණ ප්‍රදේශයකම > 2.5 µm ක විෂ්කම්භයක් සහ ස්ථාන මධ්‍යස්ථාන අතර 5 µm පරතරයක් සහිත අවකාශීය තීරු කේත සහිත ස්ථාන මිලියන 2 ක් අඩංගු වන අතර, උප-සෛලීය විභේදනය (5 µm) සමඟ අවකාශීය පිටපත් කිරීමේ විශ්ලේෂණය සක්‍රීය කරයි.
●බහු මට්ටමේ විභේදන විශ්ලේෂණය:ප්‍රශස්ත විභේදනයකදී විවිධ පටක ලක්ෂණ විසඳීම සඳහා 100 μm සිට 5 μm දක්වා වූ නම්‍යශීලී බහු මට්ටමේ විශ්ලේෂණය.
●"එක විනිවිදක තුනක්" භාවිතා කිරීමට ඇති හැකියාව Cell Segmentation තාක්ෂණය:එක් ස්ලයිඩයක් මත ප්‍රතිදීප්ත පැල්ලම්, H&E පැල්ලම් සහ RNA අනුක්‍රමණය ඒකාබද්ධ කරමින්, අපගේ "තුනෙන් එක" විශ්ලේෂණ ඇල්ගොරිතම පසුව සෛල මත පදනම් වූ පිටපත් කිරීම සඳහා සෛල මායිම් හඳුනාගැනීම බල ගන්වයි.
●බහු අනුක්‍රමික වේදිකා සමඟ අනුකූල වේ: NGS සහ දිගු-කියවන අනුපිළිවෙල දෙකම පවතී.
●1-8 ක්‍රියාකාරී ග්‍රහණ ප්‍රදේශයේ නම්‍යශීලී නිර්මාණය: ග්‍රහණ ප්‍රදේශයේ ප්‍රමාණය නම්‍යශීලී වන අතර, ආකෘති 3ක් භාවිතා කළ හැකිය (6.8 mm * 6.8 mm., 11 mm * 11 mm සහ 15 mm * 20 mm)
●එක්-නැවතුම් සේවාව: එය ක්‍රියෝ-කොටස් කිරීම, පැල්ලම් කිරීම, පටක ප්‍රශස්තකරණය, අවකාශීය තීරු කේතකරණය, පුස්තකාල සකස් කිරීම, අනුක්‍රමණය කිරීම සහ ජෛව තොරතුරු ඇතුළු සියලු අත්දැකීම් සහ කුසලතා මත පදනම් වූ පියවර ඒකාබද්ධ කරයි.
●විස්තීරණ ජෛව තොරතුරු සහ ප්‍රතිඵලවල පරිශීලක-හිතකාමී දෘශ්‍යකරණය:පැකේජයට විශ්ලේෂණ 29 ක් සහ උසස් තත්ත්වයේ සංඛ්‍යා 100+ ඇතුළත් වන අතර, සෛල බෙදීම සහ ස්ථාන පොකුරු දෘශ්‍යමාන කිරීමට සහ අභිරුචිකරණය කිරීමට අභ්‍යන්තරව දියුණු කරන ලද මෘදුකාංග භාවිතය සමඟ ඒකාබද්ධ වේ.
●අභිරුචිගත දත්ත විශ්ලේෂණය සහ දෘශ්‍යකරණය: විවිධ පර්යේෂණ ඉල්ලීම් සඳහා ලබා ගත හැකිය
●ඉහළ නිපුණතා සහිත තාක්ෂණික කණ්ඩායම: මානව, මීයන්, ක්ෂීරපායී, මාළු සහ ශාක ඇතුළු පටක වර්ග 250කට අධික ප්‍රමාණයක සහ විශේෂ 100+ ක අත්දැකීම් සහිතයි.
●සම්පූර්ණ ව්‍යාපෘතියේ තත්‍ය කාලීන යාවත්කාලීන: පර්යේෂණාත්මක ප්‍රගතියේ පූර්ණ පාලනය සහිතව.
●තනි සෛල mRNA අනුක්‍රමණය සමඟ විකල්ප ඒකාබද්ධ විශ්ලේෂණය
සේවා පිරිවිතර
|
නියැදිය අවශ්යතා
| පුස්තකාලය |
අනුපිළිවෙල උපාය
| නිර්දේශිත දත්ත | තත්ත්ව පාලනය |
| OCT-Embedded cryo සාම්පල, නියැදියකට වාරණ 3ක් | S1000 cDNA පුස්තකාලය | Illumina PE150 (වෙනත් වේදිකා තිබේ) | 100 uM සඳහා 100K PE කියවීම් (60-150 Gb) | RIN>7 |
නියැදි සකස් කිරීමේ මාර්ගෝපදේශය සහ සේවා කාර්ය ප්රවාහය පිළිබඳ වැඩි විස්තර සඳහා කරුණාකර කතා කිරීමට නිදහස් වන්න aBMKGENE විශේෂඥ
සේවා වැඩ ප්රවාහය
නියැදි සකස් කිරීමේ අදියරේදී, උසස් තත්ත්වයේ RNA ලබා ගත හැකි බව සහතික කිරීම සඳහා මූලික තොග RNA නිස්සාරණය කිරීමේ පරීක්ෂණයක් සිදු කරනු ලැබේ. පටක ප්‍රශස්තිකරණ අදියරේදී කොටස් පැල්ලම් සහ දෘශ්‍යමාන වන අතර පටක වලින් mRNA මුදා හැරීම සඳහා පාරගම්‍යතා තත්ත්වයන් ප්‍රශස්ත වේ. ප්‍රශස්තිකරණය කරන ලද ප්‍රොටෝකෝලය පුස්තකාල ඉදිකිරීමේදී යොදනු ලැබේ, පසුව අනුක්‍රමණය සහ දත්ත විශ්ලේෂණය සිදු කරයි.
