Illumina готовые библиотеки
Функции
●Платформы:Illumina novaseq 6000 и novaseq x plus
●Режимы секвенирования:PE150 и PE250
●Контроль качества библиотек перед секвенированием
●Секвенирование данных QC и доставки:Доставка отчета о QC и необработанных данных в формате FASTQ после демольтиплексирования и фильтрации Q30 считывает
Сервисные преимущества
●Универсальность услуг секвенирования:Клиент может выбрать последовательность с помощью полосы движения, проточной ячейки или объемом необходимых данных (секвенирование частичной полосы).
●Обширный опыт на платформе секвенирования Illumina:с тысячами закрытых проектов с различными видами.
●Доставка секвенирования отчета о QC:С качественными показателями, точностью данных и общей производительностью проекта секвенирования.
●Зрелый процесс секвенирования:с коротким временем поворота.
●Строгий контроль качества: Мы реализуем строгие требования КК, чтобы гарантировать доставку последовательно качественных результатов.
Образцы платформ
| Платформа | Проточная ячейка | Режим секвенирования | Единица | Расчетный выход |
| Novaseq x | 10b (8 полос) | PE150 | Одиночный ряд Частичная полоса | 375 ГБ / полоса |
| 25b (8 полос) | PE150 | Одиночный ряд Частичная полоса | 1000 ГБ/полоса | |
| Novaseq 6000 | Проточная ячейка SP (2 полосы движения) | PE250 | Проточная ячейка Одиночный ряд Частичная полоса | 325-400 м считывает / полоса |
| S4 проточная ячейка (4 полосы движения) | PE150 | Проточная ячейка Одиночный ряд Частичная полоса | ~ 800 ГБ / полоса |
Требования к выборке
| Сумма данных (x) | Концентрация (КПЦР/нм) | Объем | |
| Частичная полоса последовательности
| X ≤ 10 ГБ | ≥ 1 нм | ≥ 25 мкл |
| 10 ГБ <x ≤ 50 ГБ | ≥ 2 нм | ≥ 25 мкл | |
| 50 ГБ <x ≤ 100 ГБ | ≥ 3 нм | ≥ 25 мкл | |
| X> 100 ГБ | ≥ 4 нм | ≥ 25 мкл | |
| Секвенирование полосы движения | За полосу движения | ≥ 1,5 нм / библиотечный пул | ≥ 25 мкл / библиотечный бассейн |
В дополнение к концентрации и общему количеству, также требуется подходящая пиковая схема.
ПРИМЕЧАНИЕ. Секвенирование полосы движения библиотек с низким разнообразием требует, чтобы Фикс Спайк-ин был надежным базовым вызовом.
Мы рекомендуем отправить библиотеки с предварительно заправленными в качестве образцов. Если вам требуется BMKGene для выполнения объединения библиотек, пожалуйста, обратитесь к
Требования библиотеки для секвенирования частичной полосы.
Размер библиотеки (пиковая карта)
Основной пик должен быть в пределах 300-450 п.н.
Библиотеки должны иметь единый основной пик, без загрязнения адаптера и димеров грунтовки.
Пожалуйста, обратитесь к нам, если ваши образцы не соответствуют начальным требованиям материала.
Служба рабочего процесса
Контроль качества библиотеки
Секвенирование
Контроль качества данных
Доставка проекта
Библиотека QC отчет
Отчет о качестве библиотеки предоставляется перед секвенированием, оценкой суммы библиотеки и фрагментации.
Отчет о секвенировании QC
Таблица 1. Статистика по данным секвенирования.
| Образец идентификатор | BMKID | Сырой читает | Необработанные данные (BP) | Чистые чтения (%) | Q20 (%) | Q30 (%) | GC (%) |
| C_01 | BMK_01 | 22 870,120 | 6 861 036 000 | 96.48 | 99,14 | 94,85 | 36.67 |
| C_02 | BMK_02 | 14 717 867 | 4 415 360 100 | 96.00 | 98,95 | 93,89 | 37.08 |
Рисунок 1. Распределение качества вдоль чтения в каждом образце
Рисунок 2. Распределение базового содержания
Рисунок 3. Распределение содержимого чтения в данных секвенирования
