De novo බැක්ටීරියා ජෙනෝම එකලස් කිරීම
අපි සම්පූර්ණ බැක්ටීරියා ජෙනෝම එකලස් කිරීමේ සේවාවක් සපයන අතර, 0 හිඩැස් සහතික කරමු. එකලස් කිරීම සඳහා Nanopore සහ PacBio වැනි දිගු-කියවන අනුක්‍රමික තාක්ෂණයන් සහ Illumina සමඟ කෙටි කියවීමේ අනුක්‍රමය එකලස් කිරීම වලංගු කිරීම සහ ONT කියවීම් වල දෝෂ නිවැරදි කිරීම සඳහා ඒකාබද්ධ කිරීමෙන් මෙය කළ හැකිය. අපගේ සේවාව නිශ්චිත පර්යේෂණ ඉලක්ක සපුරා ගනිමින් එකලස් කිරීම, ක්‍රියාකාරී විවරණ සහ උසස් ජෛව තොරතුරු විශ්ලේෂණයෙන් සම්පූර්ණ ජෛව තොරතුරු කාර්ය ප්රවාහය සපයයි. විවිධ ප්‍රවේණික සහ ප්‍රවේණික අධ්‍යයනයන් සඳහා නිරවද්‍ය විමර්ශන ප්‍රවේණික වර්ධනයට මෙම සේවාව මඟින් හැකියාව ලැබේ. මීට අමතරව, එය වික්‍රියා ප්‍රශස්තිකරණය, ජාන ඉංජිනේරු විද්‍යාව සහ ක්ෂුද්‍ර ජීවී තාක්ෂණ සංවර්ධනය වැනි යෙදුම් සඳහා පදනම සකසයි, විද්‍යාත්මක තීක්ෂ්ණ බුද්ධිය සහ ජෛව තාක්‍ෂණික නවෝත්පාදනයන් ඉදිරියට ගෙන යාම සඳහා තීරණාත්මක වන විශ්වාසදායක සහ පරතරයකින් තොර ජානමය දත්ත සහතික කරයි.
සේවා විශේෂාංග
● ජෙනෝමයේ සම්පූර්ණත්වයේ අපේක්ෂිත මට්ටම අනුව තෝරා ගැනීමට හැකි විකල්ප දෙකක් සමඟ.
● කෙටුම්පත් ජෙනෝම් විකල්පය: Illumina NovaSeq PE150 සමඟ කෙටි කියවීමේ අනුපිළිවෙල.
● 0 පරතරය ජෙනෝමය සම්පූර්ණ කරන්න.
● genome එකලස් කිරීම සඳහා Nanopore PromethION 48 හෝ PacBio Revio මත දිගු-කියවන අනුපිළිවෙල.
● ජෙනෝම වලංගුකරණය සහ දෝෂ නිවැරදි කිරීම (නැනෝපෝර්) හෝ කෙටුම්පත් ජෙනෝමයක් උත්පාදනය කිරීම සඳහා Illumina NovaSeq හි කෙටි කියවීම් අනුපිළිවෙල.
සේවා වාසි
●Zero-Gap Genome සහතිකයි: මෙය දිගු කියවීමේ අනුපිළිවෙල (Nanopore හෝ PacBio) සමඟ Illumina අනුක්‍රමය ඒකාබද්ධ කිරීම නිසාය.
●සම්පූර්ණ Bioinformatics Workflow:මෙයට ප්‍රවේණික එකලස් කිරීම සහ බහු ප්‍රවේණික මූලද්‍රව්‍ය පිළිබඳ පුරෝකථනය, ක්‍රියාකාරී ජාන විවරණ සහ Circos කුමන්ත්‍රණය වැනි ජාන දෘශ්‍යකරණය ඇතුළත් වේ.
●පුළුල් විශේෂඥතාව: ක්ෂුද්‍රජීවී ජෙනෝම 20,000කට අධික ප්‍රමාණයක් එකලස් කර ඇති අතර, BMKGENE දශකයකට වැඩි පළපුරුද්දක්, ඉහළ නිපුණතා විශ්ලේෂණ කණ්ඩායමක්, විස්තීරණ අන්තර්ගතයක් සහ විශිෂ්ට අලෙවියෙන් පසු සහයක් ගෙන එයි.
●අලෙවියෙන් පසු සහාය:අපගේ කැපවීම ව්‍යාපෘති නිම කිරීමෙන් ඔබ්බට මාස 3ක අලෙවියෙන් පසු සේවා කාලයක් සමඟින් විහිදේ. මෙම කාලය තුළ, අපි ව්‍යාපෘති පසු විපරම්, දෝශ නිරාකරණ සහාය, සහ ප්‍රතිඵලවලට අදාළ ඕනෑම විමසීමක් විසඳීමට ප්‍රශ්න සහ පිළිතුරු සැසි පිරිනමන්නෙමු.
