-
اوزار
BMKCloud هڪ معروف بايو انفارميٽڪ پليٽ فارم آهي جيڪو جينومڪ پروگرامن لاءِ ون اسٽاپ حل فراهم ڪري ٿو، جنهن تي مختلف شعبن ۾ تحقيق ڪندڙن پاران وڏي پيماني تي ڀروسو آهي جنهن ۾ طبي، زرعي، ماحولياتي وغيره شامل آهن. , ڪمپيوٽر جا وسيلا، عوامي ڊيٽابيس، بايو انفارميٽڪ آن لائين ڪورسز وغيره. BMKCloud ۾ مختلف جين تشريح، ارتقائي جينياتي اوزار، اين سي آر اين اي، ڊيٽا جي معيار تي ضابطو، اسيمبلي، ترتيب ڏيڻ، ڊيٽا ڪڍڻ، ميوٽيشنز، شماريات، انگ اکر جنريٽر، تسلسل جو تجزيو، وغيره.
-
ڊي نوو بيڪٽيريل جينوم اسيمبلي
اسان هڪ مڪمل بيڪٽيريا جينوم اسيمبليء جي خدمت مهيا ڪندا آهيون، 0 فرق جي ضمانت. اهو ممڪن آهي ڊگھي پڙهڻ واري ترتيب واري ٽيڪنالاجيز کي ضم ڪرڻ سان، جهڙوڪ نانوپور ۽ PacBio اسيمبليءَ لاءِ ۽ مختصر-پڙهڻ واري ترتيب Illumina سان گڏ اسيمبلي جي تصديق ۽ ONT پڙهڻ جي غلطي جي اصلاح لاءِ. اسان جي خدمت مهيا ڪري ٿي اسيمبلي مان مڪمل بايو انفارميٽڪ ورڪ فلو، فنڪشنل تشريح، ۽ جديد بايو انفارميٽڪ تجزيو، مخصوص تحقيقي مقصدن کي پورو ڪندي. هي خدمت مختلف جينياتي ۽ جينوميڪ مطالعي لاء درست حوالن جينوم جي ترقي کي قابل بنائي ٿو. اضافي طور تي، اهو ايپليڪيشنن لاء بنياد ٺاهي ٿو جهڙوڪ اسٽريٽ آپٽمائيزيشن، جينياتي انجنيئرنگ، ۽ مائڪروبيل ٽيڪنالاجي ڊولپمينٽ، سائنسي بصيرت ۽ بايو ٽيڪنالاجي جدت کي اڳتي وڌائڻ لاء قابل اعتماد ۽ خلا کان آزاد جينومڪ ڊيٽا کي يقيني بڻائي.
-
ننڍي RNA
ننڍڙا آر اين اي مختصر نان ڪوڊنگ آر اين اي جا قسم آهن جن جي سراسري ڊيگهه 18-30 nt آهي، جنهن ۾ miRNA، siRNA ۽ piRNA شامل آهن. اهي ننڍڙا آر اين اي وڏي پيماني تي مختلف حياتياتي عملن جهڙوڪ mRNA جي زوال، ترجمي جي روڪٿام، heterochromatin ٺهڻ وغيره ۾ ملوث هجڻ جي خبر ڏني وئي آهي. ننڍي RNA جي ترتيب واري تجزيي کي جانورن/ٻوٽن جي ترقي، بيماري، وائرس وغيره جي مطالعي ۾ وڏي پيماني تي لاڳو ڪيو ويو آهي. تسلسل تجزيو پليٽ فارم معياري تجزيو ۽ جديد ڊيٽا مائننگ تي مشتمل آهي. RNA-seq ڊيٽا جي بنياد تي، معياري تجزيو حاصل ڪري سگھي ٿو miRNA جي سڃاڻپ ۽ اڳڪٿي، miRNA ٽارگيٽ جين جي اڳڪٿي، تشريح ۽ اظهار جو تجزيو. ترقي يافته تجزيي کي قابل بنائي ٿو ڪسٽمائيز miRNA ڳولا ۽ ڪڍڻ، وين ڊاگرام نسل، miRNA ۽ ٽارگيٽ جين نيٽ ورڪ بلڊنگ.
