●پليٽ فارم:Illumina NovaSeq 6000 ۽ NovaSeq X Plus
●ترتيب ڏيڻ جا طريقا:PE150 ۽ PE250
●ترتيب ڏيڻ کان اڳ لائبريرين جو معيار ڪنٽرول
●ڊيٽا کي ترتيب ڏيڻ QC ۽ پهچائڻ:QC رپورٽ جي ترسيل ۽ خام ڊيٽا فاسٽق فارميٽ ۾ ڊيملٽيپليڪسنگ ۽ فلٽر ڪرڻ کان پوءِ Q30 ريڊز
●تسلسل جي خدمتن جي استحڪام:گراهڪ لين، فلو سيل، يا گهربل ڊيٽا جي مقدار جي حساب سان ترتيب ڏيڻ جو انتخاب ڪري سگھي ٿو (جزوي لين جي ترتيب).
●Illumina تسلسل پليٽ فارم تي وسيع تجربو:مختلف قسمن سان هزارين بند منصوبن سان.
●QC رپورٽ ترتيب ڏيڻ جي ترسيل:معيار جي ميٽرڪس، ڊيٽا جي درستگي ۽ ترتيب واري منصوبي جي مجموعي ڪارڪردگي سان.
●بالغن جي ترتيب جي عمل:مختصر گھمڻ واري وقت سان.
●سخت معيار ڪنٽرول: اسان مسلسل اعلي معيار جي نتيجن جي پهچائڻ جي ضمانت ڏيڻ لاء سخت QC گهرجون لاڳو ڪريون ٿا.
پليٽ فارم | فلو سيل | تسلسل موڊ | يونٽ | تخميني پيداوار |
NovaSeq X | 10B (8 لين) | پي 150 | سنگل لين جزوي رستو | 375 جي بي / لين |
25B (8 لين) | پي 150 | سنگل لين جزوي رستو | 1000 جي بي / لين | |
NovaSeq 6000 | ايس پي فلو سيل (2 لين) | پي 250 | فلو سيل سنگل لين جزوي رستو | 325-400 M پڙهائي / لين |
S4 فلو سيل (4 لين) | پي 150 | فلو سيل سنگل لين جزوي رستو | ~800 جي بي / لين |
ڊيٽا جي رقم (X) | ڪنسنٽريشن (qPCR/nM) | حجم | |
جزوي لين جي ترتيب
| X ≤ 10 جي بي | ≥ 1 nM | ≥ 25 μl |
10 جي بي < X ≤ 50 جي بي | ≥ 2 nM | ≥ 25 μl | |
50 جي بي < X ≤ 100 جي بي | ≥ 3 nM | ≥ 25 μl | |
X > 100 جي بي | ≥ 4 nM | ≥ 25 μl | |
لين جي ترتيب | في لين | ≥ 1.5 nM / لائبريري پول | ≥ 25 μl / لائبريري پول |
ڪنسنٽريشن ۽ مجموعي رقم جي اضافي ۾، هڪ مناسب چوٽي نموني پڻ گهربل آهي.
نوٽ: گھٽ تنوع واري لائبريرين جي لين جي ترتيب کي مضبوط بنيادي ڪالنگ کي يقيني بڻائڻ لاءِ PhiX اسپيڪ-ان جي ضرورت آهي.
اسان تجويز ڪريون ٿا اڳ-پول ٿيل لائبريرين کي نموني طور پيش ڪريو. جيڪڏهن توهان کي لائبريري پولنگ ڪرڻ لاءِ BMKGENE جي ضرورت آهي، مهرباني ڪري حوالو ڏيو
جزوي لين جي ترتيب لاءِ لائبريري جون گهرجون.
مکيه چوٽي 300-450 بي پي جي اندر هجڻ گهرجي.
لائبريرين کي هڪ واحد مکيه چوٽي هجڻ گهرجي، نه اڊاپٽر آلودگي ۽ نه پرائمر ڊائمر.
لائبريري جي معيار تي هڪ رپورٽ ترتيب ڏيڻ، لائبريري جي رقم جو اندازو لڳائڻ، ۽ تقسيم کان اڳ مهيا ڪئي وئي آهي.
جدول 1. ڊيٽا کي ترتيب ڏيڻ تي شماريات.
نموني ID | BMKID | خام پڙهي ٿو | خام ڊيٽا (bp) | صاف پڙهيل (٪) | Q20(%) | Q30(%) | جي سي (٪) |
سي_01 | BMK_01 | 22,870,120 | 6,861,036,000 | 96.48 | 99.14 | 94.85 | 36.67 |
سي_02 | BMK_02 | 14,717,867 | 4,415,360,100 | 96.00 | 98.95 | 93.89 | 37.08 |
شڪل 1. معيار جي ورڇ هر نموني ۾ پڙهڻ سان گڏ
شڪل 2. بنيادي مواد جي ورڇ
شڪل 3. ڊيٽا جي ترتيب ۾ پڙهڻ واري مواد جي ورڇ