Secvențierea ARN mic-Illumina
Caracteristici
● Pregătirea bibliotecii include un pas de selectare a dimensiunii
● Analiza bioinformatică centrată pe predicția miRNA și țintele acestora
Avantajele serviciului
●Analiză bioinformatică cuprinzătoare:Permiterea identificării atât a miARN-urilor cunoscute, cât și a celor noi, identificarea țintelor miARN-urilor și adnotarea funcțională corespunzătoare și îmbogățirea cu mai multe baze de date (KEGG, GO)
●Control riguros al calității: Implementăm puncte de control de bază în toate etapele, de la pregătirea probelor și a bibliotecii până la secvențiere și bioinformatică. Această monitorizare meticuloasă asigură furnizarea de rezultate constant de înaltă calitate.
●Suport post-vânzare: Angajamentul nostru se extinde dincolo de finalizarea proiectului cu o perioadă de service post-vânzare de 3 luni. În acest timp, oferim urmărire a proiectului, asistență pentru depanare și sesiuni de întrebări și răspunsuri pentru a răspunde oricăror întrebări legate de rezultate.
●Expertiza extinsa: Cu un istoric de închidere cu succes a mai multor proiecte sRNA care acoperă peste 300 de specii în diverse domenii de cercetare, echipa noastră aduce o mulțime de experiență fiecărui proiect.
Cerințe pentru mostre și livrare
| Bibliotecă | Platformă | Date recomandate | QC date |
| Mărimea selectată | Illumina SE50 | 10M-20M citiri | Q30≥85% |
Cerințe pentru mostre:
Nucleotide:
| Conc. (ng/μl) | Cantitate (μg) | Puritate | Integritate |
| ≥ 80 | ≥ 0,8 | OD260/280=1,7-2,5 OD260/230=0,5-2,5 Contaminare limitată sau lipsită de proteine sau ADN este indicată pe gel. | RIN≥6,0; 5,0≥28S/18S≥1,0; creștere limitată sau inexistentă |
● Plante:
Rădăcină, tulpină sau petală: 450 mg
Frunze sau semințe: 300 mg
Fructe: 1,2 g
● Animal:
Inima sau intestinul: 450 mg
Viscere sau creier: 240 mg
Muschi: 600 mg
Oasele, părul sau pielea: 1,5 g
● Artropode:
Insecte: 9 g
Crustacee: 450 mg
● Sânge integral: 2 tuburi
● Celule: 106 celule
● Ser și plasmă:6 ml
Livrare recomandată de mostre
Recipient: tub de centrifuga de 2 ml (nu este recomandata folie de cositor)
Etichetarea eșantionului: Grup+replica de ex. A1, A2, A3; B1, B2, B3.
Expediere:
1. Gheață carbonică: Probele trebuie ambalate în saci și îngropate în gheață carbonică.
2. Tuburi ARNstable: Probele de ARN pot fi uscate în tub de stabilizare a ARN (de exemplu, RNAstable®) și expediate la temperatura camerei.
Fluxul de lucru al serviciului
Design experiment
Livrare mostre
extracția ARN
Construcția bibliotecii
Secvențierea
Analiza datelor
Servicii post-vânzare
Bioinformatica
● Controlul calității datelor brute
● clasificarea sRNA
● Alinierea la un genom de referință
● Identificarea miARN-ului cunoscut și nou
● Analiza diferențială a expresiei miARN
● Adnotarea funcțională a țintelor miARN
Identificarea miARN: structură și adâncime
Expresia diferențială a miARN – clustering ierarhic
Adnotarea funcțională a țintei miARN-urilor exprimate diferențial
Explorați progresele în cercetare facilitate de serviciile de secvențiere ARNs BMKGene printr-o colecție de publicații organizată.
Chen, H. şi colab. (2023) „Infecțiile virale inhibă biosinteza și fotosinteza saponinei în Panax notoginseng”, Fiziologia și biochimia plantelor, 203, p. 108038. doi: 10.1016/J.PLAPHY.2023.108038.
Li, H. şi colab. (2023) „Proteina FREE1 care conține domeniul FYVE se asociază cu componente ale microprocesorului pentru a reprima biogeneza miARN”, rapoarte EMBO, 24 (1). doi: 10.15252/EMBR.202255037/SUPPL_FILE/EMBR202255037-SUP-0004-SDATAFIG4.TIF.
Yu, J. şi colab. (2023) „MicroARN Ame-Bantam-3p controlează dezvoltarea pupalei larvare prin țintirea genei multiple, asemănătoare factorilor de creștere epidermică 8 (megf8) în albinele, Apis mellifera”, Jurnalul Internațional de Științe Moleculare, 24 (6), p. . 5726. doi: 10.3390/IJMS24065726/S1.
Zhang, M. şi colab. (2018) „Analiza integrată a MiRNA și a genelor asociate cu calitatea cărnii arată că Gga-MiR-140-5p afectează depunerea de grăsime intramusculară la pui”, Fiziologie celulară și biochimie, 46(6), pp. 2421–2433. doi: 10.1159/000489649.
