Полногеномное исследование ассоциаций (GWAS) направлено на выявление генетических вариантов (генотипа), связанных с определенными признаками (фенотипом). Исследования GWA исследуют генетические маркеры, охватывающие весь геном большого количества людей, и прогнозируют ассоциации генотип-фенотип с помощью статистического анализа на уровне популяции. Полногеномное повторное секвенирование потенциально может обнаружить все генетические варианты. В сочетании с фенотипическими данными GWAS может быть обработан для идентификации связанных с фенотипом SNP, QTL и генов-кандидатов, что в значительной степени подтверждает современную селекцию животных/растений. SLAF — это самостоятельно разработанная упрощенная стратегия секвенирования генома, которая обнаруживает распределенные по всему геному маркеры, SNP. Эти SNP, как молекулярно-генетические маркеры, могут быть обработаны для исследований ассоциации с целевыми признаками. Это экономически эффективная стратегия выявления сложных признаков, связанных с генетическими вариациями.
