Геном
Сборка хромосомы и анализ урожая биомассы Miscanthus lutarioriparius genome
Секвенирование нанопора | Illumina | Hi-c | РНК-секвенирование | Филогения
В этом исследовании Biomarker Technologies предоставили техническую поддержку в секвенировании нанопор, сборке генома De novo, сборке HI-C и т. Д.
Абстрактный
Мискантус, корневищное многолетнее растение, имеет большой потенциал для выработки биоэнергии для его высокой биомассы и стрессовой толерантности. Мы сообщаем о сборке хромосом.Miscanthus lutarioripariusГеном, объединив Оксфордские нанопоры и технологии HI-C. Сборка 2,07-gb охватывает 96,64% генома, с контигом N50 1,71 МБ. Последовательности центромер и теломер собираются для всех 19 хромосом и хромосомы 10 соответственно. Аллотетраплоидное происхождение M. lutarioriparius конфиденциально с использованием центромерных спутниковых повторений. Четко продемонстрировано структура тетраплоида и несколько хромосомных перестройств относительно сорго. Тандем дубликатов геновМ. Лутариорипарийфункциональные обогащены не только в терминах, связанных с реакцией на стресс, но и биосинтезом клеточной стенки. Семейства генов, связанные с устойчивостью к заболеваниям, биосинтезом клеточной стенки и транспортом ионов металлов, значительно расширяются и развиваются. Расширение этих семейств может быть важной геномной основой для улучшения замечательных признаковМ. Лутариорипарий.
Ключевая статистика сборки генома
Фигура. Обзор сборки генома M. lutarioriparius
Новости и основные моменты Целью обмена последними успешными случаями с биомаркерами технологий, захватывая новые научные достижения, а также заметные методы, применяемые в ходе исследования.
Время сообщения: январь-05-2022