ڊي نوو بيڪٽيريل جينوم اسيمبلي
اسان هڪ مڪمل بيڪٽيريا جينوم اسيمبليء جي خدمت مهيا ڪندا آهيون، 0 فرق جي ضمانت. اهو ممڪن آهي ڊگھي پڙهڻ واري ترتيب واري ٽيڪنالاجيز کي ضم ڪرڻ سان، جهڙوڪ نانوپور ۽ PacBio اسيمبليءَ لاءِ ۽ مختصر-پڙهڻ واري ترتيب Illumina سان گڏ اسيمبلي جي تصديق ۽ ONT پڙهڻ جي غلطي جي اصلاح لاءِ. اسان جي خدمت مهيا ڪري ٿي اسيمبلي مان مڪمل بايو انفارميٽڪ ورڪ فلو، فنڪشنل تشريح، ۽ جديد بايو انفارميٽڪ تجزيو، مخصوص تحقيقي مقصدن کي پورو ڪندي. هي خدمت مختلف جينياتي ۽ جينوميڪ مطالعي لاء درست حوالن جينوم جي ترقي کي قابل بنائي ٿو. اضافي طور تي، اهو ايپليڪيشنن لاء بنياد ٺاهي ٿو جهڙوڪ اسٽريٽ آپٽمائيزيشن، جينياتي انجنيئرنگ، ۽ مائڪروبيل ٽيڪنالاجي ڊولپمينٽ، سائنسي بصيرت ۽ بايو ٽيڪنالاجي جدت کي اڳتي وڌائڻ لاء قابل اعتماد ۽ خلا کان آزاد جينومڪ ڊيٽا کي يقيني بڻائي.
خدمتون خاصيتون
● ٻن ممڪن اختيارن سان چونڊڻ لاءِ جينوم مڪمل ٿيڻ جي مطلوب درجي جي لحاظ کان.
● ڊرافٽ جينوم آپشن: Illumina NovaSeq PE150 سان مختصر پڙهڻ واري ترتيب.
● مڪمل 0 گپ جينوم.
● جينوم اسيمبليءَ لاءِ Nanopore PromethION 48 يا PacBio Revio تي ڊگهي پڙهڻ واري ترتيب.
● Illumina NovaSeq تي مختصر پڙهڻ واري ترتيب جينوم جي تصديق ۽ غلطي جي اصلاح (نانوپور) يا ڊرافٽ جينوم ٺاهڻ لاءِ.
سروس فائدا
●زيرو-گيپ جينوم جي ضمانت: اهو Illumina تسلسل جي انضمام جي ڪري آهي ڊگهي پڙهڻ واري ترتيب سان (نانوپور يا PacBio).
●مڪمل بايو انفارميٽڪس ورڪ فلو:ھن ۾ جينوم اسمبلي ۽ گھڻن جينومڪ عناصر جي اڳڪٿي، فنڪشنل جيني تشريح، ۽ جينوم بصريات جھڙوڪ سرڪوس پلاٽ شامل آھن.
●وسيع ماهر: 20,000 کان وڌيڪ مائڪروبيل جينوم گڏ ڪرڻ سان، BMKGENE هڪ ڏهاڪي کان وڌيڪ تجربو، هڪ انتهائي ماهر تجزياتي ٽيم، جامع مواد، ۽ بهترين پوسٽ-سيلز سپورٽ آڻيندو آهي.
●پوسٽ-سيلز سپورٽ:اسان جي وابستگي پروجيڪٽ جي مڪمل ٿيڻ کان اڳتي وڌي ٿي 3-مهينن کان پوءِ-سيل سروس جي مدت سان. هن وقت دوران، اسان پيش ڪريون ٿا پروجيڪٽ جي پيروي ڪرڻ، مشڪلاتن جي حل ۾ مدد، ۽ سوال ۽ جواب سيشن نتيجن سان لاڳاپيل ڪنهن به سوالن کي حل ڪرڻ لاء.
●گهڻن ترتيب واري حڪمت عمليون موجود آهن:مختلف تحقيق جي مقصدن ۽ جينوم مڪمل ٿيڻ جي ضرورتن لاء.