සම්පූර්ණ සේවා කාර්ය ප්‍රවාහයට තත්‍ය කාලීන යාවත්කාලීන කිරීම් සහ ප්‍රතිචාරාත්මක ප්‍රතිපෝෂණ පුඩුවක් පවත්වා ගැනීම සඳහා සේවාලාභී තහවුරු කිරීම් ඇතුළත් වේ, සුමට ව්‍යාපෘති ක්‍රියාත්මක කිරීම සහතික කරයි.
BMKMANU S1000 විසින් ජනනය කරන ලද දත්ත "BSTMatrix" මෘදුකාංගය භාවිතයෙන් විශ්ලේෂණය කෙරේ, එය BMKGENE විසින් ස්වාධීනව නිර්මාණය කරන ලද, ජාන ප්රකාශන න්‍යාසයක් ජනනය කරයි. එතැන් සිට, දත්ත තත්ත්ව පාලනය, අභ්යන්තර නියැදි විශ්ලේෂණය සහ අන්තර් කණ්ඩායම් විශ්ලේෂණය ඇතුළත් සම්මත වාර්තාවක් ජනනය වේ.
● දත්ත තත්ත්ව පාලනය:
දත්ත ප්රතිදානය සහ ගුණාත්මක ලකුණු බෙදා හැරීම
එක් ස්ථානයකට ජාන හඳුනාගැනීම
පටක ආවරණය
● අභ්යන්තර-නියැදි විශ්ලේෂණය:
ජාන පොහොසත්කම
අඩු කළ මාන විශ්ලේෂණය ඇතුළුව ස්ථාන පොකුරු කිරීම
පොකුරු අතර අවකල ප්රකාශන විශ්ලේෂණය: සලකුණු ජාන හඳුනා ගැනීම
මාර්කර් ජානවල ක්‍රියාකාරී විවරණ සහ පොහොසත් කිරීම
● අන්තර් කණ්ඩායම් විශ්ලේෂණය:
සාම්පල දෙකෙන්ම ලප නැවත සංකලනය කිරීම (උදා. රෝගී සහ පාලනය) සහ නැවත පොකුරු
එක් එක් පොකුරු සඳහා සලකුණු ජාන හඳුනා ගැනීම
මාර්කර් ජානවල ක්‍රියාකාරී විවරණ සහ පොහොසත් කිරීම
කණ්ඩායම් අතර එකම පොකුරේ අවකල ප්රකාශනය
මීට අමතරව, BMKGENE විසින් සංවර්ධනය කරන ලද “BSTViewer” යනු පරිශීලක-හිතකාමී මෙවලමක් වන අතර එමඟින් විවිධ විභේදනවලදී ජාන ප්රකාශනය සහ ස්ථාන පොකුරු දෘශ්‍යමාන කිරීමට පරිශීලකයාට හැකි වේ.
BMKGene පරිශීලක හිතකාමී දෘශ්‍යකරණය සඳහා මෘදුකාංගයක් නිපදවන ලදී
BSTViewer බහු මට්ටමේ විභේදනයකින් ස්ථාන පොකුරු කිරීම
BSTCellViewer: ස්වයංක්‍රීය සහ අතින් සෛල බෙදීම
අභ්යන්තර-නියැදි විශ්ලේෂණය
ස්ථාන පොකුරු කිරීම:
මාර්කර් ජාන හඳුනාගැනීම සහ අවකාශීය ව්‍යාප්තිය:
අන්තර් කණ්ඩායම් විශ්ලේෂණය
කණ්ඩායම් දෙකෙන්ම දත්ත සංයෝජනය සහ නැවත පොකුරු:
නව පොකුරු වල සලකුණු ජාන:
මෙම විශේෂාංගගත ප්‍රකාශනයේ BMKManu S1000 තාක්ෂණය සමඟ BMKGene හි අවකාශීය පිටපත් කිරීමේ සේවාවන් මගින් පහසුකම් සපයන දියුණුව ගවේෂණය කරන්න:
ගීතය, X. et al. (2023) 'අභ්‍යවකාශ පිටපත් කිරීම තක්කාලි කෝලස් හි අංකුර ප්‍රතිජනනය ප්‍රවර්ධනය කිරීමට සම්බන්ධ ආලෝකය-ප්‍රේරිත ක්ලෝරෙන්චිමා සෛල හෙළි කරයි',ඇමරිකා එක්සත් ජනපදයේ ජාතික විද්‍යා ඇකඩමියේ ක්‍රියාදාමයන්, 120(38), පි. e2310163120. doi: 10.1073/pnas.2310163120
ඔබ, Y. et al. (2023) 'අනුපිළිවෙල පදනම් වූ අවකාශීය පිටපත් කිරීමේ ක්‍රම ක්‍රමානුකූලව සංසන්දනය කිරීම',bioRxiv, පි. 2023.12.03.569744. doi: 10.1101/2023.12.03.569744.
