Metagenomics (NGS)

Metagenomica cu pușca cu Illumina este un instrument popular pentru studierea microbiomilor prin secvențarea directă a ADN -ului din eșantioane complexe, permițând studiul atât al diversității taxonomice, cât și ale funcționale. Conducta BMKCloud Metagenomic (NGS) începe cu controlul calității și ansamblul metagenomului, din care genele sunt prezise și grupate în seturi de date neredundante care sunt adnotate pentru funcție și taxonomie folosind mai multe baze de date. Aceste informații sunt utilizate pentru a analiza diversitatea taxonomică din cadrul eșantionului (diversitatea alfa) și diversitatea dintre eșantion (diversitatea beta). Analiza diferențială între grupuri găsește OTU și funcții biologice care diferă între cele două grupuri folosind atât teste parametrice, cât și non-parametrice, în timp ce analiza corelației se referă la aceste diferențe cu factorii de mediu.