نانوپور مڪمل ڊگھائي ٽرانسڪروم

نانوپور ٽرانسڪرپٽوم تسلسل مڪمل ڊگھي سي ڊي اين ايز کي ترتيب ڏيڻ لاءِ هڪ طاقتور طريقو آهي، ٽرانسڪرپٽ آئسفارمز کي صحيح طور تي سڃاڻڻ ۽ مقدار کي درست ڪرڻ. BMKCloud Nanopore Full-Length Transcriptome Pipeline ڊزائين ڪيل آھي RNA-Seq ڊيٽا جو تجزيو ڪرڻ لاءِ نانوپور پليٽ فارم تي ھڪڙي اعليٰ معيار جي چڱيءَ طرح بيان ڪيل ريفرنس جينوم جي خلاف، جين ۽ ٽرانسڪرپٽ جي سطح تي معيار ۽ مقداري تجزيو مهيا ڪري. معيار جي ڪنٽرول کان پوء، مڪمل ڊگھائي غير چيمرڪ (FLNC) ترتيبون حاصل ڪيون وينديون آهن ۽ اتفاق جي ترتيبن کي ريفرنس جينوم ڏانهن نقشو ڪيو ويو آهي ته غير ضروري ٽرانسپشن کي هٽائڻ لاء. هن ٽرانسڪرپٽ سيٽ مان، اظهار کي مقدار ۾ بيان ڪيو ويو آهي ۽ مختلف طور تي بيان ڪيل جين ۽ ٽرانسپشن جي سڃاڻپ ۽ فنڪشنل طور تي بيان ڪيل آهن. پائپ لائن ۾ متبادل پوليڊينيليشن (APA) تجزيو، متبادل ورهائڻ جو تجزيو، سادي تسلسل ورجائي (SSR) تجزيو، lncRNA جي اڳڪٿي ۽ لاڳاپيل هدف، ڪوڊنگ جي تسلسل جي اڳڪٿي (سي ڊي ايس)، جين خانداني تجزيي، ٽرانسپشن فيڪٽر جي تجزيي، نمبرن جو تجزيو. ۽ فنڪشنل تشريح نقل