-
تقابلي جينومڪس
تقابلي جينومڪس ۾ مختلف نسلن جي وچ ۾ پوري جينوم جي ترتيبن ۽ ساختن جو امتحان ۽ مقابلو شامل آهي. هي فيلڊ نسلن جي ارتقا کي ظاهر ڪرڻ، جين جي ڪمن کي ڊيڪوڊ ڪرڻ، ۽ جينياتي ريگيوليٽري ميڪانيزم کي واضح ڪرڻ جي ڪوشش ڪري ٿو مختلف جاندارن ۾ محفوظ يا مختلف ترتيب واري جوڙجڪ ۽ عناصر جي سڃاڻپ ڪندي. هڪ جامع تقابلي جينومڪس مطالعي ۾ تجزيا شامل آهن جهڙوڪ جين خاندانن، ارتقائي ترقي، سڄي جينوم جي نقل جي واقعن، ۽ چونڊيل دٻاء جو اثر.
-
ارتقائي جينياتي
آبادي ۽ ارتقائي جينياتي تجزيو پليٽ فارم بي ايم ڪي آر اينڊ ڊي ٽيم جي اندر سالن تائين گڏ ڪيل وڏي تجربي جي بنياد تي قائم ڪيو ويو آهي. اهو هڪ صارف دوست اوزار آهي خاص طور تي محققن لاءِ جيڪي بائيو انفارميٽڪس ۾ اهم نه آهن. هي پليٽ فارم بنيادي ارتقائي جينياتيات سان لاڳاپيل بنيادي تجزين کي قابل بڻائي ٿو جنهن ۾ phylogenetic وڻ جي تعمير، لنڪج disequilibrium analysis، genetic diversity assessment، Selective sweep analysis، kinship analysis، PCA، آبادي جي جوڙجڪ جو تجزيو، وغيره.
-
هاء-سي جي بنياد تي جينوم اسيمبلي
هاءِ-سي هڪ طريقو آهي جيڪو ڪروموزوم جي ترتيب کي پڪڙڻ لاءِ تيار ڪيو ويو آهي پروبنگ پروڪسميٽي تي ٻڌل رابطي ۽ اعليٰ ذريعي جي ترتيب کي گڏ ڪري. انهن ڳالهين جي شدت کي مڃيو وڃي ٿو منفي طور تي ڪروموزوم تي جسماني فاصلي سان لاڳاپو. تنهن ڪري، هاء-سي ڊيٽا استعمال ڪيو ويندو آهي ڪلسٽرنگ، ترتيب ڏيڻ، ۽ ترتيب ڏيڻ جي هدايت جي لاء هڪ مسودو جينوم ۾ گڏ ڪيل ترتيبن ۽ انهن کي لنگرائڻ لاء هڪ مخصوص نمبر ڪروموزوم تي. هي ٽيڪنالاجي آبادي جي بنياد تي جينياتي نقشي جي غير موجودگي ۾ ڪروموزوم-سطح جي جينوم اسيمبلي کي طاقت ڏئي ٿي. هر هڪ جينوم کي هاء-سي جي ضرورت آهي.
-
ٻوٽو/جانور ڊي نوو جينوم جي ترتيب
ڊي نووترتيب ڏيڻ جو مطلب آهي هڪ نسل جي پوري جينوم جي تعمير کي ترتيب ڏيڻ واري ٽيڪنالاجي استعمال ڪندي هڪ ريفرنس جينوم جي غير موجودگي ۾. ٽين نسل جي ترتيب جو تعارف ۽ وسيع اپنائڻ، خاص طور تي ڊگهي پڙهڻ جي خاصيت، پڙهڻ جي وچ ۾ اوورليپ کي وڌائي جينوم اسيمبليء کي خاص طور تي وڌايو آهي. هي واڌارو خاص طور تي مناسب آهي جڏهن مشڪل جينوم سان معاملو ڪيو وڃي، جهڙوڪ جيڪي اعلي هيٽرروزائگوسٽي ڏيکاري رهيا آهن، بار بار علائقن جو هڪ اعلي تناسب، پوليپلوڊس، ۽ علائقا ٻيهر ورجائيندڙ عناصر سان، غير معمولي GC مواد، يا اعلي پيچيدگي جيڪي عام طور تي خراب طور تي مختصر-پڙهندڙ تسلسل استعمال ڪندي گڏ ڪيا ويا آهن. اڪيلو.
اسان جو ون اسٽاپ حل مهيا ڪري ٿو مربوط ترتيب ڏيڻ واريون خدمتون ۽ بايو انفارميٽڪ تجزيا جيڪي هڪ اعليٰ معيار جي ڊي نوو گڏ ٿيل جينوم فراهم ڪن ٿا. Illumina سان گڏ هڪ ابتدائي جينوم سروي جينوم جي سائيز ۽ پيچيدگي جو اندازو مهيا ڪري ٿو، ۽ اها معلومات PacBio HiFi سان ڊگهي پڙهڻ واري ترتيب جي ايندڙ قدم جي رهنمائي ڪرڻ لاءِ استعمال ڪئي ويندي آهي، جنهن بعدنئونcontigs جي اسيمبلي. هاءِ سي اسيمبليءَ جو بعد ۾ استعمال ڪنٽيگس کي جينوم ڏانهن لنگر انداز ڪرڻ جي قابل بڻائي ٿو، ڪروموزوم-سطح واري اسيمبلي حاصل ڪرڻ. آخرڪار، جينوم کي جين جي اڳڪٿي ۽ بيان ڪيل جين جي ترتيب سان بيان ڪيو ويو آهي، مختصر ۽ ڊگهي پڙهڻ سان ٽرانسڪرپٽومس جو رستو اختيار ڪندي.
