Маленькая РНК-секвенирование-иллумина
Функции
● Подготовка библиотеки включает в себя шаг выбора размера
● Биоинформатический анализ, сосредоточенный на прогнозировании miRNA и их мишенях
Сервисные преимущества
●Комплексный анализ биоинформатики:Включение идентификации как известных, так и новых miRNAs, идентификации мишеней miRNAS и соответствующей функциональной аннотации и обогащения с несколькими базами данных (Kegg, GO)
●Строгий контроль качества: Мы реализуем контрольные точки основного контроля на всех этапах, от подготовки образца и библиотеки до секвенирования и биоинформатики. Этот тщательный мониторинг обеспечивает доставку неизменно качественных результатов.
●Пост-продажа поддержка: Наше обязательство выходит за рамки завершения проекта с 3-месячным периодом послепродажного обслуживания. В течение этого времени мы предлагаем последующее наблюдение за проектом, помощь в устранении неполадок и сеансы вопросов и ответов для решения любых запросов, связанных с результатами.
●Обширный опыт: С учетом успешного закрытия нескольких проектов SRNA, охватывающих более 300 видов в различных областях исследования, наша команда приносит богатый опыт в каждый проект.
Требования к выборке и доставка
| Библиотека | Платформа | Рекомендуемые данные | Данные QC |
| Выбранный размер | Illumina SE50 | 10m-20m читает | Q30≥85% |
Требования к образцу:
Нуклеотиды:
| Конц. (Нг/мкл) | Количество (мкг) | Чистота | Честность |
| ≥ 80 | ≥ 0,8 | OD260/280 = 1,7-2,5 OD260/230 = 0,5-2,5 Ограниченное или нет белка или загрязнения ДНК, показанного на геле. | Rin≥6,0; 5,0≥28S/18Sц 1,0; ограниченная или нет базовой высоты |
● Растения:
Корень, стебель или лепесток: 450 мг
Лист или семя: 300 мг
Фрукты: 1,2 г
● Животное:
Сердце или кишечник: 450 мг
Viscera или Brain: 240 мг
Мышца: 600 мг
Кости, волосы или кожа: 1,5 г
● членистоногие:
Насекомые: 9G
Ракообразные: 450 мг
● Целая кровь: 2 труб
● Клетки: 106 ячейки
● Сыворотка и плазма:6 мл
Рекомендуемая доставка образца
Контейнер: 2 мл центрифужная трубка (оловянная фольга не рекомендуется)
Образец маркировки: группа+репликация, например, A1, A2, A3; B1, B2, B3.
Отгрузка:
1. Сухой лен: образцы должны быть упакованы в мешки и похоронены в сухих льда.
2. Rnastable Tribes: Образцы РНК можно сушить в трубке стабилизации РНК (например, Rnastable®) и отправлены при комнатной температуре.
Обслуживание рабочего перехода
Дизайн эксперимента
Образец доставки
РНК -экстракция
Библиотека строительство
Секвенирование
Анализ данных
Послепродажные услуги
Биоинформатика
● Сырой контроль качества данных
● Классификация SRNA
● Выравнивание с эталонным геномом
● Идентификация известной и новой miRNA
● Дифференциальный анализ экспрессии miRNA
● Функциональная аннотация мишеней miRNA
Идентификация miRNA: структура и глубина
Дифференциальная экспрессия miRNA - Hieckical Clustering
Функциональная аннотация мишени дифференциально экспрессируемых miRNAs
Исследуйте достижения в области исследований, облегченные услугами секвенирования SRNA BMKGene с помощью кураторской коллекции публикаций.
Chen, H. et al. (2023) «Вирусные инфекции ингибируют биосинтез сапонина и фотосинтез в Panax notoginseng», Plant Physiology and Biochemistry, 203, p. 108038. DOI: 10.1016/j.plaphy.2023.108038.
Li, H. et al. (2023) «Растение, содержащее домен Fyve, содержащий белок Free1 с микропроцессорными компонентами для подавления биогенеза miRNA», сообщает Embo, 24 (1). doi: 10.15252/emb.202255037/suppl_file/emb202255037-sup-0004-sdatafig4.tif.
Yu, J. et al. (2023) «Микрорновый AME-Bantam-3p контролирует развитие личиночной куколки путем нацеливания на множественные эпидермальные домены, подобные факторам роста 8 гена 8 (MEGF8) в пчелах, APIS Mellifera ', Международный журнал молекулярных наук, 24 (6), p Полем 5726. DOI: 10.3390/ijms24065726/s1.
Чжан, М. и соавт. (2018) «Интегрированный анализ miRNA и генов, связанных с качеством мяса, показывает, что GGA-MIR-140-5p влияет на внутримышечное осаждение жира у цыплят», клеточная физиология и биохимия, 46 (6), с. 2421–2433. doi: 10.1159/000489649.
