-
BMKMANU S3000_Spatial Transscriptome
اسپيشل ٽرانسڪرٽوميڪس سائنسي جدت جي اڳيان بيٺو آهي، محققن کي بااختيار بڻائڻ جي لاءِ بااختيار بڻيل جين اظهار جي نمونن کي ٽشوز اندر جڏهن انهن جي فضائي حوالي سان محفوظ ڪيو وڃي. مختلف پليٽ فارمن جي وچ ۾، BMKGene ترقي ڪئي آهي BMKManu S3000 Spatial Transscriptome چپ، 3.5µm جي وڌايل ريزوليوشن تي فخر ڪندي، ذيلي سيل رينج تائين پهچندي، ۽ ملٽي ليول ريزوليوشن سيٽنگز کي فعال ڪندي. S3000 چپ، لڳ ڀڳ 4 ملين اسپاٽس جي خصوصيت رکي ٿي، مائيڪرو ويلز کي استعمال ڪري ٿو جيڪي بيڊز سان ڀريل بيڊز سان ڀريل آهن جن کي اسپيٽلي بارڪوڊ ٿيل ڪيپچر پروبس سان ڀريل آهي. هڪ cDNA لائبريري، مقامي بارڪوڊس سان ڀرپور، S3000 چپ مان تيار ڪئي وئي آهي ۽ بعد ۾ Illumina NovaSeq پليٽ فارم تي ترتيب ڏنل آهي. مقامي طور تي بارڪوڊ ٿيل نمونن ۽ UMIs جو ميلاپ پيدا ڪيل ڊيٽا جي درستگي ۽ خاصيت کي يقيني بڻائي ٿو. BMKManu S3000 چپ انتهائي ورسٽائل آهي، جيڪا ملٽي ليول ريزوليوشن سيٽنگون پيش ڪري ٿي جيڪي مختلف ٽشوز ۽ تفصيل جي گهربل سطحن تي چڱيءَ ريت ترتيب ڏئي سگھجن ٿيون. هي موافقت چپ کي هڪ شاندار انتخاب جي طور تي رکي ٿو متنوع فضائي ٽرانسڪرپٽوميڪس جي مطالعي لاءِ، يقيني بڻائي ٿو مخصوص فضائي ڪلسترنگ کي گهٽ ۾ گهٽ شور سان. BMKManu S3000 سان سيل سيگمينٽيشن ٽيڪنالاجي جو استعمال سيلز جي حدن تائين ٽرانسپشنل ڊيٽا جي حد بندي کي قابل بڻائي ٿو، نتيجي ۾ هڪ تجزيو جيڪو سڌو حياتياتي معني رکي ٿو. ان کان علاوه، S3000 جي بهتر ريزوليوشن جي نتيجي ۾ جينز ۽ UMIs جي وڌيڪ تعداد ۾ في سيل جي ڳولا ڪئي وئي، خلائي ٽرانسپشن جي نمونن ۽ سيلز جي ڪلسترنگ جي وڌيڪ صحيح تجزيو کي چالو ڪرڻ.
-
سنگل نيوڪلي آر اين اي جي ترتيب
سنگل سيل جي قبضي ۽ ڪسٽم لائبريري جي تعمير جي ٽيڪنالاجي جي ترقي، اعلي-ذريعي ترتيب سان گڏ، سيل جي سطح تي جين اظهار جي مطالعي ۾ انقلاب آڻي ڇڏيو آهي. هي پيش رفت پيچيده سيلن جي آبادي جي وڌيڪ گہرے ۽ وڌيڪ جامع تجزيي جي اجازت ڏئي ٿي، سڀني سيلن تي جين اظهار جي اوسط سان لاڳاپيل حدن کي ختم ڪندي ۽ انهن آبادي جي اندر حقيقي نسلييت کي محفوظ ڪري ٿو. جڏهن ته سنگل سيل آر اين اي سيڪوئنسنگ (scRNA-seq) جا ناقابل ترديد فائدا آهن، پر اهو ڪجهه ٽشوز ۾ چيلينجز کي منهن ڏئي ٿو جتي سنگل سيل جي معطلي جي ٺهڻ مشڪل ثابت ٿئي ٿي ۽ تازو نمونن جي ضرورت آهي. BMKGene تي، اسان جديد ترين 10X جينومڪس ڪروميم ٽيڪنالاجي استعمال ڪندي سنگل نيوڪلئس آر اين اي سيڪوئنسنگ (snRNA-seq) پيش ڪندي هن رڪاوٽ کي حل ڪريون ٿا. اهو نقطو نمونن جي اسپيڪٽرم کي وسيع ڪري ٿو جيڪو واحد سيل جي سطح تي ٽرانسڪرپٽوم تجزيي جي قابل آهي.
نيوڪلي جي الڳ ٿيڻ کي جديد 10X جينومڪس ڪروميم چپ ذريعي مڪمل ڪيو ويو آهي، هڪ اٺ چينل مائڪرو فلائيڊڪس سسٽم سان گڏ ڊبل ڪراسنگ سان. هن سسٽم جي اندر، جيل موتي شامل آهن بارڪوڊس، پرائمر، اينزائمز، ۽ هڪ واحد نيوڪليس نانووليٽر جي سائز جي تيل جي قطرن ۾ ڍڪيل آهن، جيل بيڊ-ان-ايملشن (GEM) ٺاهي رهيا آهن. GEM ٺهڻ کان پوء، سيل lysis ۽ بارڪوڊ ڇڏڻ هر GEM جي اندر ٿينديون آهن. تنهن کان پوءِ، mRNA ماليڪيولز 10X بارڪوڊس ۽ منفرد ماليڪيولر شناخت ڪندڙ (UMIs) کي شامل ڪندي، سي ڊي اين ايز ۾ ريورس ٽرانسڪرپشن مان گذرندا آهن. اهي سي ڊي اين اي وري معياري ترتيب واري لائبريري جي تعمير جي تابع آهن، جين ايڪسپريس پروفائلز جي سنگل سيل جي سطح تي مضبوط ۽ جامع ڳولا جي سهولت فراهم ڪندي.
پليٽ فارم: 10 × جينومڪس Chromium ۽ Illumina NovaSeq پليٽ فارم
-
10x جينومڪس ويزيم اسپيٽيل ٽرانسڪروم
Spatial transscriptomics هڪ جديد ٽيڪنالاجي آهي جيڪا محققن کي اجازت ڏئي ٿي ته انهن جين جي اظهار جي نمونن کي ٽشوز اندر تحقيق ڪري جڏهن انهن جي فضائي حوالي سان محفوظ رهي. ھن ڊومين ۾ ھڪڙو طاقتور پليٽ فارم آھي 10x جينومڪس ويزيم جيڪو ايلومينا جي ترتيب سان گڏ آھي. 10X Visium جو اصول هڪ خاص چپ تي رکيل آهي جنهن ۾ هڪ نامزد ڪيل ڪيپچر ايريا آهي جتي ٽشو سيڪشن رکيل آهن. هن قبضي واري علائقي ۾ بارڪوڊ ٿيل اسپاٽ شامل آهن، هر هڪ ٽشو اندر هڪ منفرد مقامي جڳهه سان لاڳاپيل آهي. ٽشو مان پڪڙيل آر اين اي ماليڪيولز کي وري ريورس ٽرانسپشن جي عمل دوران منفرد ماليڪيولر شناخت ڪندڙ (UMIs) سان ليبل ڪيو ويندو آهي. اهي بارڪوڊ ٿيل جڳهيون ۽ UMIs هڪ واحد سيل ريزوليوشن تي جين اظهار جي درست فضائي نقشي ۽ مقدار جي تصديق کي فعال ڪن ٿا. مقامي طور تي بارڪوڊ ٿيل نمونن ۽ UMIs جو ميلاپ پيدا ڪيل ڊيٽا جي درستگي ۽ خاصيت کي يقيني بڻائي ٿو. هن Spatial Transscriptomics ٽيڪنالاجي کي استعمال ڪندي، محقق سيلز جي فضائي تنظيم ۽ ٽشوز جي اندر ٿيندڙ پيچيده ماليڪيولر رابطي جي وڌيڪ ڄاڻ حاصل ڪري سگھن ٿا، ڪيترن ئي شعبن ۾ حياتياتي عملن جي بنيادي ميڪانيزم ۾ انمول بصيرت پيش ڪري ٿو، بشمول آنڪولوجي، نيورو سائنس، ترقياتي حياتيات، امونالوجي. ، ۽ نباتاتي اڀياس.
پليٽ فارم: 10X جينومڪس ويزيم ۽ Illumina NovaSeq
