Exclusive Agency for Korea

条形banner-03

Produse

  • Analiza asociației la nivelul genomului

    Analiza asociației la nivelul genomului

    Scopul Genome-Wide Association Studies (GWAS) este de a identifica variante genetice (genotipuri) legate de trăsături specifice (fenotipuri). Prin examinarea markerilor genetici din întregul genom la un număr mare de indivizi, GWAS extrapolează asociațiile genotip-fenotip prin analize statistice la nivel de populație. Această metodologie găsește aplicații extinse în cercetarea bolilor umane și explorarea genelor funcționale legate de trăsături complexe la animale sau plante.

    La BMKGENE, oferim două căi de desfășurare a GWAS pe populații mari: folosirea secvențierii întregului genom (WGS) sau optarea pentru o metodă de secvențiere a genomului cu reprezentare redusă, Fragmentul amplificat specific locului (SLAF) dezvoltat intern. În timp ce WGS se potrivește genomurilor mai mici, SLAF apare ca o alternativă rentabilă pentru studierea populațiilor mai mari cu genomi mai lungi, minimizând efectiv costurile de secvențiere, garantând în același timp o eficiență ridicată a descoperirii markerilor genetici.

  • Secvențierea ARN cu un singur nucleu

    Secvențierea ARN cu un singur nucleu

    Dezvoltarea tehnicilor de captare a unei singure celule și de construire a bibliotecii personalizate, cuplate cu secvențierea de mare performanță, a revoluționat studiile de expresie a genelor la nivel de celule. Această descoperire permite o analiză mai profundă și mai cuprinzătoare a populațiilor de celule complexe, depășind limitările asociate cu media expresiei genelor asupra tuturor celulelor și păstrând adevărata eterogenitate în cadrul acestor populații. În timp ce secvențierea ARN cu o singură celulă (scRNA-seq) are avantaje incontestabile, aceasta întâmpină provocări în anumite țesuturi în care crearea unei suspensii unicelulare se dovedește dificilă și necesită probe proaspete. La BMKGene, abordăm acest obstacol oferind secvențierea ARN cu un singur nucleu (snRNA-seq) folosind tehnologia de ultimă oră 10X Genomics Chromium. Această abordare lărgește spectrul de probe care pot fi analizate transcriptomului la nivel de celulă unică.

    Izolarea nucleelor ​​este realizată prin intermediul cipului inovator 10X Genomics Chromium, cu un sistem de microfluidic cu opt canale cu încrucișări duble. În cadrul acestui sistem, granulele de gel care încorporează coduri de bare, primeri, enzime și un singur nucleu sunt încapsulate în picături de ulei de mărimea unui nanolitru, formând GEM (Gel Bead-in-Emulsion). După formarea GEM, liza celulară și eliberarea codului de bare au loc în fiecare GEM. Ulterior, moleculele de ARNm sunt supuse transcripției inverse în ADNc, încorporând coduri de bare de 10X și identificatori moleculari unici (UMI). Aceste ADNc sunt apoi supuse construcției bibliotecii de secvențiere standard, facilitând o explorare robustă și cuprinzătoare a profilurilor de expresie a genelor la nivel de o singură celulă.

    Platformă: 10× Genomics Chromium și Illumina NovaSeq Platform

  • Secvențierea întregului genom plante/animal

    Secvențierea întregului genom plante/animal

    Secvențierea întregului genom (WGS), cunoscută și sub denumirea de resecvențiere, se referă la secvențierea întregului genom a diferiților indivizi ai speciilor cu genomi de referință cunoscuți. Pe această bază, diferențele genomice ale indivizilor sau populațiilor pot fi identificate în continuare. WGS permite identificarea polimorfismului cu nucleotidă unică (SNP), ștergerea inserției (InDel), variația structurii (SV) și variația numărului de copii (CNV). SV cuprind o parte mai mare a bazei de variație decât SNP-urile și au un impact mai mare asupra genomului, afectând substanțial organismele vii. În timp ce resecvențarea cu citire scurtă este eficientă în identificarea SNP-urilor și InDels, resecvențarea cu citire lungă permite identificarea mai precisă a fragmentelor mari și a variațiilor complicate.

