Eukaryotic mRNA Analysis (Reference based and de novo options دستياب)
هي پائپ لائن NGS RNA-Seq ڊيٽا کي ان پٽ طور استعمال ڪري ٿي ۽ ڪيترن ئي هيٺئين دڙي جي تجزين مان نتيجا پيدا ڪري ٿي جنهن ۾ شامل آهي پر ان تائين محدود ناهي: ڊيٽا جي معيار جي ترتيب کي ترتيب ڏيڻ،نئونٽرانسپشن سائيٽ جي تشريح، variable splicing analysis، differential expression analysis، function anotation and enrichment analysis.
ڊگهو غير ڪوڊنگ آر اين اي تجزيو
ڊگھا نان ڪوڊنگ RNAs (lncRNA) نان ڪوڊنگ ٽرانسڪرپٽس آھن جن جي ڊگھائي 200 nt کان وڌيڪ آھي ۽ ڪروميٽين جي تنظيم ۽ ضابطي ۾ ڪردار ادا ڪرڻ لاءِ سڃاتل آھن. هاءِ-ٿرو پُٽ سيڪوئنسنگ ٽيڪنالاجيز ۽ بايو انفارميٽڪ اسان کي lncRNA sequences ۽ پوزيشننگ معلومات کي سمجھڻ جي سگهه ڏني آهي ته جيئن lncRNA کي اهم ريگيوليٽري ڪمن سان سڃاڻي سگهجي. هي پائپ لائن lncRNA تجزيو مهيا ڪري ٿي ان کان علاوه تجزين کان علاوه يوڪريوٽڪ mRNA تجزيي پائپ لائن ۾ ذڪر ڪيل.
16S/18S/ITS amplicon ترتيب
Amplicon Sequencing microbial diversity analysis pipeline ترقي ڪئي وئي سالن جي تجربي جي بنياد تي مائڪروبيل تنوع پروجيڪٽ جي تجزيي ۾. پائپ لائن ۾ معياري بنيادي تجزيو شامل آهي، جيڪو موجوده مائڪروبيل ريسرچ ۽ ذاتي ڪيل تجزيي جي مکيه وهڪرو تجزيو مواد کي ڍڪيندو آهي. تجزياتي رپورٽ امير ۽ جامع آهي، متنوع ذاتي تجزيو انجام ڏيڻ جي اختيار سان. اضافي طور تي، نموني ۽ گروپن کي اڏامي تي تبديل ڪري سگھجي ٿو اضافي ڪسٽمائيزيشن ۽ ڪنٽرول لاء.
شاٽگن Metagenomics تجزيو
شاٽگن ميٽيگينوميڪ تجزيي پائپ لائن NGS ڊيٽا استعمال ڪري ٿي مخلوط جينومڪ مواد مان نڪتل ماحولياتي نموني مان. شامل ڪيل تجزيا تفصيلي معلومات مهيا ڪن ٿا نسلن جي تنوع ۽ گهڻائي، آبادي جي جوڙجڪ، فيلوجينيٽڪ رشتي، فنڪشنل جينز، ۽ ماحولياتي عنصر سان رابطي واري نيٽ ورڪ.
NGS-WGS مختلف تجزيو
NGS-WGS Variant Analysis هڪ مربوط مختلف قسم جي ڳولڻ واري پائپ لائن آهي جيڪا ڊيٽا جي معيار جي ڪنٽرول، ترتيب جي ترتيب، تشريح، ۽ جين ميوٽيشن تجزيو انجام ڏئي ٿي. پائيپ لائين SNP ۽ InDel جي ڳولا لاءِ GATK جي بهترين طريقن جي پيروي ڪري ٿي ۽ ساخت جي مختلف قسم جي ڪالنگ لاءِ Manta استعمال ڪري ٿي.
جينوم وائڊ ايسوسيئيشن اسٽڊي (GWAS)
GWAS پائيپ لائين ھڪڙو ھيٺئين وهڪرو تجزيو آھي جيڪو اڳ ۾ ٺاھيو ويو VCF فائلون ۽ لاڳاپيل فينو ٽائپ ڊيٽا ماڻھن جي ھڪڙي گروپ لاءِ ان پٽ جي طور تي. مخصوص شمارياتي طريقن کي استعمال ڪندي، GWAS جو مقصد جينووم-وائڊ نيوڪليوٽيڊ مختلف حالتن کي پڌرو ڪرڻ جو مقصد فينوٽائپڪ اختلافن سان لاڳاپيل آهي. اهو پيچيده انساني بيمارين ۽ ٻوٽن ۽ جانورن ۾ پيچيده خاصيتن سان لاڳاپيل فعلي جين کي ڳولڻ ۾ اهم ڪردار ادا ڪري ٿو.
بلڪ علحدگيءَ جو تجزيو (BSA)
BSA تجزيي ۾ ماڻهن کي پولنگ شامل آهي انتهائي فينوٽائپڪ خاصيتن سان گڏ هڪ الڳ آبادي کان. پول ٿيل نمونن جي وچ ۾ فرق واري جڳهه جي مقابلي سان، هي طريقو تيزيء سان ٽارگيٽ جين سان لاڳاپيل ويجهي ڳنڍيل ماليڪيول مارڪرز کي سڃاڻي ٿو. وڏي پيماني تي ٻوٽن ۽ جانورن جي جينياتي نقشي ۾ استعمال ڪيو ويو آهي، اهو مارڪر جي مدد سان نسل جي لاء هڪ قيمتي اوزار آهي.
ارتقائي جينياتي تجزيي
Evolutionary Genetics Analysis Workflow BMKGENE جي جينياتي ارتقا جي منصوبن ۾ وسيع تجربي جو فائدو وٺي ٿو ۽ ان ۾ شامل آهي phylogenetic Tree Construction, linkage disequilibrium analysis, genetic diversity assessment, Selective sweep identification, kinship analysis, principal component, and characterization structuralization.
