ٻوٽن/جانورن جي پوري جينوم جي ترتيب
خدمتون خاصيتون
● لائبريري جي تياري معياري ٿي سگهي ٿي يا PCR-مفت
● 4 ترتيب ڏيڻ واري پليٽ فارمن ۾ دستياب آهي: Illumina NovaSeq، MGI T7، Nanopore Promethion P48، يا PacBio Revio.
● بايو انفارميٽڪ تجزيا متغيرات جي ڳولا تي مرکوز: SNP، InDel، SV ۽ CNV
سروس فائدا
●وسيع ماهر ۽ اشاعت رڪارڊ: 1000 کان وڌيڪ نسلن جي جينوم جي ترتيب ۾ گڏ ڪيل تجربي جي نتيجي ۾ 1000 کان وڌيڪ شايع ٿيل ڪيس 5000 کان وڌيڪ جي مجموعي اثر واري عنصر سان گڏ ٿيا آهن.
●جامع بايو انفارميٽڪس تجزيو: ويريشن ڪالنگ ۽ فنڪشن جي تشريح سميت.
● پوسٽ-سيلز سپورٽ:اسان جي وابستگي پروجيڪٽ جي مڪمل ٿيڻ کان اڳتي وڌي ٿي 3-مهينن کان پوءِ-سيل سروس جي مدت سان. هن وقت دوران، اسان پيش ڪريون ٿا پروجيڪٽ جي پيروي ڪرڻ، مشڪلاتن جي حل ۾ مدد، ۽ سوال ۽ جواب سيشن نتيجن سان لاڳاپيل ڪنهن به سوالن کي حل ڪرڻ لاء.
●جامع تشريح: اسان ڪيترن ئي ڊيٽابيس استعمال ڪريون ٿا فعال طور تي جين کي سڃاڻپ ٿيل مختلف تبديلين سان تشريح ڪرڻ لاءِ ۽ لاڳاپيل افزودگي تجزيي کي انجام ڏيڻ لاءِ، ڪيترن ئي تحقيقي منصوبن تي بصيرت مهيا ڪرڻ.
خدمت جي وضاحت
| مختلف قسمن جي سڃاڻپ ڪئي وڃي | ترتيب واري حڪمت عملي | سفارش ٿيل کوٽائي |
| SNP ۽ InDel | Illumina NovaSeq PE150 يا MGI T7 | 10x |
| SV ۽ CNV (گهٽ درست) | 30x | |
| SV ۽ CNV (وڌيڪ صحيح) | نانوپور پروم P48 | 20x |
| SNPs، Indels، SV ۽ CNV | PacBio Revio | 10x |
نموني جي گهرج
| ٽشو يا نڪتل نيوڪليڪ اسيد | Illumina/MGI | نانوپور | PacBio
| ||
| جانورن جو ويسرا | 0.5-1 گ | ≥ 3.5 گ
| ≥ 3.5 گ
| ||
| جانورن جي عضون | ≥ 5 جي
| ≥ 5 جي
| |||
| ممالين جو رت | 1.5 ايم ايل | ≥ 0.5 ايم ايل
| ≥ 5 ملي
| ||
| پولٽري / مڇي جو رت | ≥ 0.1 ايم ايل
| ≥ 0.5 ايم ايل
| |||
| ٻوٽو- تازو پنو | 1-2 جي | ≥ 2 جي
| ≥ 5 جي
| ||
| ڪلچرل سيلز |
| ≥ 1x107
| ≥ 1x108
| ||
| حشرات جو نرم بافتو/انفرادي | 0.5-1 گ | ≥ 1 گ
| ≥ 3 جي
| ||
| ڪڍيل ڊي اين اي
| ڪنسنٽريشن: ≥ 1 ng/ µL مقدار: ≥ 30 ng محدود يا ڪابه تباهي يا آلودگي
| توجهه رقم
OD260/280
OD260/230
محدود يا ڪابه تباهي يا آلودگي
| ≥ 40 ng/ µL 4 µg / وهڪري سيل / نمونو
1.7-2.2
≥1.5 | توجهه رقم
OD260/280
OD260/230
محدود يا ڪابه تباهي يا آلودگي | ≥ 50 ng/ µL 10 µg/ فلو سيل/ نمونو
1.7-2.2
1.8-2.5 |
| PCR-مفت لائبريري جي تياري: ڪنسنٽريشن≥ 40 اين جي / µL رقم ≥ 500 اين | |||||
سروس ڪم فلو
نموني پهچائڻ
ڊي اين اي ڪڍڻ
لائبريري جي تعمير
تسلسل
ڊيٽا جو تجزيو
ڊيٽا پهچائڻ
ھيٺ ڏنل تجزيو شامل آھي:
- خام ڊيٽا جي معيار جو ڪنٽرول
- جينوم جي حوالي سان ترتيب ڏيڻ جا انگ اکر
- مختلف قسم جي سڃاڻپ: SNP، InDel، SV ۽ CNV
- مختلف قسمن جي فنڪشنل تشريح
جينوم جي حوالي سان ترتيب ڏيڻ جا انگ اکر - ترتيب جي کوٽائي جي ورڇ
ڪيترن ئي نمونن جي وچ ۾ SNP ڪالنگ
InDel جي سڃاڻپ - CDS علائقي ۾ InDel جي ڊيگهه جا انگ اکر ۽ جينوم وسيع علائقي
جينوم ۾ مختلف تقسيم - سرڪوس پلاٽ
جين جي فنڪشنل تشريح جي سڃاڻپ مختلف قسمن سان - جين آنٽولوجي
چائي، ق. وغيره. (2023) 'A glutathione S-transferase GhTT19 گلن جي پنن جي رنگن کي طئي ڪري ٿو ڪپهه ۾ anthocyanin accumulation کي ريگيوليشن ذريعي'، پلانٽ بايو ٽيڪنالاجي جرنل، 21(2)، ص. 433. doi: 10.1111/PBI.13965.
چينگ، ايڇ وغيره. (2023) 'Chromosome-level wild Hevea brasiliensis genome روزي ڏيندو آهي نوان اوزار جينومڪ-اسسٽنٽ breeding and valuable loci to elevate rabber yeld'، پلانٽ بائيو ٽيڪنالاجي جرنل، 21(5)، pp. 1058-1072. doi: 10.1111/PBI.14018.
لي، اي وغيره. (2021) 'جينوم آف دي ايسٽورائن اوسٽر آبهوا جي اثر ۽ موافقت واري پلاسٽيٽي ۾ بصيرت مهيا ڪري ٿو'، ڪميونيڪيشن بائيولاجي 2021 4:1، 4(1)، پي پي. 1-12. doi: 10.1038/s42003-021-02823-6.
زينگ، ٽي وغيره. (2022) ’تجزيو جو جينوم ۽ ميٿيليشن تبديلين ۾ چيني انديجنس ڪڪڙن ۾ وقت سان گڏ نسلن جي تحفظ ۾ بصيرت مهيا ڪري ٿي‘، ڪميونيڪيشن بائلاجي، 5(1)، پي پي. 1-12. doi: 10.1038/s42003-022-03907-7.