  • 10x Genomics Visium Spatial Transcriptome

    10x Genomics Visium Spatial Transcriptome

    Transcriptomica spațială este o tehnologie de ultimă oră care permite cercetătorilor să investigheze modelele de expresie a genelor în țesuturi, păstrând în același timp contextul lor spațial. O platformă puternică în acest domeniu este 10x Genomics Visium cuplată cu secvențierea Illumina. Principiul 10X Visium se află pe un cip specializat cu o zonă de captare desemnată în care sunt plasate secțiuni de țesut. Această zonă de captură conține pete cu coduri de bare, fiecare corespunzând unei locații spațiale unice în țesut. Moleculele de ARN capturate din țesut sunt apoi etichetate cu identificatori moleculari unici (UMI) în timpul procesului de transcripție inversă. Aceste puncte cu coduri de bare și UMI permit cartografierea spațială precisă și cuantificarea expresiei genelor la o rezoluție cu o singură celulă. Combinația de mostre cu coduri de bare spațial și UMI-uri asigură acuratețea și specificitatea datelor generate. Prin utilizarea acestei tehnologii de transcriptomică spațială, cercetătorii pot obține o înțelegere mai profundă a organizării spațiale a celulelor și a interacțiunilor moleculare complexe care au loc în țesuturi, oferind perspective neprețuite asupra mecanismelor care stau la baza proceselor biologice în mai multe domenii, inclusiv oncologie, neuroștiință, biologia dezvoltării, imunologie. , și studii botanice.

    Platformă: 10X Genomics Visium și Illumina NovaSeq

  • Secvențierea ARNm de lungime completă-Nanopore

    Secvențierea ARNm de lungime completă-Nanopore

    În timp ce secvențierea ARNm pe bază de NGS este un instrument versatil pentru cuantificarea expresiei genelor, dependența sa de citiri scurte îi limitează eficacitatea în analizele transcriptomice complexe. Pe de altă parte, secvențierea nanoporilor folosește tehnologia de citire lungă, permițând secvențierea transcriptelor ARNm de lungime completă. Această abordare facilitează o explorare cuprinzătoare a splicing-ului alternativ, fuziunilor de gene, poliadenilare și cuantificarea izoformelor de ARNm.

    Secvențierea nanoporilor, o metodă care se bazează pe semnale electrice în timp real dintr-o singură moleculă de nanopori, oferă rezultate în timp real. Ghidat de proteine ​​motorii, ADN-ul dublu catenar se leagă de proteinele nanoporului încorporate într-un biofilm, derulându-se pe măsură ce trece prin canalul nanoporului sub o diferență de tensiune. Semnalele electrice distinctive generate de diferite baze de pe catena ADN sunt detectate și clasificate în timp real, facilitând secvențierea precisă și continuă a nucleotidelor. Această abordare inovatoare depășește limitările de citire scurtă și oferă o platformă dinamică pentru analize genomice complexe, inclusiv studii transcriptomice complexe, cu rezultate imediate.

    Platformă: Nanopore PromethION 48

  • Secvențierea ARNm de lungime completă -PacBio

    Secvențierea ARNm de lungime completă -PacBio

    În timp ce secvențierea ARNm pe bază de NGS este un instrument versatil pentru cuantificarea expresiei genelor, dependența sa de citiri scurte limitează utilizarea sa în analizele transcriptomice complexe. Pe de altă parte, secvențierea PacBio (Iso-Seq) folosește tehnologia de citire lungă, permițând secvențierea transcriptelor ARNm de lungime completă. Această abordare facilitează o explorare cuprinzătoare a splicing-ului alternativ, fuziunilor de gene și poliadenilare. Cu toate acestea, există și alte opțiuni pentru cuantificarea expresiei genelor datorită cantității mari de date necesare. Tehnologia de secvențiere PacBio se bazează pe secvențierea cu o singură moleculă, în timp real (SMRT), oferind un avantaj distinct în capturarea transcrierilor mARN de lungime completă. Această abordare inovatoare implică utilizarea ghidurilor de undă în modul zero (ZMW) și godeuri microfabricate care permit observarea în timp real a activității ADN polimerazei în timpul secvențierii. În cadrul acestor ZMW, ADN polimeraza PacBio sintetizează o catenă complementară de ADN, generând citiri lungi care acoperă totalitatea transcrierilor ARNm. Funcționarea PacBio în modul de secvențiere circulară consens (CCS) îmbunătățește acuratețea prin secvențierea repetată a aceleiași molecule. Citirile HiFi generate au o acuratețe comparabilă cu NGS, contribuind în continuare la o analiză cuprinzătoare și fiabilă a caracteristicilor transcriptomice complexe.

    Platformă: PacBio Sequel II; PacBio Revio

  • Secvențierea ARNm eucariotic-NGS

    Secvențierea ARNm eucariotic-NGS

    Secvențierea ARNm, o tehnologie versatilă, împuternicește profilarea cuprinzătoare a tuturor transcriptelor ARNm din celule în condiții specifice. Cu aplicațiile sale largi, acest instrument de ultimă oră dezvăluie profiluri complexe de expresie genetică, structuri genice și mecanisme moleculare asociate cu diverse procese biologice. Adopta pe scară largă în cercetarea fundamentală, diagnosticarea clinică și dezvoltarea medicamentelor, secvențierea ARNm oferă perspective asupra complexităților dinamicii celulare și ale reglării genetice, stârnind curiozitatea cu privire la potențialul său în diferite domenii.

