mRNA-seq (NGS) – De novo

Secvențierea ARNm permite profilarea tuturor transcriptelor ARNm din celule în condiții specifice și este o tehnologie utilizată pe scară largă în diferite domenii de cercetare. Conducta BMKCloud De novo mRNA-seq este proiectată pentru a analiza biblioteci de secvențiere îmbogățite cu poli-A atunci când nu este disponibil niciun genom de referință. Conducta începe cu controlul calității, urmat dede novoasamblarea transcripției și selecția setului unigene. Analiza structurii unigene prezice secvența de codificare (CDS) și repetarea secvenței simple (SSR). Ulterior, analiza expresiei diferențiale găsește gene exprimate diferențial (DEG) printre condițiile testate, urmate de adnotarea funcțională și îmbogățirea DEG-urilor pentru a extrage informații biologice.