خدمت جي وضاحت
| خدمت | تسلسل واري حڪمت عملي |
| مسودو جينوم | Illumina PE150 100x |
| 0 Gap Genome | نانوپور 100x + Illumina PE150 100x Or Pacbio HiFi 30x + Illumina PE150 100x (اختياري) |
نموني جي گهرج:
| ڪنسنٽريشن (ng/µL) | ڪل رقم (µg) | حجم (µL) | OD260/280 | OD260/230 | |
| PacBio | ≥20 | ≥1.2 | ≥20 | 1.7-2.2 | ≥1.0 |
| نانوپور | ≥40 | ≥2 | ≥20 | 1.7-2.2 | 1.0-3.0 |
| روشني | ≥1 | ≥0.06 | ≥20 | - | - |
بيڪٽيريا: ≥3.5x1010 سيلز
سروس ڪم فلو
نموني پهچائڻ
لائبريري جي تعمير
تسلسل
ڊيٽا جو تجزيو
وڪري کان پوء خدمتون
ھيٺ ڏنل تجزيو شامل آھي:
● ڊيٽا جي معيار کي ترتيب ڏيڻ
● جينوم اسيمبلي
● جينوم اجزاء جو تجزيو: سي ڊي ايس ۽ گھڻن جينوميڪ عناصر جي اڳڪٿي
● ڪيترن ئي عام ڊيٽابيس (GO، KEGG، وغيره) ۽ ترقي يافته ڊيٽابيس (CARD، VFDB، وغيره) سان فنڪشنل تشريح
● جينوم بصري
اسان جينوم مهيا ڪريون ٿا آسانيءَ سان پهچندڙ فاسٽا فارميٽ ۾ ۽ جينوم تشريح واري فائل (gff).
جيني تشريح - GO
جيني تشريح - CAZY ڪاربوهائيڊريٽ
جينوم بصري - سرڪوس پلاٽ
BMKGene جي بيڪٽيريل جينوم اسيمبليءَ جي خدمتن جي مدد سان ڪيل پيش رفتن جي ڳولا ڪريو پبليڪيشن جي تيار ڪيل مجموعي ذريعي.
دائي، W. et al. (2023) 'صحتمند انساني ڪالون مان Ulcerative Colitis جي علاج لاءِ محفوظ ۽ ناول پروبائيوٽڪ بيڪٽيريا جي طور تي بيڪٽيروائيڊ يونيفارم F18-22 جي دريافت'،بين الاقوامي جرنل آف ماليڪيولر سائنسز، 24 (19)، ص. 14669. doi: 10.3390/IJMS241914669/S1.
ڪانگ، ق. وغيره. (2021) 'Multidrug-resistant Proteus mirabilis blaOXA-1 ۽ blaNDM-1 کي چين ۾ جهنگلي جيوت کان الڳ ڪري ٿو: عوام جي صحت جو خطرو وڌائڻ'،Integrated Zoology، 16 (6)، ص 798-809. doi: 10.1111/1749-4877.12510.
وانگ، ٽي ٽي وغيره. (2017) 'انڊوفائيٽ بيسيلس فليڪسس KLBMP 4941 جو مڪمل جينوم تسلسل ان جي ٻوٽي جي واڌ ويجهه واري ميڪانيزم کي ظاهر ڪري ٿو ۽ لوڻ جي رواداري لاءِ جينياتي بنياد'،جرنل آف بايو ٽيڪنالاجي، 260، ص 38-41. doi: 10.1016/J.JBIOTEC.2017.09.001.
وانگ، ايڪس وغيره. (2021) ڪليبسيلا جا ملٽيپل ريپليڪون رزسٽنس پلاسميڊس ميڊيٽ ايڪسٽينيو ڊسيمنيشن آف اينٽي مائڪروبيل جينز،مائڪرو بايولوجي ۾ فرنٽيئرز، 12، ص. 754931. doi: 10.3389/FMICB.2021.754931/BIBTEX.
