
секвенирование мРНК (NGS) с эталонным геномом
РНК-секвенирование — это стандартный инструмент в науках о жизни и растениеводстве, устраняющий разрыв между геномами и протеомами. Его сила заключается в обнаружении новых транскриптов и количественной оценке их экспрессии в одном анализе. Он широко используется для сравнительных транскриптомных исследований, проливающих свет на гены, связанные с различными признаками или фенотипами, например, для сравнения мутантов с дикими типами или выявления экспрессии генов в определенных условиях. Приложение BMKCloud mRNA (Reference) объединяет количественный анализ экспрессии, анализ дифференциальной экспрессии (DEG) и анализ структуры последовательностей в биоинформатический конвейер mRNA-seq (NGS) и объединяет сильные стороны аналогичного программного обеспечения, обеспечивая удобство и удобство для пользователя. Пользователи могут загружать свои данные секвенирования РНК в облако, где приложение предлагает комплексное универсальное решение для биоинформатического анализа. Кроме того, он уделяет приоритетное внимание обслуживанию клиентов, предлагая персонализированные операции с учетом конкретных потребностей пользователей. Пользователи могут самостоятельно устанавливать параметры и отправлять задание конвейера, проверять интерактивный отчет, просматривать данные/диаграммы и выполнять интеллектуальный анализ данных, например: выбор целевого гена, функциональную кластеризацию, построение диаграмм и т. д.
Платформа:Иллюмина, MGI
Стратегия:РНК-Seq
Макет: Паритетные, чистые данные.
Тип библиотеки:fr-нецепь, fr-первая нить или fr-вторая нить
Длина чтения:150 б.п.
Тип файла:*.fastq, *.fq, *.fastq.gz или *.fq.gz. Система будетавтоматически соединять файлы .fastq в соответствии с их именами,например, *_1.fastq в паре с *._2.fastq.
Количество образцов:Ограничений по количеству нетобразцов, но время анализа будет увеличиваться по мере увеличения количествавыборки растут.
Рекомендуемый объем данных:6G на образец