Длинная некодирующая секвенирование-иллумина
Сервисные преимущества
●Совместный анализ мРНК и lncrna: Объединив количественную оценку транскриптов мРНК с изучением LNCRNA и их мишеней, можно получить углубленный обзор регуляторного механизма, лежащего в основе клеточного ответа.
●Обширный опыт: Наша команда приносит богатый опыт в каждый проект, с опытом обработки более 23 000 образцов в BMK, охватывающих различные типы выборки и проекты LNCRNA.
●Строгий контроль качества: Мы реализуем контрольные точки основного контроля на всех этапах, от подготовки образца и библиотеки до секвенирования и биоинформатики. Этот тщательный мониторинг обеспечивает доставку неизменно качественных результатов.
●Пост-продажа поддержка: Наше обязательство выходит за рамки завершения проекта с 3-месячным периодом послепродажного обслуживания. В течение этого времени мы предлагаем последующее наблюдение за проектом, помощь в устранении неполадок и сеансы вопросов и ответов для решения любых запросов, связанных с результатами.
Требования к выборке и доставка
| Библиотека | Платформа | Рекомендуемые данные | Данные QC |
| РРНК -истощенная направленная библиотека | Illumina PE150 | 10-16 ГБ | Q30≥85% |
Нуклеотиды:
| Конц. (Нг/мкл) | Количество (мкг) | Чистота | Честность |
| ≥ 80 | ≥ 0,8 | OD260/280 = 1,7-2,5 OD260/230 = 0,5-2,5 Ограниченное или нет белка или загрязнения ДНК, показанного на геле. | Rin≥6,0; 5,0≥28S/18Sц 1,0; ограниченная или нет базовой высоты |
● Растения:
Корень, стебель или лепесток: 450 мг
Лист или семя: 300 мг
Фрукты: 1,2 г
● Животное:
Сердце или кишечник: 450 мг
Viscera или Brain: 240 мг
Мышца: 600 мг
Кости, волосы или кожа: 1,5 г
● членистоногие:
Насекомые: 9G
Ракообразные: 450 мг
● Целая кровь:2 труб
● Клетки: 106 ячейки
● Сыворотка и плазма: 6 мл
Рекомендуемая доставка образца
Контейнер: 2 мл центрифужная трубка (оловянная фольга не рекомендуется)
Образец маркировки: группа+репликация, например, A1, A2, A3; B1, B2, B3.
Отгрузка:
1. Сухой лен: образцы должны быть упакованы в мешки и похоронены в сухих льда.
2. Rnastable Tribes: Образцы РНК можно сушить в трубке стабилизации РНК (например, Rnastable®) и отправлены при комнатной температуре.
Обслуживание рабочего перехода
Дизайн эксперимента
Образец доставки
РНК -экстракция
Библиотека строительство
Секвенирование
Анализ данных
Послепродажные услуги
Биоинформатика
Дифференциальный анализ экспрессии генов (DEGS)
Количественная оценка экспрессии lncrna - кластеризация
Обогащение генов -мишеней LNCRNA
Анализ мРНК мРНК и LNCRNA - график Circos (средний круг - мРНК, а внутренняя CICRLCE - lncRNA)
Исследуйте достижения, которые облегчают услуги Equencing Bmkgene, посредством кураторской коллекции публикаций.
Ji, H. et al. (2020) «Идентификация, функциональный прогноз и ключевая проверка LncRNA связанных с холодным стрессом в печени крыс», Scientific Reports 2020 10: 1, 10 (1), стр. 1–14. doi: 10.1038/s41598-020-57451-7.
Jia, Z. et al. (2021) «Интегративный транскриптомный анализ выявляет иммунный механизм для CYHV-3-устойчивого штамма CARP», границы в иммунологии, 12, с. 687151. DOI: 10.3389/fimmu.2021.687151/bibtex.
Wang, XJ et al. (2022) «Приоритизация конкурирующих эндогенных РНК-регуляционных сетей на основе мульти-амической интеграции в малых клеточных раке легких: молекулярные характеристики и кандидаты на лекарства», «Границы в онкологии», 12, p. 904865. DOI: 10.3389/fonc.2022.904865/bibtex.
Xiao, L. et al. (2020) «Генетическая диссекция сети коэкспрессии генов, лежащая в основе фотосинтеза в популяции», Журнал Biotechnology Plant, 18 (4), с. 1015–1026. doi: 10.1111/pbi.13270.
Zheng, H. et al. (2022) «Глобальная регуляторная сеть для диспрессируемой экспрессии генов и аномальной метаболической передачи сигналов в иммунных клетках в микроокружении болезней могил и границ тиреоидита Хасимото в иммунологии, 13, с. 879824. DOI: 10.3389/fimmu.2022.879824/bibtex.
