
Căldură de căldură
Instrumentul HeatMap acceptă un fișier de date matricial ca intrare și permite utilizatorilor să filtreze, să normalizeze și să grupeze datele. Cazul de utilizare primară pentru focuri de căldură este analiza clusterului nivelului de expresie genică între diferite eșantioane.

Adnotarea genelor
Instrumentul de adnotare a genelor efectuează adnotarea genelor bazate pe alinierea secvenței de fișiere FASTA de intrare pe diverse baze de date.

Instrument de căutare de aliniere locală de bază (BLAST)
Instrumentul BLAST este o versiune integrată BMKCLOUD a NCBI BLAST și poate fi utilizată pentru a îndeplini aceleași funcții folosind date încărcate în contul BMKCloud.

Predicție CDS_UTR
Instrumentul de predicție CDS_UTR este conceput pentru a prezice regiunile de codificare (CDS) și regiunile care nu codifică (UTR) în secvențele de transcriere date bazate pe rezultate de explozie împotriva bazelor de date proteice cunoscute și a rezultatelor de predicție ORF.

Plot Manhattan
Instrumentul de complot Manhattan permite afișarea experimentelor cu probe mari și este utilizat în mod obișnuit în studiile de asociere la nivelul genomului (GWAS).

Diagrama circoi
Instrumentul Diagrama Circos oferă o vizualizare eficientă a modului în care caracteristicile genomice sunt distribuite în genom. Caracteristicile comune includ loci cantitativi, SNP -uri, indeluri, variante de număr structural și de copie.

Gene Ontologie (GO) îmbogățirea
Instrumentul de îmbogățire GO oferă o analiză funcțională de îmbogățire. Software-ul principal al acestui instrument este pachetul Topgo-Bioconductor, care include analiza expresiei diferențiale, analiza îmbogățirii GO și vizualizarea rezultatelor.

Analiza rețelei de co-exprimare a genelor ponderate (WGCNA)
WGCNA este o metodă de extragere a datelor utilizate pe scară largă pentru descoperirea modulelor de co-exprimare a genelor. Se aplică diferitelor seturi de date de expresie, inclusiv datele de expresie genică a microarray și NGS.

Interproscan
Instrumentul Interproscan oferă analiza și clasificarea secvenței de proteine Interpro.

Îmbogățirea Kegg
Instrumentul de îmbogățire Go Kegg este proiectarea pentru a genera o histogramă de îmbogățire GO, histograma de îmbogățire KEGG și calea de îmbogățire a KEGG bazată pe un set de gene furnizate și adnotarea corespunzătoare.