ڊي اين اي / آر اين اي جي ترتيب ڏيڻ-پاپوبيو تسلسل
خاصيتون
پيڪبيو جي تسلسل تي ٻه ترتيب ڏيڻ وارا طريقا: لڳاتار ڊگها پڙهو (CLR) ۽ سرڪل اتفاق راء (سي سي ايس)
| تسلسل واري موڊ | لائبرور جو ٽول | نظرياتي ڊيٽاپيداوار (في سيل) | اڪيلو بنياددرستگي | درخواستون |
| ڪلر | 20kb، 30 ڪلو، وغيره وغيره | 80 GB کان 130 GB تائين | ويجخو مٽ. 85٪ | ڊي نوو، ايس وي ڪالنگ، وغيره |
| سي سيز | 15-20 KB | 14 کان 40 GB / سيل (سيڪيل II) 70 کان 110 GB / سيل (ريويو) نمونن تي منحصر آهي | ويجخو مٽ. 99٪ | ڊي نوو، SNP / انڊر / ايس وي ڪالنگ، اسو-سي ڪي، |
نظرثاني ۽ تسلسل II جي ڪارڪردگي ۽ خاصيتن جو مقابلو
| شرط | تسلسل II سسٽم | ريويو سسٽم | واڌارو |
| وڌيڪ کثافت | 8 ملين ZMWS | 25 ملين ZMWS | 3x |
| آزاد مرحلن | 1 | 4 | 4x |
| نن run و وقت | 30 ڪلاڪ | 24 ڪلاڪ | 1.25X |
| 30x HiIII انساني جينوس / سال | 88 | 1،300 | 15x مجموعي طور تي |
خدمت جو ڪو فائدو
● پيڪبيو جي ترتيب ڏيڻ واري پلاٽنگ پليٽ فارم تي 8 سالن کان وڌيڪ هزارين منصوبن سان گڏ مختلف قسمن سان.
● مڪمل طور تي وڌايل پيڪيو جي ترتيب سان پيڪنگنگ پليٽ فارم سان ليس آهي، ريويو ڪافي ترتيب ڏيڻ جي ضمانت جي ضمانت ڏي.
● تيز رفتار وقت جي چوڌاري، وڌيڪ ڊيٽا جي پيداوار ۽ وڌيڪ صحيح ڊيٽا.
● سوين اثرائتي پيڪبيو بنياد تي اشاعتن ۾ حصو ڏنو.
نموني جون گهرجون
| نموني جو قسم | رقم | تسلسل (ڪبوٽ®) | حجم | پاڪائي | ٻيا |
| جينومڪ ڊي اين اي | ڊيٽا جي ضرورت تي منحصر آهي | ≥50 ng / μl | ≥15μl | OD260 / 280 = 1.7-2.2؛ OD260 / 230 = 1.8-2.5؛ 260 NM تي صاف چوٽي،آلودگي نه | Contrations کي چٽائڻ جي ضرورت آھي |
| ڪل آر اين اي | ≥1.2μg | ≥120 NG / μl | ≥15μl | OD260 / 280 = 1.7-2.5؛ OD260 / 230 = 0.5-2.5؛آلودگي نه | رائن ويل 7.5 5 ≥28s / 18s≥1 |
سروس ورڪ فلو
نموني جي تياري
لائبريري جي اڏام
تلفظ
ڊيٽايلتيا
منصوبي جي ترسيل
1. گهر جي ڊيٽا جي پيداوار
63 سي سي ايس سيلز مان پيدا ڪيل ڊيٽا (26 قسمن کان)
| قيمت-PACBIO-CCS-15 KB | سرچ نامو | وڌ | منٽ | وچون |
| حاصلات - ذيلي (GB) | 421.12 | 544.27 | 221.38 | 426.58 |
| يو ڪيو ويو - سي سي (GB) | 25.93 | 38.59 | 10.86 | 25.43 |
| پوليمڪس اين 50 | 145،651 | 175،430 | 118،118 | 144،689 |
| SRERDES N50 | 17،509 | 23،924 | 12،485 | 17،584 |
| سي سي ايس اين 50 | 14،490 | 19،034 | 9،876 | 14،747 |
| سراسري لمبائي پوليمر | 67،995 | 89،379 | 49،664 | 66،433 |
| سراسري ڊيگهه-اکر | 15،866 | 21،036 | 11،657 | 16،012 |
| سراسري ڊيگهه سي سي ايس | 14،489 | 19،074 | 8،575 | 14،655 |
16 CLR سيلز مان پيدا ڪيل ڊيٽا (76 قسمن کان)
| ڊيٽا پيڪبيو-ڪلر 30kb | سرچ نامو | وڌ | منٽ | وچون |
| حاصلات - ذيلي (GB) | 142.20 | 291.40 | 50.55 | 142.49 |
| پوليمڪس اين 50 | 39،456 | 121،191 | 15،389 | 35،231 |
| SRERDES N50 | 28،490 | 41،012 | 14،430 | 29،063 |
| سراسري لمبائي پوليمر | 22،063 | 48،886 | 8،747 | 21،555 |
| سراسري ڊيگهه-اکر | 17،720 | 27،225 | 8،293 | 17،779 |
2. ڊيٽا qc - ڊيموڊيٽا جي پيداوار تي شماريات
| نمونو | سي سي ايس نمبر پڙهي ٿو | ڪل سي سي ايس بيس (بي پي) | سي سي ايس پڙهي ٿو N50 (بي پي) | سي سي ايس جو مطلب ڊگهو آهي (بي پي) | سي سي ايس تمام گهڻي پڙهائي (بي پي) | ماتحت جا بنياد (بي پي) | سي سي ايس جي شرح (٪) |
| pb_bmkxxxx | 3،444،159 | 54،164،122،586 | 15،728 | 15،726 | 36،110 | 863،326،330،465 | 6.27 |