-
NGS-WGS (Illumina/BGI)
NGS-WGS هڪ مڪمل جينوم ٻيهر ترتيب ڏيڻ واري تجزياتي پليٽ فارم آهي، جيڪو بايو مارڪر ٽيڪنالاجيز ۾ ڀرپور تجربي جي بنياد تي تيار ڪيو ويو آهي. هي آسان استعمال ڪرڻ وارو پليٽ فارم صرف چند بنيادي پيٽرولر کي ترتيب ڏيڻ سان هڪ مربوط تجزيي واري ڪم جي فلو کي جلدي جمع ڪرڻ جي اجازت ڏئي ٿو، جيڪو ڊي اين اي ترتيب ڏيڻ واري ڊيٽا لاءِ ٺهڪي ٿو جيڪو Illumina پليٽ فارم ۽ BGI ترتيب واري پليٽ فارم ٻنهي مان ٺاهيل آهي. هي پليٽ فارم اعلي ڪارڪردگي ڪمپيوٽنگ سرور تي لڳايو ويو آهي، جيڪو تمام محدود وقت ۾ انتهائي موثر ڊيٽا تجزيي کي طاقت ڏئي ٿو. ذاتي ٿيل ڊيٽا مائننگ معياري تجزيي جي بنياد تي دستياب آهي، بشمول ميوٽيڊ جين سوال، پي سي آر پرائمر ڊيزائن، وغيره.
-
mRNA (حوالو)
ٽرانسڪرپوم جينومڪ جينياتي معلومات ۽ حياتياتي ڪم جي پروٽوم جي وچ ۾ ڳنڍيل آهي. ٽرانسپشن جي سطح جو ضابطو سڀ کان اهم ۽ سڀ کان وڏي پيماني تي اڀياس ڪيل تنظيمن جو طريقو آهي. ٽرانسڪرپٽوم جي ترتيب ڪنهن به وقت يا ڪنهن به حالت ۾ ٽرانسڪرپٽ کي ترتيب ڏئي سگهي ٿي، هڪ واحد نيوڪليوٽائيڊ جي صحيح قرارداد سان. اهو متحرڪ طور تي جين ٽرانسڪرپشن جي سطح کي ظاهر ڪري سگهي ٿو، هڪ ئي وقت ۾ نادر ۽ عام ٽرانسڪرپشن جي سڃاڻپ ۽ مقدار جو اندازو لڳائي سگهي ٿو، ۽ ساخت جي معلومات مهيا ڪري ٿو. نموني مخصوص نقل.
هن وقت، ٽرانسڪرپٽوم ترتيب ڏيڻ واري ٽيڪنالاجي کي وڏي پيماني تي استعمال ڪيو ويو آهي زراعت، دوائون ۽ ٻين تحقيقي شعبن ۾، جن ۾ جانورن ۽ ٻوٽن جي ترقي جي ضابطي، ماحولياتي موافقت، مدافعتي رابطي، جين لوڪلائيزيشن، نسلن جينياتي ارتقاء ۽ تومور ۽ جينياتي بيماري جي سڃاڻپ شامل آهن.
-
Metagenomics (NGS)
هي تجزياتي پليٽ فارم شاٽگن ميٽگينوميڪ ڊيٽا تجزيي لاءِ ٺهيل آهي سالن جي تجربن جي بنياد تي. اهو مربوط ورڪ فلو تي مشتمل آهي جنهن ۾ مختلف عام طور تي گهربل ميٽاگينومڪس تجزيا شامل آهن جن ۾ ڊيٽا پروسيسنگ، اسپيسيز-ليول اسٽڊيز، جيني فنڪشن-ليول اسٽڊيز، ميٽگينوم بائننگ، وغيره شامل آهن. ان کان علاوه، ڪسٽمائيز ڊيٽا مائننگ ٽولز معياري تجزيي واري ڪم جي فلو تي دستياب آهن، جن ۾ جين ۽ نسل جا سوال شامل آهن. , پيرا ميٽر سيٽنگ, ذاتي شڪل پيدا ڪرڻ, وغيره.
-
LncRNA
ڊگھا نان ڪوڊنگ آر اين ايز (lncRNA) ھڪ قسم جا ٽرانسڪرپٽ آھن جن جي ڊگھائي 200 NT کان وڌيڪ آھي، جيڪي پروٽين کي ڪوڊ ڪرڻ جي قابل نه آھن. جمعي ثبوتن مان معلوم ٿئي ٿو ته اڪثر lncRNAs جي ڪارڪردگيءَ جو تمام گهڻو امڪان آهي. اعليٰ درجي جي ترتيب ڏيڻ واري ٽيڪنالاجيون ۽ بايو انفارميٽڪ تجزياتي اوزار اسان کي lncRNA جي ترتيبن ۽ پوزيشن جي معلومات کي وڌيڪ موثر انداز سان ظاهر ڪرڻ جي طاقت ڏين ٿا ۽ اسان کي اهم ريگيوليٽري ڪمن سان lncRNAs دريافت ڪرڻ جي هدايت ڪن ٿا. BMKCloud اسان جي گراهڪن کي تيز، قابل اعتماد ۽ لچڪدار lncRNA تجزيو حاصل ڪرڻ لاءِ اسان جي گراهڪن کي lncRNA ترتيب ڏيڻ واري تجزياتي پليٽ فارم مهيا ڪرڻ تي فخر آهي.
