
lncrna
ARN-urile lungi care nu codifică (lncRNA) sunt ARN mai lungi de 200 de nucleotide cu potențial scăzut de codare, dar cu funcții de reglementare critice. Conducta BMKCLOUD lncRNA este concepută pentru a analiza bibliotecile epuizate de ARNR cu un genom de referință bine adnotat de înaltă calitate, analizând împreună expresia ARNm și ARNm. După citirea și controlul calității, citirile sunt aliniate la genomul de referință la asamblarea transcrierilor, iar analiza ulterioară a structurii genelor dezvăluie splicing alternativ și gene noi. Transcrierile sunt identificate ca ARNm sau ARNcRNA, iar analiza expresiei diferențiale identifică lncRNA -uri exprimate diferențial, țintele lor și genele exprimate diferențial (DEG). Atât DeG -urile, cât și țintele LNCRNA exprimate în mod diferit sunt adnotate funcțional pentru a găsi categorii funcționale îmbogățite.
Bioinformatică
