Небольшая РНК

Небольшие РНК представляют собой короткие некодирующие РНК со средней длиной 18-30 нТ, включая miRNA, siRNA и pirna, которые играют важную роль в регуляторных процессах. Трубопровод BMKCloud SRNA обеспечивает как стандартный, так и пользовательский анализ для идентификации miRNA. После обрезки чтения и контроля качества чтения выровнены по нескольким базам данных для классификации SRNAS, выбора miRNAs и отображаются с эталонным геномом. miRNAs идентифицируются на основе известных баз данных miRNA, предоставляющих информацию о вторичной структуре, семействе miRNA и генах -мишенях. Дифференциальный анализ экспрессии идентифицирует дифференциально экспрессируемые miRNAs, а соответствующие гены -мишени функционально аннотируются для поиска обогащенных категорий.