Transcriptomul este legătura dintre informațiile genetice genomice și proteomul funcției biologice. Reglarea nivelului transcripțional este cel mai important și cel mai studiat modul de reglare a organismelor. Secvențializarea transcriptomului poate secvența transcriptomului în orice moment în timp sau în orice condiție, cu o rezoluție exactă la un singur nucleotid. Poate reflecta dinamic nivelul de transcriere a genelor, identificând și cuantificat simultan transcriptele rare și normale și să furnizeze informațiile structurale din eșantion transcrieri specifice.
În prezent, tehnologia de secvențiere a transcriptomului a fost utilizată pe scară largă în agronomie, medicamente și alte domenii de cercetare, inclusiv reglarea dezvoltării animalelor și plantelor, adaptarea mediului, interacțiunea imunitară, localizarea genelor, evoluția genetică a speciilor și detectarea tumorii și a bolilor genetice.