Circrna

Круглые РНК (CIRCRNAS) представляют собой некодирующие РНК, которые образуют круговые структуры и имеют множественные регуляторные роли, включая конкуренцию с miRNA за гены-мишени и связывание белка. Трубопровод CIRCRNA BMKCloud предназначен для анализа библиотек, истощенных рРНК, с хорошо аннотированным и высококачественным эталонным геномом. Анализ начинается с обрезки чтения и контроля качества, за которым следует выравнивание считывания с эталонным геномом и прогнозирование новых циркрнсов в сочетании с идентификацией известных циркрон из баз данных. Впоследствии идентифицируются соответствующие мишени miRNA и хост CircRNA. Дифференциальный анализ экспрессии выявляет дифференциально экспрессируемые циркронты, а соответствующие хозяева функционально аннотируются для извлечения обогащенных биологических функций.