مڪمل جينوم بيسلفائٽ تسلسل (WGBS)
پوري جينوم بيسلفائٽ سيڪوئنسنگ (WGBS) سون جي معياري طريقي جي طور تي بيٺو آهي ڊي اين اي ميٿيليشن جي گہرا ڳولا لاءِ، خاص طور تي پنجين پوزيشن سائٽوسين (5-mC) ۾، جين جي اظهار ۽ سيلولر سرگرمي جو هڪ اهم ريگيوليٽر. WGBS جي بنيادي اصول ۾ بيسلفائٽ علاج شامل آهي، غير ميٿيلائيٽ سائٽوزائن کي uracil (C to U) ۾ تبديل ڪرڻ، جڏهن ته ميٿيلائيٽ سائٽوزائن کي اڻڄاتل ڇڏيندي. هي ٽيڪنڪ پيش ڪري ٿي سنگل بيس ريزوليوشن، تحقيق ڪندڙن کي اجازت ڏئي ٿي ته جامع طور تي ميٿيلوم جي تحقيق ڪري ۽ مختلف حالتن سان لاڳاپيل غير معمولي ميٿيليشن نمونن کي ظاهر ڪري، خاص طور تي ڪينسر. WGBS کي ملازمت ڏيڻ سان، سائنسدان جينوم-وائڊ ميٿيليشن جي منظرنامي ۾ بي مثال بصيرت حاصل ڪري سگھن ٿا، ايپيگينيٽڪ ميکانيزم جي هڪ نرالي ڄاڻ مهيا ڪن ٿيون جيڪي مختلف حياتياتي عملن ۽ بيمارين کي هيٺ ڪن ٿا.
خدمتون خاصيتون
● ريفرنس جينوم جي ضرورت آهي.
● ليمبڊا ڊي اين اي شامل ڪيو ويو آهي مانيٽر ڪرڻ لاءِ بيسلفائٽ جي تبديلي جي ڪارڪردگي.
● Illumina NovaSeq تي ترتيب ڏيڻ.
سروس فائدا
●ڊي اين اي ميٿيليشن ريسرچ لاء گولڊ معيار: هي بالغ ميٿيليشن تبادلي جي پروسيسنگ ٽيڪنالاجي ۾ اعلي درستگي ۽ سٺي پيداوار جي صلاحيت آهي.
●وسيع ڪوريج ۽ سنگل بيس ريزوليوشن:جينوم-وائڊ سطح تي ميٿيليشن سائيٽن جي ڳولا.
●مڪمل پليٽ فارم:نموني پروسيسنگ، لائبريري جي تعمير، بايو انفارميٽڪس تجزيي کي ترتيب ڏيڻ کان هڪ اسٽاپ شاندار خدمت مهيا ڪريو.
●وسيع ماهر: WGBS سان ترتيب ڏيڻ وارا منصوبا ڪاميابيءَ سان مڪمل ڪيا ويا مختلف نسلن ۾، BMKGENE هڪ ڏهاڪي کان وڌيڪ تجربو، هڪ اعليٰ ماهر تجزياتي ٽيم، جامع مواد، ۽ بهترين پوسٽ-سيلز سپورٽ آڻي ٿو.
●ٽرانسڪرپٽومڪس تجزيي سان شامل ٿيڻ جو امڪان: WGBS جي گڏيل تجزيي جي اجازت ڏئي ٿي ٻين omics ڊيٽا جهڙوڪ RNA-seq.
نموني جي وضاحت
| لائبريري | تسلسل واري حڪمت عملي | سفارش ٿيل ڊيٽا آئوٽ | معيار ڪنٽرول |
| Bisulfite علاج | Illumina PE150 | 30x کوٽائي | Q30 ≥ 85% Bisulfite تبديلي > 99٪ |
نموني جي گهرج
| ڪنسنٽريشن (ng/µL) | ڪل رقم (µg) | اضافي گهرجون | |
| جينوميڪ ڊي اين اي | ≥ 5 | ≥ 400 اين | محدود تباهي يا آلودگي |
سروس ڪم فلو
نموني پهچائڻ
ڊي اين اي ڪڍڻ
لائبريري جي تعمير
تسلسل
ڊيٽا جو تجزيو
ڊيٽا پهچائڻ
ھيٺ ڏنل تجزيو شامل آھي:
● خام تسلسل معيار ڪنٽرول؛
● جينوم جي حوالي سان نقشي سازي؛
● 5mC methylated بنيادن جي چڪاس؛
● ميٿيليشن جي ورڇ ۽ تشريح جو تجزيو؛
● مختلف ميٿيلائيڊ علائقن جو تجزيو (DMRs)؛
● DMRs سان لاڳاپيل جين جو فنڪشنل تشريح.
5mC ميٿيليشن جو پتو لڳائڻ: ميٿيل ٿيل سائيٽن جا قسم
ميٿيليشن نقشو. 5mC ميٿيليشن جينوم وسيع تقسيم
انتهائي ميٿيل ٿيل علائقن جي تشريح
مختلف طور تي ميٿيل ٿيل علائقا: لاڳاپيل جينس
مختلف طور تي ميٿيل ٿيل علائقا: لاڳاپيل جين جي تشريح (جين آنٽولوجي)
BMKGene جي مڪمل جينوم بيسلفائٽ ترتيب ڏيڻ واري خدمتن پاران شايع ٿيل اشاعتن جي ترتيب ڏنل مجموعي ذريعي تحقيق جي واڌاري کي ڳوليو.
فين، Y. et al. (2020) 'ڊي اين اي ميٿيليشن پروفائلز جو تجزيو رڍن جي کنڊ جي عضون جي ترقي دوران مڪمل جينوم بيسلفائٽ تسلسل استعمال ڪندي'،بي ايم سي جينومڪس، 21 (1)، ص 1-15. doi: 10.1186/S12864-020-6751-5.
Zhao، X. et al. (2022) 'ناول ڊي آڪسائيريبونيوڪلڪ ايسڊ ميٿيليشن جي ڀڃڪڙي ڪارڪنن ۾ ونائل کلورائڊ جي سامهون'،Toxicology ۽ صنعتي صحت، 38(7)، ص 377-388. doi: 10.1177/07482337221098600
زو، جي وغيره. (2020) 'جينوم ميٿيليشن جي وچ ۾ لاڳاپا، غير ڪوڊنگ آر اين اي جي سطح، ايم آر اين ايز ۽ ميٽابولائٽس ٽماٽو ميوو پائڻ ۾'،پلانٽ جرنل، 103 (3)، ص 980-994. doi: 10.1111/TPJ.14778.
