Prokaryotic RNA تسلسل
خاصيتون
● آر اين اي نموني جي پروسيسنگ ۾ شامل آهي rRNA جي گھٽتائي پٺيان هدايت واري آر اين اي لائبريري جي تياري.
● بايو انفارميٽڪ تجزيا هڪ ريفرنس جينوم کي ترتيب ڏيڻ جي بنياد تي
● تجزيي ۾ جين جو اظهار ۽ DEGs شامل آهن پر ٽرانسڪرپٽ ڍانچي ۽ sRNA تجزيو پڻ
سروس فائدا
●سخت معيار ڪنٽرول: اسان سڀني مرحلن تي بنيادي ڪنٽرول پوائنٽس تي عمل ڪندا آهيون، نموني ۽ لائبريري جي تياري کان وٺي ترتيب ڏيڻ ۽ بايو انفارميٽڪس تائين. هي محتاط نگراني مسلسل اعلي معيار جي نتيجن جي پهچائڻ کي يقيني بڻائي ٿي.
●Strand-specific Sequencing ڊيٽاآر اين اي لئبريري جي تياري جي ڪري هدايتڪاري، انٽي سينس ٽرانسڪرپٽس جي سڃاڻپ کي فعال ڪرڻ جي ڪري.
●مڪمل تجزيو Prokaryotic Transscriptomes جي مطابقبائيو انفارميٽيڪل پائپ لائن ۾ شامل آهي نه رڳو جين جي اظهار جو تجزيو پر ٽرانسڪرپٽ ڍانچي جو تجزيو پڻ شامل آهي، بشمول آپريٽرن جي سڃاڻپ، UTRs ۽ پروموٽر. ان ۾ sRNAs جو تجزيو پڻ شامل آھي، يعني ثانوي ڍانچي ۽ ھدف جي تشريح ۽ اڳڪٿي.
●پوسٽ-سيلز سپورٽ: اسان جي وابستگي پروجيڪٽ جي مڪمل ٿيڻ کان اڳتي وڌي ٿي 3-مهيني بعد-سيل سروس جي مدت سان. هن وقت دوران، اسان پيش ڪريون ٿا پروجيڪٽ جي پيروي ڪرڻ، مشڪلاتن جي حل ۾ مدد، ۽ سوال ۽ جواب سيشن نتيجن سان لاڳاپيل ڪنهن به سوالن کي حل ڪرڻ لاء.
نموني جي گهرج ۽ پهچائڻ
| لائبريري | ترتيب واري حڪمت عملي | سفارش ٿيل ڊيٽا | معيار ڪنٽرول |
| rRNA ختم ٿيل هدايت واري لائبريري | Illumina PE150 | 1-2 جي بي | Q30≥85% |
نموني جي گهرج:
| اتفاق (ng/μl) | رقم (μg) | پاڪائي | سالميت |
| ≥ 50 | ≥ 1 | OD260/280=1.8-2.0 OD260/230=1.0-2.5 جيل تي ڏيکاريل محدود يا ڪو پروٽين يا ڊي اين اي آلودگي. | RIN≥6.5 |
تجويز ڪيل نموني پهچائڻ
ڪنٽينر: 2 ml سينٽرفيوج ٽيوب (ٽين ورق جي سفارش نه ڪئي وئي آهي)
نموني ليبلنگ: گروپ + نقل ڪريو مثال طور A1، A2، A3؛ B1، B2، B3.
ترسيل:
1. خشڪ برف: نمونن کي بيگز ۾ ڀريل ۽ خشڪ برف ۾ دفن ڪرڻ جي ضرورت آهي.
2. RNAstable tubes: RNA جا نمونا RNA اسٽيبلائيزيشن ٽيوب (مثال طور RNAstable®) ۾ خشڪ ڪري سگھجن ٿا ۽ ڪمري جي گرمي پد تي موڪليا وڃن ٿا.
سروس ڪم فلو
نموني پهچائڻ
لائبريري جي تعمير
تسلسل
ڊيٽا جو تجزيو
وڪري کان پوء خدمتون
بايو انفارميٽڪ تجزياتي ڪم فلو
ھيٺ ڏنل تجزيو شامل آھي:
● خام ڊيٽا معيار ڪنٽرول
● ريفرنس جينوم کي ترتيب ڏيڻ
● لائبريري جي معيار جو جائزو: آر اين اي فرگمينٽيشن بي ترتيب، داخل سائيز ۽ ترتيب جي سنترپشن
● اڳڪٿي ڪيل ڪوڊنگ جينز جي فنڪشنل تشريح
● اظهار جو تجزيو: لاڳاپو ۽ پرنسپل اجزاء جو تجزيو (PCA)
● فرق جين اظهار (DEGs)
● فنڪشنل تشريح ۽ DEGs جي افزودگي
● sRNA تجزيو: اڳڪٿي، تشريح، ٽارگيٽ، ۽ ثانوي جوڙجڪ اڳڪٿي
● ٽرانسڪرپٽ ڍانچي جو تجزيو: آپريشنز، شروعاتي ۽ ختم ٿيڻ واريون پوزيشنون، اڻ ترجمو ٿيل علائقو (UTS)، پروموٽر، ۽ SNP/InDel تجزيو
تسلسل سنترپتي
ڪوڊنگ جين جي فنڪشنل تشريح
نموني جي وچ ۾ لاڳاپو
اختلافي اظهار ڪيل جينس (DEGs) تجزيو
فنڪشنل افزودگي جو تجزيو
sRNA تشريح
هن نمايان اشاعت ۾ BMKGene جي نانوپور مڪمل ڊگھائي mRNA ترتيب ڏيڻ جي خدمتن پاران سهولتن جي ترقيءَ جي ڳولا ڪريو.
گوان، سي پي وغيره. (2018) 'Global Transscriptome Changes of Biofilm-forming Staphylococcus epidermidis Responsing to Total Alkaloids of Sophorea alopecuroides'،پولش جرنل آف مائڪروبيولوجي، 67 (2)، ص. 223. doi: 10.21307/PJM-2018-024.