    Platformă: Illumina NovaSeq X; DNBSEQ-T7

  • Secvențierea ARNm pe bază de non-referință-NGS

    Secvențierea ARNm pe bază de non-referință-NGS

    Secvențierea ARNm împuternicește profilarea cuprinzătoare a tuturor transcriptelor ARNm din celule în condiții specifice. Această tehnologie de ultimă oră servește ca un instrument puternic, dezvăluind profiluri complexe de expresie a genelor, structuri genice și mecanisme moleculare asociate cu diverse procese biologice. Adopta pe scară largă în cercetarea fundamentală, diagnosticarea clinică și dezvoltarea medicamentelor, secvențierea ARNm oferă perspective asupra complexității dinamicii celulare și reglării genetice.

    Platformă: Illumina NovaSeq X; DNBSEQ-T7

  • Secvențiere lungă fără codificare-Illumina

    Secvențiere lungă fără codificare-Illumina

    ARN-urile lungi necodificatoare (lncRNAs) sunt mai lungi de 200 de nucleotide care posedă un potențial de codificare minim și sunt elemente esențiale în ARN-ul necodant. Găsite în nucleu și citoplasmă, acești ARN joacă roluri cruciale în reglarea epigenetică, transcripțională și post-transcripțională, subliniind semnificația lor în modelarea proceselor celulare și moleculare. Secvențierea LncRNA este un instrument puternic în diferențierea celulară, ontogeneză și boli umane.

    Platformă: Illumina NovaSeq

  • Secvențierea ARN mic-Illumina

    Secvențierea ARN mic-Illumina

    Moleculele mici de ARN (ARNs), includ microARN (miARN), mici ARN interferenți (siARN) și ARN-uri care interacționează cu piwi (piARN). Printre acestea, miARN-urile, cu o lungime de aproximativ 18-25 de nucleotide, sunt deosebit de demne de remarcat pentru rolurile lor esențiale de reglare în diferite procese celulare. Cu modele de expresie specifice țesuturilor și specifice etapei, miARN-urile prezintă o conservare ridicată la diferite specii.

    Platformă: Illumina NovaSeq

  • Secvențierea CircARN-Illumina

    Secvențierea CircARN-Illumina

    Secvențierea ARN circulară (circRNA-seq) este de a profila și analiza ARN-urile circulare, o clasă de molecule de ARN care formează bucle închise datorită evenimentelor de splicing non-canonice, oferind acestui ARN o stabilitate crescută. În timp ce s-a dovedit că unele circARN-uri acționează ca bureți microARN, sechestrând microARN-urile și împiedicându-le să-și regleze ARNm-urile țintă, alte circRNA-uri pot interacționa cu proteinele, modulează expresia genelor sau pot avea roluri în procesele celulare. Analiza expresiei circRNA oferă perspective asupra rolurilor de reglementare ale acestor molecule și semnificația lor în diferite procese celulare, stadii de dezvoltare și condiții de boală, contribuind la o înțelegere mai profundă a complexității reglării ARN în contextul expresiei genelor.

  • Secvențierea întregului transcriptom – Illumina

    Secvențierea întregului transcriptom – Illumina

    Secvențierea întregului transcriptom oferă o abordare cuprinzătoare pentru profilarea diverselor molecule de ARN, cuprinzând ARN-uri codificante (ARNm) și necodificante (ARNlnc, ARN-circ și miARN). Această tehnică captează întregul transcriptom al celulelor specifice la un moment dat, permițând o înțelegere holistică a proceselor celulare. Cunoscută și sub denumirea de „secvențiere totală a ARN-ului”, acesta își propune să dezvăluie rețele de reglementare complicate la nivel de transcriptom, permițând analize aprofundate, cum ar fi ARN-ul endogen concurent (ARNce) și analiza ARN-ului comun. Acesta marchează pasul inițial către caracterizarea funcțională, în special în dezlegarea rețelelor de reglementare care implică interacțiuni ceRNA bazate pe circRNA-miRNA-mRNA.

  • Secvențierea imunoprecipitării cromatinei (ChIP-seq)

    Secvențierea imunoprecipitării cromatinei (ChIP-seq)

    Imunoprecipitarea cromatinei (CHIP) este o tehnică care folosește anticorpii pentru a îmbogăți selectiv proteinele de legare a ADN-ului și țintele lor genomice corespunzătoare. Integrarea sa cu NGS permite profilarea la nivel de genom a țintelor ADN asociate cu modificarea histonelor, factorii de transcripție și alte proteine ​​care leagă ADN-ul. Această abordare dinamică permite comparații ale site-urilor de legare în diferite tipuri de celule, țesuturi sau condiții. Aplicațiile lui ChIP-Seq se întind de la studierea reglementării transcripționale și a căilor de dezvoltare până la elucidarea mecanismelor bolii, făcându-l un instrument indispensabil pentru înțelegerea peisajelor de reglare genomică și pentru avansarea perspectivelor terapeutice.

    Platformă: Illumina NovaSeq

Trimite-ne mesajul tau: