● پولي-A mRNA جي قبضي کان پوءِ سي ڊي اين اي جي جوڙجڪ ۽ لائبريري جي تياري
● مڪمل ڊگھائي ٽرانسڪرپٽس جي ترتيب
● بايو انفارميٽڪ تجزيا هڪ ريفرنس جينوم کي ترتيب ڏيڻ جي بنياد تي
● بايو انفارميٽڪ تجزيي ۾ نه رڳو جين ۽ آئسوفارم جي سطح تي اظهار شامل آهي پر lncRNA، جين فيوزن، پولي-ايڊينيليشن ۽ جين جي جوڙجڪ جو تجزيو پڻ شامل آهي.
●isoform سطح تي اظهار جي مقدار: تفصيلي ۽ صحيح اظهار جي تجزيي کي چالو ڪرڻ، تبديلي کي ظاهر ڪرڻ جيڪا پوري جين اظهار جو تجزيو ڪرڻ وقت نقاب پوش ٿي سگهي ٿي
●گھٽ ڊيٽا جي مطالبن:ايندڙ نسل جي ترتيب (NGS) جي مقابلي ۾، نانوپور جي ترتيب گهٽ ڊيٽا جي گهرج جي نمائش ڪري ٿي، جين اظهار جي مقدار جي برابري جي برابر سطح جي اجازت ڏئي ٿي ننڍي ڊيٽا سان.
●اظهار جي مقدار جي اعلي درستگي: ٻئي جين ۽ isoform سطح تي
●اضافي ٽرانسڪيڪل معلومات جي سڃاڻپ: متبادل polyadenylation، فيوزن جينس ۽ lcnRNA ۽ انهن جي ٽارگيٽ جينس
●وسيع ماهر: اسان جي ٽيم 850 کان وڌيڪ نانوپور مڪمل ڊگھائي ٽرانسڪروم پروجيڪٽ مڪمل ڪرڻ ۽ 8,000 کان وڌيڪ نمونن تي عمل ڪندي، هر پروجيڪٽ لاءِ تجربو جو خزانو آڻيندي.
●پوسٽ-سيلز سپورٽ: اسان جي وابستگي پروجيڪٽ جي مڪمل ٿيڻ کان اڳتي وڌي ٿي 3-مهيني بعد-سيل سروس جي مدت سان. هن وقت دوران، اسان پيش ڪريون ٿا پروجيڪٽ جي پيروي ڪرڻ، مشڪلاتن جي حل ۾ مدد، ۽ سوال ۽ جواب سيشن نتيجن سان لاڳاپيل ڪنهن به سوالن کي حل ڪرڻ لاء.
لائبريري | ترتيب واري حڪمت عملي | سفارش ٿيل ڊيٽا | معيار ڪنٽرول |
پولي الف کي وڌايو | Illumina PE150 | 6/12 جي بي | سراسري معيار جو نمبر: Q10 |
اتفاق (ng/μl) | رقم (μg) | پاڪائي | سالميت |
≥ 100 | ≥ 1.0 | OD260/280=1.7-2.5 OD260/230=0.5-2.5 جيل تي ڏيکاريل محدود يا ڪو پروٽين يا ڊي اين اي آلودگي. | ٻوٽن لاءِ: RIN≥7.0؛ جانورن لاءِ: RIN≥7.5؛ 5.0≥28S/18S≥1.0؛ محدود يا بي بنياد بلندي |
● ٻوٽا:
روٽ، اسٽيم يا پيٽل: 450 ملي گرام
پتي يا ٻج: 300 ملي گرام
ميوو: 1.2 گ
● جانور:
دل يا آنت: 300 mg
ويسيرا يا دماغ: 240 ملي گرام
عضلات: 450 mg
هڏا، وار يا جلد: 1 گرام
● ارٿروپڊس:
حشرات: 6g
ڪرسٽاسيا: 300 ملي گرام
● سڄو رت: 1 ٽيوب
● سيلز: 106 سيلز
ڪنٽينر: 2 ml سينٽرفيوج ٽيوب (ٽين ورق جي سفارش نه ڪئي وئي آهي)
نموني ليبلنگ: گروپ + نقل ڪريو مثال طور A1، A2، A3؛ B1، B2، B3.
ترسيل:
1. خشڪ برف: نمونن کي بيگز ۾ ڀريل ۽ خشڪ برف ۾ دفن ڪرڻ جي ضرورت آهي.
2. RNAstable tubes: RNA جا نمونا RNA اسٽيبلائيزيشن ٽيوب (مثال طور RNAstable®) ۾ خشڪ ڪري سگھجن ٿا ۽ ڪمري جي گرمي پد تي موڪليا وڃن ٿا.
● خام ڊيٽا پروسيسنگ
● نقل جي سڃاڻپ
● متبادل splicing
● جين ليول ۽ آئسفارم ليول ۾ اظهار جي مقدار
● اختلافي اظهار جو تجزيو
● فنڪشن تشريح ۽ افزودگي (DEGs ۽ DETs)
متبادل ورهائڻ جو تجزيو متبادل Polyadenylation Analysis (APA)
lncRNA اڳڪٿي
ناول جين جي تشريح
DETs جي ڪلسترنگ
DEGs ۾ پروٽين-پروٽين نيٽ ورڪ
BMKGene جي نانپور مڪمل ڊگھائي mRNA ترتيب ڏيڻ جي خدمتن پاران ڪيل پيش رفتن جي ڳولا ڪريو پبليڪيشن جي تيار ڪيل مجموعي ذريعي.
گونگ، بي وغيره. (2023) 'ايپيگينيٽڪ ۽ ٽرانسڪرپشن ايڪٽيوشن آف دي سيڪريٽري ڪائناس FAM20C as an oncogene in glioma'، جرنل آف جينيٽيڪس اينڊ جينومڪس، 50(6)، پي پي. 422-433. doi: 10.1016/J.JGG.2023.01.008.
هن، Z. et al. (2023) IFN-γ کي لففوسائٽس جي مڪمل ڊگھائي ٽرانسڪرپٽم جي تسلسل کي ظاهر ڪري ٿو ته 1-skewed مدافعتي ردعمل ۾ flounder (Paralichthys olivaceus)، مڇي ۽ شيلفش امونالوجي، 134، ص. 108636. doi: 10.1016/J.FSI.2023.108636.
ما، Y. وغيره. (2023) 'PacBio جو تقابلي تجزيو ۽ ONT RNA ترتيب ڏيڻ جا طريقا Nemopilema Nomurai زهر جي سڃاڻپ لاءِ'، جينومڪس، 115(6)، ص. 110709. doi: 10.1016/J.YGENO.2023.110709.
يو، ڊي وغيره. (2023) 'نانو-سيڪ تجزيي ظاهر ڪري ٿو مختلف فنڪشنل رجحان جي وچ ۾ exosomes ۽ microvesicles مان نڪتل hUMSC'، اسٽيم سيل ريسرچ اينڊ تھراپي، 14(1)، پي پي. 1-13. doi: 10.1186/S13287-023-03491-5/TABLES/6.