-
BMKMANU S3000_Пространственный транскриптом
Пространственная транскриптомика находится на переднем крае научных инноваций, позволяя исследователям углубляться в сложные закономерности экспрессии генов в тканях, сохраняя при этом их пространственный контекст. На основе различных платформ компания BMKGene разработала чип пространственной транскриптомы BMKManu S3000, обладающий повышенным разрешением 3,5 мкм, достигающий субклеточного диапазона и позволяющий настраивать многоуровневое разрешение. Чип S3000, имеющий около 4 миллионов точек, использует микролунки, покрытые шариками, загруженными датчиками захвата с пространственным штрих-кодом. Библиотека кДНК, обогащенная пространственными штрих-кодами, готовится из чипа S3000 и впоследствии секвенируется на платформе Illumina NovaSeq. Сочетание образцов с пространственным штрих-кодом и UMI обеспечивает точность и специфичность генерируемых данных. Чип BMKManu S3000 чрезвычайно универсален, предлагая многоуровневые настройки разрешения, которые можно точно настроить для различных тканей и желаемого уровня детализации. Такая адаптивность делает чип отличным выбором для разнообразных исследований пространственной транскриптомики, обеспечивая точную пространственную кластеризацию с минимальным шумом. Использование технологии сегментации клеток с BMKManu S3000 позволяет разграничивать данные транскрипции до границ клеток, что приводит к анализу, имеющему прямое биологическое значение. Кроме того, улучшенное разрешение S3000 приводит к большему количеству генов и UMI, обнаруживаемых на клетку, что позволяет гораздо более точно анализировать пространственные закономерности транскрипции и кластеризацию клеток.
-
Готовые библиотеки DNBSEQ
DNBSEQ, разработанная MGI, представляет собой инновационную технологию NGS, которая позволила еще больше снизить затраты на секвенирование и повысить производительность. Подготовка библиотек DNBSEQ включает фрагментацию ДНК, подготовку оцДНК и амплификацию по катящемуся кругу для получения наношариков ДНК (DNB). Затем их загружают на твердую поверхность и впоследствии секвенируют с помощью комбинаторного синтеза зонда-якоря (cPAS). Технология DNBSEQ сочетает в себе преимущества низкой частоты ошибок амплификации с использованием шаблонов ошибок высокой плотности с наношариками, что приводит к более высокой производительности и точности секвенирования.
Наша служба секвенирования готовых библиотек позволяет клиентам подготовить библиотеки секвенирования Illumina из различных источников (мРНК, весь геном, ампликоны, библиотеки 10x и т. д.), которые преобразуются в библиотеки MGI в наших лабораториях для секвенирования в DNBSEQ-T7, что позволяет большие объемы данных при меньших затратах.
-
Взаимодействие хроматина на основе Hi-C
Hi-C — это метод, предназначенный для определения конфигурации генома путем сочетания исследования взаимодействий на основе близости и высокопроизводительного секвенирования. Метод основан на сшивании хроматина формальдегидом с последующим расщеплением и повторным лигированием таким образом, что только фрагменты, которые ковалентно связаны, будут образовывать продукты лигирования. Секвенируя эти продукты лигирования, можно изучить трехмерную организацию генома. Hi-C позволяет изучить распределение частей генома, которые слабо упакованы (отделения А, эухроматин) и с большей вероятностью являются транскрипционно активными, а также областей, которые более плотно упакованы (отделения В, гетерохроматин). Hi-C также можно использовать для выявления топологически связанных доменов (TAD), областей генома, которые имеют складчатую структуру и, вероятно, имеют схожие паттерны экспрессии, а также для идентификации петель хроматина, областей ДНК, которые связаны между собой белками и которые часто обогащены регуляторными элементами. Служба секвенирования Hi-C BMKGene дает исследователям возможность исследовать пространственные аспекты геномики, открывая новые возможности для понимания регуляции генома и ее последствий для здоровья и болезней.
-
TGuide Smart Magnetic Plant RNA Kit
TGuide Smart Magnetic Plant RNA Kit
Очистите высококачественную тотальную РНК из тканей растений.
-
TGuide Smart Набор РНК крови/клеток/тканей
TGuide Smart Набор РНК крови/клеток/тканей
Предварительно заполненный картридж/планшетный набор реагентов для очистки высокопроизводительной, высокочистой, высококачественной тотальной РНК, не содержащей ингибиторов, из тканей/клеток/свежей цельной крови животных.
-
Набор ДНК умных магнитных растений TGuide
Набор ДНК умных магнитных растений TGuide
Очистите высококачественную геномную ДНК из различных тканей растений.
-
TGuide Smart Soil/Stool DNA Kit
TGuide Smart Soil/Stool DNA Kit
Очищает ДНК высокой чистоты и качества без ингибиторов из образцов почвы и стула.
-
TGuide Smart Набор для очистки ДНК
Восстанавливает высококачественную ДНК из продуктов ПЦР или агарозных гелей.
-
Набор геномной ДНК TGuide Smart Blood
Набор геномной ДНК TGuide Smart Blood
Предварительно заполненный картридж/планшетный набор реагентов для очистки геномной ДНК из крови и лейкоцитной пленки.
-
TGuide Smart Магнитный набор ДНК ткани
Предварительно заполненный картридж/планшетный набор реагентов для экстракции геномной ДНК из тканей животных.
-
Универсальный набор ДНК TGuide Smart
Предварительно заполненный картридж/планшетный набор реагентов для очистки геномной ДНК от крови, засохших пятен крови, бактерий, клеток, слюны, мазков из полости рта, тканей животных и т. д.
-
Экстрактор нуклеиновых кислот TGuide S16
Экстрактор нуклеиновых кислот TGuide S16
Простой в использовании настольный прибор, 1–8 или 16 образцов одновременно
Каталожный номер/упаковка
Кот. нет
ID
Количество препаратов
ОСЭ-С16-АМ
1 комплект
-
PacBio 2+3 Полноразмерный раствор мРНК
Хотя секвенирование мРНК на основе NGS является универсальным инструментом для количественной оценки экспрессии генов, его зависимость от коротких считываний ограничивает его эффективность в сложных транскриптомных анализах. С другой стороны, секвенирование PacBio (Iso-Seq) использует технологию длительного считывания, позволяющую секвенировать полноразмерные транскрипты мРНК. Этот подход облегчает всестороннее исследование альтернативного сплайсинга, слияний генов и полиаденилирования, хотя он не является основным выбором для количественной оценки экспрессии генов. Комбинация 2+3 устраняет разрыв между Illumina и PacBio, полагаясь на считывания PacBio HiFi для идентификации полного набора изоформ транскриптов и секвенирования NGS для количественной оценки идентичных изоформ.
Платформы: PacBio Sequel II/PacBio Revio и Illumina NovaSeq;