-
انسان جي مڪمل Exome تسلسل
Human Hole Exome sequencing (hWES) وڏي پيماني تي تسليم ڪيو ويو آهي هڪ قيمتي ۽ طاقتور ترتيب واري انداز جي طور تي مرض پيدا ڪرڻ واري ميوٽيشنز کي نشانو بڻائڻ لاءِ. پوري جينوم جو صرف 1.7 سيڪڙو هجڻ جي باوجود، Exons هڪ اهم ڪردار ادا ڪري ٿو سڌو سنئون ڪل پروٽين جي ڪمن جي پروفائل کي ظاهر ڪندي. خاص طور تي، انساني جينوم ۾، بيمارين سان لاڳاپيل ميوٽيشنز جو 85 سيڪڙو کان وڌيڪ پروٽين ڪوڊنگ علائقن ۾ ظاهر ٿئي ٿو. BMKGENE پيش ڪري ٿو هڪ جامع ۽ لچڪدار انساني پوري exome ترتيب ڏيڻ جي خدمت ٻن مختلف Exon ڪيپچرنگ حڪمت عملين سان گڏ مختلف تحقيقي مقصدن کي پورا ڪرڻ لاءِ.
-
مخصوص-لوڪس ايمپليفائيڊ فريگمينٽ تسلسل (SLAF-Seq)
وڏي پيماني تي جين ٽائپنگ، خاص طور تي وڏي پئماني تي آبادي تي، جينياتي انجمن جي مطالعي ۾ بنيادي قدم آهي ۽ فنڪشنل جين جي دريافت، ارتقائي تجزيي وغيره لاء جينياتي بنياد فراهم ڪري ٿي.گھٽ ٿيل نمائندگي جينوم تسلسل (RRGS)عام طور تي انهن مطالعي ۾ استعمال ڪيو ويندو آهي هر نموني جي ترتيب جي قيمت کي گھٽائڻ لاءِ جڏهن ته جينياتي مارڪر جي دريافت ۾ مناسب ڪارڪردگي برقرار رکندي. RRGS اهو حاصل ڪري ٿو ڊي اين اي کي هضم ڪرڻ سان پابندي واري اينزيمز سان ۽ هڪ مخصوص ٽڪرا سائيز جي حد تي ڌيان ڏيڻ سان، ان ڪري جينوم جو صرف هڪ حصو ترتيب ڏئي ٿو. RRGS جي مختلف طريقن مان، مخصوص-لوڪس امپليائيڊ فريگمينٽ سيڪوئنسنگ (SLAF) هڪ حسب ضرورت ۽ اعليٰ معيار جو طريقو آهي. اهو طريقو، BMKGene پاران آزاد طور تي ترقي ڪئي وئي، هر منصوبي لاء پابندي اينزيم سيٽ کي بهتر بڻائي ٿو. هي SLAF ٽيگ جي هڪ وڏي تعداد جي پيداوار کي يقيني بڻائي ٿو (جينوم جي 400-500 بي پي ايس علائقا ترتيب ڏنل آهن) جيڪي جينوم ۾ هڪجهڙائي سان ورهايل آهن جڏهن ته مؤثر طور تي بار بار وارن علائقن کان پاسو ڪيو وڃي ٿو، اهڙي طرح بهترين جينياتي مارڪر دريافت کي يقيني بڻائي ٿو.
-
Illumina اڳ ۾ ٺهيل لائبريريون
Illumina sequencing ٽيڪنالاجي، Sequencing by Synthesis (SBS) جي بنياد تي، هڪ عالمي سطح تي قبول ڪيل NGS جدت آهي، جيڪا دنيا جي 90 سيڪڙو کان وڌيڪ ڊيٽا ترتيب ڏيڻ جي ذميوار آهي. SBS جي اصول ۾ شامل آهي اميجنگ فلوروسنٽ ليبل ٿيل ريورسيبل ٽرمينيٽر جيئن هر ڊي اين ٽي پي کي شامل ڪيو ويو آهي، ۽ بعد ۾ ايندڙ بيس کي شامل ڪرڻ جي اجازت ڏيڻ لاءِ صاف ڪيو ويو آهي. هر ترتيب واري چڪر ۾ موجود سڀني چار ريورسيبل ٽرمينيٽر پابند dNTPs سان، قدرتي مقابلو شامل ٿيڻ جي تعصب کي گھٽائي ٿو. هي ورسٽائل ٽيڪنالاجي ٻنهي سنگل-پڙهندڙ ۽ جوڙيل-آخر لائبريرين کي سپورٽ ڪري ٿي، جينومڪ ايپليڪيشنن جي هڪ حد تائين پهچائي ٿي. Illumina sequencing جي اعليٰ طريقي سان صلاحيتون ۽ درستي ان کي جينومڪس ريسرچ ۾ بنيادي حيثيت رکي ٿي، سائنسدانن کي بااختيار بڻائي ٿي ته هو جينوم جي پيچيدگين کي بي مثال تفصيل ۽ ڪارڪردگيءَ سان حل ڪن.
اسان جي اڳ ۾ ٺهيل لائبريري ترتيب ڏيڻ جي خدمت گراهڪن کي مختلف ذريعن (mRNA، سڄو جينوم، amplicon، 10x لائبريريون، ٻين جي وچ ۾) مان ترتيب ڏيڻ واري لائبريري تيار ڪرڻ جي قابل بڻائي ٿي. ان کان پوء، اهي لائبريريون اسان جي ترتيب سينٽرن ڏانهن موڪلي سگهجن ٿيون معيار ڪنٽرول ۽ Illumina پليٽ فارمن ۾ ترتيب ڏيڻ لاء.