●බහු අනුක්‍රමික උපාය මාර්ග තිබේ:විවිධ පර්යේෂණ ඉලක්ක සහ ජෙනෝම සම්පූර්ණත්වයේ අවශ්‍යතා සඳහා.
සේවා පිරිවිතර
| සේවාව | අනුක්‍රමික උපාය මාර්ගය |
| කෙටුම්පත ජෙනෝමය | Illumina PE150 100x |
| 0 Gap Genome | Nanopore 100x + Illumina PE150 100x Or Pacbio HiFi 30x + Illumina PE150 100x (විකල්ප) |
නියැදි අවශ්‍යතා:
| සාන්ද්රණය (ng/µL) | මුළු මුදල (µg) | පරිමාව (µL) | OD260/280 | OD260/230 | |
| PacBio | ≥20 | ≥1.2 | ≥20 | 1.7-2.2 | ≥1.0 |
| නැනෝපෝර් | ≥40 | ≥2 | ≥20 | 1.7-2.2 | 1.0-3.0 |
| ඉලුමිනා | ≥1 | ≥0.06 | ≥20 | - | - |
බැක්ටීරියා: ≥3.5x1010 සෛල
සේවා වැඩ ප්රවාහය
සාම්පල භාරදීම
පුස්තකාල ඉදිකිරීම
අනුපිළිවෙල
දත්ත විශ්ලේෂණය
අලෙවියෙන් පසු සේවා
පහත විශ්ලේෂණය ඇතුළත් වේ:
● අනුක්‍රමික දත්ත තත්ත්ව පාලනය
● ජෙනෝම එකලස් කිරීම
● ජාන සංරචක විශ්ලේෂණය: CDS සහ බහු ජානමය මූලද්‍රව්‍ය පිළිබඳ පුරෝකථනය
● බහු සාමාන්‍ය දත්ත සමුදායන් (GO, KEGG, ආදිය) සහ උසස් දත්ත සමුදායන් (CARD, VFDB, ආදිය) සමඟ ක්‍රියාකාරී විවරණ
● Genome Visualization
අපි ජෙනෝමය පහසුවෙන් ප්‍රවේශ විය හැකි වේගවත් ආකෘතියකින් සහ ජාන විවරණ ගොනුව (gff) සපයන්නෙමු.
ජාන විවරණ - GO
ජාන විවරණ - CAZY කාබෝහයිඩ්රේට
ජෙනෝමය දෘශ්‍යකරණය - සර්කෝස් කුමන්ත්‍රණය
සකස් කරන ලද ප්‍රකාශන එකතුවක් හරහා BMKGene හි බැක්ටීරියා ජෙනෝම එකලස් කිරීමේ සේවාවන් මගින් පහසුකම් සපයන දියුණුව ගවේෂණය කරන්න.
Dai, W. et al. (2023) 'සෞඛ්‍ය සම්පන්න මානව මහා බඩවැලේ සිට ulcerative colitis සඳහා ප්‍රතිකාර කිරීම සඳහා ආරක්ෂිත සහ නව ප්‍රෝබියොටික් බැක්ටීරියාවක් ලෙස Bacteroides uniformis F18-22 සොයා ගැනීම',අණුක විද්‍යාව පිළිබඳ ජාත්‍යන්තර සඟරාව, 24(19), පි. 14669. doi: 10.3390/IJMS241914669/S1.
Kang, Q. et al. (2021) 'බහු ඖෂධ-ප්‍රතිරෝධී Proteus mirabilis චීනයේ වන සතුන්ගෙන් blaOXA-1 සහ blaNDM-1 රැගෙන යන හුදකලා: මහජන සෞඛ්‍ය අවදානම වැඩි කිරීම',ඒකාබද්ධ සත්ව විද්‍යාව, 16(6), පිටු 798-809. doi: 10.1111/1749-4877.12510.
වැන්ග්, ටීටී සහ අල්. (2017) 'Endophyte Bacillus flexus KLBMP 4941 හි සම්පූර්ණ ප්‍රවේණි අනුපිළිවෙල එහි ශාක වර්ධන ප්‍රවර්ධන යාන්ත්‍රණය සහ ලුණු ඉවසීම සඳහා ජානමය පදනම හෙළි කරයි',ජෛව තාක්ෂණ සඟරාව, 260, පිටු 38-41. doi: 10.1016/J.JBIOTEC.2017.09.001.
වැන්ග්, X. et al. (2021) 'Multiple-Replicon Resistance Plasmids of Klebsiella Mediaate Extensive Dissemination of Antimicrobial ජාන',ක්ෂුද්‍රජීව විද්‍යාවේ මායිම්, 12, පි. 754931. doi: 10.3389/FMICB.2021.754931/BIBTEX.