-
GWAS
جينوم-وائڊ ايسوسيئيشن اسٽڊي (GWAS) جو مقصد جينياتي مختلف قسمن (جينوٽائپ) کي سڃاڻڻ جو مقصد آهي جيڪو مخصوص خاصيتن (فينوٽائپ) سان لاڳاپيل آهي. GWA مطالعو تحقيق ڪري ٿو جينياتي نشانن کي وڏي تعداد ۾ ماڻهن جي پوري جينوم کي پار ڪري ٿو ۽ آبادي جي سطح تي شمارياتي تجزيي ذريعي جينوٽائپ-فينوٽائپ ايسوسيئيشن جي اڳڪٿي ڪري ٿو. مڪمل-جينوم جي ترتيب ممڪن طور تي سڀني جينياتي مختلف قسمن کي ڳولي سگھي ٿو. فينوٽائپڪ ڊيٽا سان گڏ، GWAS کي پروسيس ڪري سگهجي ٿو فينوٽائپ سان لاڳاپيل SNPs، QTLs ۽ اميدوار جين جي سڃاڻپ ڪرڻ لاء، جيڪو مضبوط طور تي جديد جانورن / ٻوٽن جي نسل کي مضبوط ڪري ٿو. SLAF هڪ خود ترقي يافته آسان جينوم ترتيب ڏيڻ واري حڪمت عملي آهي، جيڪا دريافت ڪري ٿي جينوم وسيع ورهايل نشانن، SNP. اهي SNPs، ماليڪيولر جينياتي نشانن جي طور تي، عمل ڪري سگھجن ٿا انجمن جي مطالعي لاءِ ٽارگيٽ ڪيل خاصيتن سان. اهو هڪ قيمتي اثرائتي حڪمت عملي آهي جنهن جي سڃاڻپ ۾ پيچيده خاصيتن سان لاڳاپيل جينياتي تغيرات.
-
نانوپور مڪمل ڊگھائي ٽرانسڪرومڪس
جاندارن ۾ پيچيده ۽ متغير متبادل isoforms جين جي اظهار ۽ پروٽين جي تنوع کي منظم ڪرڻ لاءِ اهم جينياتي ميڪانيزم آهن. ٽرانسڪرپٽ ڍانچي جي صحيح سڃاڻپ جين ايڪسپريس ريگيوليشن جي نمونن جي گهري مطالعي جو بنياد آهي. نانوپور جي ترتيب واري پليٽ فارم کي ڪاميابيءَ سان ٽرانسڪرٽومڪ اسٽڊي کي isoform-level تائين پهچايو آهي. هي تجزياتي پليٽ فارم تيار ڪيو ويو آهي RNA-Seq ڊيٽا جو تجزيو ڪرڻ لاءِ نانوپور پليٽ فارم تي تيار ڪيل ريفرنس جينوم جي بنياد تي، جيڪو حاصل ڪري ٿو معيار ۽ مقداري تجزيو ٻنهي جين ليول ۽ ٽرانسڪرپٽس جي سطح ۾.
-
سرڪ-آر اين اي
سرڪيولر RNA(circRNA) هڪ قسم جو نان ڪوڊنگ RNA آهي، جيڪي تازو مليا آهن جيڪي ريگيوليٽري نيٽ ورڪن ۾ اهم ڪردار ادا ڪن ٿا جيڪي ترقي ڪرڻ، ماحولياتي مزاحمت وغيره ۾ شامل آهن. لڪير RNA ماليڪيولن کان الڳ، مثال طور mRNA، lncRNA، 3′ ۽ 5′. circRNA جي پڇاڙيءَ کي پاڻ ۾ ملائي هڪ گول ڍانچي ٺاهي ٿي، جيڪا انهن کي هضم ٿيڻ کان بچائي ٿي exonuclease ۽ لڪير آر اين اي جي اڪثر کان وڌيڪ مستحڪم آهن. CircRNA کي جين جي اظهار کي منظم ڪرڻ ۾ مختلف ڪم مليا آهن. CircRNA ceRNA طور ڪم ڪري سگھي ٿو، جيڪو miRNA کي مقابلي سان پابند ڪري ٿو، جيڪو miRNA اسپنج طور سڃاتو وڃي ٿو. CircRNA تسلسل تجزيي پليٽ فارم circRNA جي جوڙجڪ ۽ اظهار جي تجزيي، ٽارگيٽ جي اڳڪٿي ۽ گڏيل تجزيي کي ٻين قسمن جي آر اين اي ماليڪيولز سان طاقت ڏئي ٿو.
