днРНК
Длинные некодирующие РНК (днРНК) — это РНК длиной более 200 нуклеотидов с низким кодирующим потенциалом, но с важными регуляторными функциями. Конвейер днРНК BMKCloud предназначен для анализа библиотек, обедненных рРНК, с использованием высококачественного, хорошо аннотированного эталонного генома путем совместного анализа экспрессии днРНК и мРНК. После обрезки прочтений и контроля качества прочтения выравниваются по эталонному геному для сборки транскриптов, а последующий анализ структуры генов выявляет альтернативный сплайсинг и новые гены. Транскрипты идентифицируются как мРНК или днРНК, а анализ дифференциальной экспрессии идентифицирует дифференциально экспрессируемые днРНК, их мишени и дифференциально экспрессируемые гены (DEGS). Как DEG, так и дифференциально экспрессируемые мишени lncRNA функционально аннотированы для поиска обогащенных функциональных категорий.
Биоинформатика
