16S/18S/ITS Amplicon Sequencing-PacBio
සේවා විශේෂාංග
● අනුක්‍රමික වේදිකාව: PacBio Revio
● අනුක්‍රමික මාදිලිය: CCS (HiFi කියවයි)
● HiFi SMRT සීනුව පුස්තකාලය සකස් කිරීමට පෙර ඉලක්කගත කලාපය විස්තාරණය කිරීම සහ ඇම්ප්ලිකන් සම්බන්ධ කිරීම
සේවා වාසි
●ඉහළ වර්ගීකරණ විභේදනය: ටීහන් කෙටි-ඇම්ප්ලිකන් අනුපිළිවෙල,විශේෂ මට්ටමින් ඉහළ OTU වර්ගීකරණ අනුපාත සක්‍රීය කිරීම.
●ඉතා නිවැරදි මූලික ඇමතුම්: PacBio CCS මාදිලියේ අනුපිළිවෙල (HiFi කියවයි).
●හුදකලාව-නිදහස්: පාරිසරික සාම්පලවල ක්ෂුද්‍රජීවී සංයුතිය සීඝ්‍රයෙන් හඳුනා ගැනීම.
●පුළුල් ලෙස අදාළ වේ: විවිධ ක්ෂුද්ර ජීවී ප්රජා අධ්යයන.
●සවිස්තරාත්මක ජෛව තොරතුරු විශ්ලේෂණය: නවතම QIIME2 පැකේජය (ක්ෂුද්ර ජීවී පරිසර විද්‍යාව පිළිබඳ ප්‍රමාණාත්මක අවබෝධය) දත්ත සමුදාය, විවරණ, OTU/ASV අනුව විවිධ විශ්ලේෂණයන් සමඟ.
●පුළුල් විශේෂඥතාව: වාර්ෂිකව පවත්වනු ලබන දහස් ගණන් ඇම්ප්ලිකන් අනුක්‍රමික ව්‍යාපෘති සමඟින්, BMKGENE දශකයකට වැඩි පළපුරුද්දක්, ඉහළ නිපුණතා විශ්ලේෂණ කණ්ඩායමක්, විස්තීරණ අන්තර්ගතයක් සහ විශිෂ්ට අලෙවියෙන් පසු සහයක් ගෙන එයි.
සේවා පිරිවිතර
| පුස්තකාලය | අනුක්‍රමික උපාය මාර්ගය | නිර්දේශිත දත්ත |
| ඇම්ප්ලිකන් | PacBio Revio | 10/30/50 K ටැග් (CCS) |
නියැදි අවශ්යතා
| සාන්ද්රණය (ng/µL) | මුළු මුදල (µg) | පරිමාව (µL) |
| ≥5 | ≥0.3 | ≥20 |
නිර්දේශිත සාම්පල භාරදීම
සාම්පල ද්‍රව නයිට්‍රජන් වල පැය 3-4ක් කැටි කර ද්‍රව නයිට්‍රජන් හෝ අංශක -80ක් දිගු කාලීනව වෙන්කර තබා ගන්න. වියළි අයිස් සහිත නියැදි නැව්ගත කිරීම අවශ්ය වේ.
සේවා වැඩ ප්රවාහය
සාම්පල භාරදීම
පුස්තකාල ඉදිකිරීම
අනුපිළිවෙල
දත්ත විශ්ලේෂණය
අලෙවියෙන් පසු සේවා
පහත විශ්ලේෂණය ඇතුළත් වේ:
●අමු දත්ත තත්ත්ව පාලනය
●OTU පොකුරු/De-noise(ASV)
●OTU විවරණ
●ඇල්ෆා විවිධත්ව විශ්ලේෂණය: ෂැනන්, සිම්ප්සන් සහ ඒසීඊ ඇතුළු බහු දර්ශක.
●බීටා විවිධත්ව විශ්ලේෂණය
●අන්තර් කණ්ඩායම් විශ්ලේෂණය
● සහසම්බන්ධතා විශ්ලේෂණය: පාරිසරික සාධක සහ පිටත සංයුතිය සහ විවිධත්වය අතර
●16S ක්‍රියාකාරී ජාන අනාවැකිය
වර්ගීකරණ ව්‍යාප්තියේ හිස්ටෝග්‍රෑම්
ප්රජා ව්‍යාප්තිය ෆයිලොජෙනටික් ගස
ඇල්ෆා විවිධත්ව විශ්ලේෂණය: ACE
දර්ශකය
බීටා විවිධත්ව විශ්ලේෂණය: PCoA
අන්තර් කණ්ඩායම් විශ්ලේෂණය: ANOVA
PacBio සමඟින් BMKGene හි ඇම්ප්ලිකොන් අනුක්‍රමික සේවා මගින් සම්පාදනය කරන ලද ප්‍රකාශන එකතුවක් හරහා පහසුකම් සපයන දියුණුව ගවේෂණය කරන්න.
Gao, X. සහ Wang, H. (2023) 'ඇල්පයින් තණබිමක වැඩෙන අවධීන් දෙකක් සහිත ඇල්පයින් මෙරිනෝ බැටළුවන්ගේ විවිධ ෆීනොලොජි (Regreen එදිරිව ග්‍රාසී) වලට අනුවර්තනය වීමේදී Rumen බැක්ටීරියා පැතිකඩ සහ ක්‍රියාකාරීත්වය පිළිබඳ සංසන්දනාත්මක විශ්ලේෂණය', පැසවීම, 9( 1), පි. 16. doi: 10.3390/FERMENTATION9010016/S1.
Li, S. et al. (2023) 'සංස්කෘතික විද්‍යාව මත පදනම් වූ මෙජෙනොමික්ස් සහ අධි-විභේදන විශ්ලේෂණය භාවිතයෙන් කාන්තාර පසෙහි ඇති ක්ෂුද්‍රජීවී අඳුරු පදාර්ථ ග්‍රහණය කර ගැනීම', npj Biofilms සහ Microbiomes 2023 9:1, 9(1), pp. 1–14. doi: 10.1038/s41522-023-00439-8.
Mu, L. et al. (2022) 'ඇල්ෆල්ෆා, සහල් පිදුරු සහ තිරිඟු නිවුඩ්ඩ සමඟ සකස් කරන ලද මිශ්‍ර සිලේ පැසවීමේ ලක්ෂණ, බැක්ටීරියා විවිධත්වය සහ වායුගෝලීය ස්ථායීතාවය මත මේද අම්ල ලවණවල බලපෑම්', ආහාර සහ කෘෂිකර්ම විද්‍යාව පිළිබඳ සඟරාව, 102(4), පිටු. 1475– 1487. doi: 10.1002/JSFA.11482.
යැං, ජේ. සහ අල්. (2023) 'Oxidative Stress Biomarkers සහ Gut Microbiota අතර අන්තර්ක්‍රියාව Sonchus brachyotus DC වෙතින් නිස්සාරණයේ ප්‍රතිඔක්සිකාරක බලපෑම්. Oxazolone-induced Induced Instinal Oxidative Stress in Adult Zebrafish', Antioxidants 2023, Vol. 12, පිටුව 192, 12(1), පි. 192. doi: 10.3390/ANTIOX12010192.