-
بي ايس اي
بلڪ ٿيل سيگريگينٽ تجزيي پليٽ فارم تي مشتمل آهي هڪ قدم معياري تجزيي ۽ ترقي يافته تجزيي سان ڪسٽمائيز پيٽرولر سيٽنگ. BSA هڪ ٽيڪنڪ آهي جيڪو فوري طور تي فينوٽائپ سان لاڳاپيل جينياتي نشانن جي سڃاڻپ ڪرڻ لاء استعمال ڪيو ويو آهي. BSA جي مکيه ورڪ فلو تي مشتمل آهي: 1. انتهائي مخالف فينو ٽائپس سان ماڻهن جي ٻن گروپن کي چونڊڻ؛ 2. DNA، RNA يا SLAF-seq (Developed by Biomarker) کي گڏ ڪرڻ لاءِ سڀني فردن جي ڊي اين اي جا ٻه ٽڪرا ٺاهڻ؛ 3. حوالن جينوم جي خلاف يا وچ ۾ فرق جي ترتيبن جي نشاندهي ڪرڻ، 4. ED ۽ SNP-index algorithm پاران اميدوار سان ڳنڍيل علائقن جي اڳڪٿي ڪرڻ؛ 5. اميدوارن جي علائقن ۾ جينز تي فنڪشنل تجزيو ۽ افزودگي وغيره. ڊيٽا ۾ وڌيڪ ترقي يافته مائننگ جنهن ۾ جينياتي مارڪر اسڪريننگ ۽ پرائمر ڊيزائن پڻ موجود آهن.
-
ايمپليڪون (16S/18S/ITS)
Amplicon (16S/18S/ITS) پليٽ فارم مائڪروبيل تنوع پروجيڪٽ جي تجزيي ۾ سالن جي تجربي سان تيار ڪيو ويو آهي، جنهن ۾ معياري بنيادي تجزيا ۽ ذاتي ٿيل تجزيا شامل آهن: بنيادي تجزيي موجوده مائڪروبيل تحقيق جي مرڪزي ڌارا جي تجزياتي مواد کي ڍڪيندي آهي، تجزيو مواد ڀرپور ۽ جامع آهي، ۽ تجزيو جا نتيجا پروجيڪٽ رپورٽن جي صورت ۾ پيش ڪيا ويا آهن؛ ذاتي ڪيل تجزيو جو مواد متنوع آهي. نموني چونڊجي سگھجن ٿا ۽ بنيادي تجزيي جي رپورٽ ۽ تحقيق جي مقصد جي مطابق لچڪدار نموني مقرر ڪري سگھجن ٿيون، ذاتي ضرورتن کي محسوس ڪرڻ لاء. ونڊوز آپريٽنگ سسٽم، سادو ۽ تيز.
-
ارتقائي جينياتي
ارتقائي جينياتي هڪ جامع ترتيب ڏيڻ واري خدمت آهي جيڪا ماڻهن جي هڪ وڏي گروهه جي اندر ارتقاء جي هڪ بصيرت سان تعبير پيش ڪرڻ لاءِ تيار ڪئي وئي آهي، جينياتي تبديلين جي بنياد تي، بشمول SNPs، InDels، SVs، ۽ CNVs. هي خدمت آباديءَ جي ارتقائي تبديلين ۽ جينياتي خاصيتن کي واضح ڪرڻ لاءِ گهربل سڀني ضروري تجزين تي مشتمل آهي، جنهن ۾ آبادي جي جوڙجڪ، جينياتي تنوع، ۽ فيلوجينيٽڪ رشتن جو جائزو شامل آهي. ان کان علاوه، اهو جين جي وهڪري تي اڀياس ڪري ٿو، موثر آبادي جي ماپ ۽ تڪرار جي وقت جو اندازو لڳائي ٿو. ارتقائي جينياتي اڀياس نسلن جي شروعات ۽ موافقت ۾ قيمتي بصيرت پيدا ڪن ٿا.
BMKGENE تي، اسان وڏي آباديءَ تي ارتقائي جينياتي اڀياس ڪرڻ لاءِ ٻه رستا پيش ڪريون ٿا: پوري-جينوم ترتيب ڏيڻ (WGS) کي ملازمت ڏيڻ يا گهٽ نمائندگي جينوم ترتيب ڏيڻ جو طريقو اختيار ڪرڻ، اندروني طور تي ترقي يافته مخصوص-لوڪس ايمپليفائيڊ فريگمينٽ (SLAF). جڏهن ته WGS ننڍڙن جينومن کي سوٽ ڪري ٿو، SLAF وڏي آباديءَ جي مطالعي لاءِ ڊگھي جينوم سان گڏ هڪ قيمتي متبادل طور اڀري ٿو، مؤثر طريقي سان ترتيب جي قيمتن کي گھٽ ڪري ٿو.
