16S/18S/ITS Amplicon Sequencing-NGS
خدمتون خاصيتون
● تسلسل پليٽ فارم: Illumina NovaSeq.
● 16S، 18S ۽ ITS جي مختصر علائقن کي وڌائڻ، ٻين ايمپليفڪيشن هدفن جي وچ ۾.
● amplicon جي لچڪدار چونڊون.
● اڳوڻو پروجيڪٽ تجربو ڪيترن ئي ايمپليفڪيشن مقصدن سان.
سروس فائدا
●اڪيلائي کان آزاد:ماحولياتي نموني ۾ مائڪروبيل ساخت جي تيز سڃاڻپ.
●اعلي قرارداد: ماحولياتي نمونن ۾ گھٽ-گھڻا اجزاء ۾.
●وڏي پيماني تي قابل اطلاق: متنوع مائڪروبيل ڪميونٽي اڀياس.
●جامع بايو انفارميٽيڪل تجزيو: جديد QIIME2 پئڪيج (مائڪروبيل ماحوليات ۾ مقداري بصيرت) ڊيٽابيس، تشريح، OTU/ASV جي لحاظ کان مختلف تجزين سان.
●وسيع ماهر: هر سال 150 هزار امپليڪون ترتيب ڏيڻ جي منصوبن سان گڏ، BMKGENE هڪ ڏهاڪي کان وڌيڪ تجربو آڻيندو آهي، هڪ انتهائي ماهر تجزياتي ٽيم، جامع مواد، ۽ بهترين پوسٽ-سيلز سپورٽ.
خدمت جي وضاحت
| لائبريري | تسلسل واري حڪمت عملي | سفارش ٿيل ڊيٽا |
| امپليڪون | Illumina PE250 | 50/100/300K ٽيگ (پڙهو جوڙو) |
خدمت جي گهرج
| ڪنسنٽريشن (ng/µL) | ڪل رقم (ng) | حجم (µL) |
| ≥1 | ≥200 | ≥20 |
● مٽي / ڪچرو: 1-2 گرام
● آنت جو مواد-جانور: 0.5-2g
● آنڊن جو مواد- حشرات: 0.1-0.25g
● ٻوٽي جي مٿاڇري (اثر ٿيل تلاءُ): 0.1-0.5 گرام
● Fermentation Broth enriched sediment): 0.1-0.5g
● وات (وڏا جانور): 0.5-2 گرام
● ٻوٽا (ماؤس): 3-5 داڻا
● Pulmonary alveolar lavage fluid: فلٽر پيپر
● ويجنل swab: 5-6 swabs
● چمڙي/ جينيٽي سواب/ لعاب/ زباني نرم بافتو/ فرينجيل swab/ rectal swab: 2-3 swabs
● مٿاڇري microorganisms: فلٽر پيپر
● واٽر باڊي/ايئر/بائيو فلم: فلٽر پيپر
● Endophytes: 1-2g
● ڏندن جي تختي: 0.5-1g
سروس ڪم فلو
نموني پهچائڻ
لائبريري جي تعمير
تسلسل
ڊيٽا جو تجزيو
وڪري کان پوء خدمتون
ھيٺ ڏنل تجزيو شامل آھي:
- خام ڊيٽا معيار ڪنٽرول
- OTU ڪلسترنگ / ڊي شور (ASV)
- OTU تشريح
- Alpha diversity analysis: گھڻن انڊيڪسس، بشمول شانن، سمپسن ۽ اي سي.
- بيٽا تنوع جو تجزيو
- بين الاقوامي گروپ تجزيو
- باضابطه تجزيو: ماحولياتي عنصر ۽ ٻاهر جي جوڙجڪ ۽ تنوع جي وچ ۾
- 16S فنڪشنل جين جي اڳڪٿي
ٽئڪسونومڪ ورڇ جو هسٽوگرام
ٽئڪسونومڪ ايبنڊنس ڪلسٽرنگ گرمي جو نقشو
الفا تنوع جو تجزيو: ناياب وکر
بيٽا تنوع جو تجزيو: NMDS
بين الاقوامي گروپ جو تجزيو: LEFSE بايو مارڪر دريافت
BMKGene جي ايمپليڪون ترتيب ڏيڻ واري خدمتن پاران Illumina سان گڏ ڪيل پبليڪيشنز جي تيار ڪيل مجموعن ذريعي پيش رفت جي ڳولا ڪريو.
ڊانگ، سي وغيره. (2022) 'اسمبلي، ڪور مائڪروبيوٽا، اينڊ فنڪشن آف دي ريزوسفيئر سوائل ۽ بارڪ مائڪروبيوٽا ان يوڪوميا الموائيڊس'، فرنٽيئرز ان مائيڪروبائيالوجي، 13. doi: 10.3389/FMICB.2022.855317.
لي، Y. وغيره. (2023) 'مصنوعي بيڪٽيريل ڪنسورشيا ٽرانسپلانٽيشن فار دي علاج لاءِ Gardnerella vaginalis-induced bacterial vaginosis in mice'، Microbiome، 11(1)، pp. 1-14. doi: 10.1186/s40168-023-01497-y
Yang, J., Fu, Y. ۽ Liu, H. (2022) 'زمين جي بنياد تي بند ٿيل بايورجنيريٽو لائف سپورٽ تجربن دوران گڏ ڪيل هوا جي مٽي جا مائڪرو بائيومز "Lunar Palace 365"'، ماحولياتي مائڪروبيومس، 17(1)، pp. 1-20. doi: 10.1186/S40793-022-00399-0/FIGURES/8.
Yin، S. et al. (2022) نائيٽروجن ٽرانسفارميشن ڪنٽرولڊ نائيٽروجن نقصان سان لاڳاپيل فنڪشنل جينز جي فيڊ اسٽاڪ تي منحصر اڪثريت، ڪمپوسٽنگ ۾ نائيٽروجن نقصان، بائيورسورس ٽيڪنالاجي، 361، ص. 127678. doi: 10.1016/J.BIORTECH.2022.127678.
