Produse

Luând datele de secvențiere a izoformelor Pacific Biosciences (PACBIO) ca intrare, această aplicație este capabilă să identifice secvențe de transcriere de lungime completă (fără asamblare). Prin maparea secvențelor de lungime completă împotriva genomului de referință, transcrierile pot fi optimizate prin gene cunoscute, transcrieri, regiuni de codare, etc. În acest caz, se poate obține o identificare mai exactă a structurilor ARNm, cum ar fi splicing alternativ, etc. Analiza comună cu datele de secvențiere a transcriptomului NGS permite o adnotare mai cuprinzătoare și o cuantificare mai precisă a expresiei la nivel de transcriere, care beneficiază în mare măsură expresia diferențială din aval și analiza funcțională.