Biblioteci prefabricate DNBSEQ
Caracteristici
●Platformă:MGI-DNBSEQ-T7
●Moduri de secvențiere:PE150
●Transferul bibliotecilor Illumina cătreMGI:permițând secvențierea unor volume mari de date la costuri reduse.
●Controlul calității bibliotecilor înainte de secvențiere.
●Secvențierea datelor QC și livrare:livrarea raportului QC și a datelor brute în format fastq după demultiplexarea și filtrarea citirilor Q30.
Avantaje
●Versatilitatea serviciilor de secvențiere:clientul poate alege să ordoneze după bandă sau cantitatea de date.
●Ieșire mare de date:1500 Gb/bandă
●Livrarea raportului QC de secvențiere:cu metrici de calitate, acuratețea datelor și performanța generală a proiectului de secvențiere.
●Procesul de secvențiere matur:cu timp scurt de întoarcere.
●Control riguros al calității: implementăm cerințe stricte de control al calității pentru a garanta furnizarea de rezultate constant de înaltă calitate.
Cerințe pentru mostre
| Cantitatea datelor (X) | Concentrație (qPCR/nM) | Volum | |
| Bandă parțială
| X ≤ 10 Gb | ≥ 1 nM | ≥ 25 μl |
| 10 Gb < X ≤ 50 Gb | ≥ 2 nM | ≥ 25 μl | |
| 50 Gb < X ≤ 100 Gb | ≥ 3 nM | ≥ 25 μl | |
| X > 100 Gb | ≥ 4 nM | ||
| Bandă Simplă | Per Lane | ≥ 1,5 nM / pool bibliotecă | ≥ 25 μl / bazin bibliotecă |
Pe lângă concentrație și cantitatea totală, este de asemenea necesar un model de vârf adecvat.
Notă: Secvențierea pe benzi a bibliotecilor cu diversitate redusă necesită introducerea PhiX pentru a asigura apelarea de bază robustă.
Vă recomandăm să trimiteți biblioteci pre-grupate ca mostre. Dacă aveți nevoie de BMKGENE pentru a realiza pooling de biblioteci, vă rugăm să consultați
cerințele bibliotecii pentru secvențierea parțială a benzilor.
Dimensiunea bibliotecii (hartă de vârf)
Vârful principal ar trebui să fie între 300-450 bp.
Bibliotecile ar trebui să aibă un singur vârf principal, fără contaminare a adaptorului și fără dimeri de grund.
Fluxul de lucru al serviciului
Raport QC bibliotecă
Un raport privind calitatea bibliotecii este furnizat înainte de secvențiere, evaluarea cantității bibliotecii și fragmentare.
Raport QC de secvențiere
Tabelul 1. Statistici privind secvențierea datelor.
| ID-ul eșantionului | BMKID | Citirile brute | Date brute (bp) | Citiri curate (%) | Q20(%) | Q30(%) | GC(%) |
| C_01 | BMK_01 | 22.870.120 | 6.861.036.000 | 96,48 | 99.14 | 94,85 | 36,67 |
| C_02 | BMK_02 | 14.717.867 | 4.415.360.100 | 96.00 | 98,95 | 93,89 | 37.08 |
Figura 1. Distribuția calității de-a lungul citirilor din fiecare probă
Figura 2. Distribuția conținutului de bază
Figura 3. Distribuția conținutului citit în datele de secvențiere
