Bibliotecile pre-fabricate Illumina
Caracteristici
●Platforme:Illumina Novaseq 6000 și Novaseq X Plus
●Moduri de secvențiere:PE150 și PE250
●Controlul calității bibliotecilor înainte de secvențiere
●Secvențarea datelor QC și Livrare:Livrarea raportului QC și a datelor brute în format FASTQ după demultiplexare și filtrare Q30
Avantaje de serviciu
●Versatilitatea serviciilor de secvențiere:Clientul poate alege să secvențeze pe banda, celula de flux sau prin cantitatea de date necesare (secvențiere parțială a benzii).
●Experiență vastă pe platforma de secvențiere Illumina:cu mii de proiecte închise cu diverse specii.
●Livrarea de secvențiere QC Raport:cu valori de calitate, precizia datelor și performanța generală a proiectului de secvențiere.
●Proces de secvențiere matură:cu timp scurt de întoarcere.
●Control riguros al calității: Implementăm cerințe QC stricte pentru a garanta livrarea de rezultate constante de înaltă calitate.
Platforme de probă
| Platformă | Celula de flux | Mod de secvențiere | Unitate | Producție estimată |
| Novaseq x | 10b (8 benzi) | PE150 | Bandă Simplă Banda parțială | 375 GB / bandă |
| 25b (8 benzi) | PE150 | Bandă Simplă Banda parțială | 1000 GB/bandă | |
| Novaseq 6000 | SP Flow Cell (2 benzi) | PE250 | Celula de flux Bandă Simplă Banda parțială | 325-400 m Citește / Lane |
| Celula de flux S4 (4 benzi) | PE150 | Celula de flux Bandă Simplă Banda parțială | ~ 800 GB / bandă |
Cerințe de eșantion
| Suma de date (x) | Concentrare (qPCR/NM) | Volum | |
| Secvențiere parțială a benzii
| X ≤ 10 GB | ≥ 1 nm | ≥ 25 µl |
| 10 GB <x ≤ 50 GB | ≥ 2 nm | ≥ 25 µl | |
| 50 GB <x ≤ 100 GB | ≥ 3 nm | ≥ 25 µl | |
| X> 100 GB | ≥ 4 nm | ≥ 25 µl | |
| Secvențiere a benzii | Pe banda | ≥ 1,5 nm / bazin de bibliotecă | ≥ 25 µl / bazin de bibliotecă |
Pe lângă concentrare și cantitate totală, este necesar și un model de vârf adecvat.
Notă: Secvențarea pe benzi a bibliotecilor cu diversitate scăzută necesită Phix Spike-In pentru a asigura apelurile robuste de bază.
Vă recomandăm să trimiteți biblioteci pre-pool-uri ca eșantioane. Dacă aveți nevoie de BMKGENE pentru a efectua colectarea bibliotecii, vă rugăm să consultați
cerințele bibliotecii pentru secvențarea parțială a benzii.
Dimensiunea bibliotecii (harta vârfului)
Vârful principal ar trebui să fie în 300-450 bp.
Bibliotecile ar trebui să aibă un singur vârf principal, fără contaminare cu adaptor și fără dimeri de primer.
Vă rugăm să ne adresați dacă eșantioanele dvs. nu îndeplinesc cerințele materiale de pornire.
Flux de lucru al serviciului
Controlul calității bibliotecii
Secvențiere
Controlul calității datelor
Livrarea proiectului
Raport QC al bibliotecii
Un raport privind calitatea bibliotecii este furnizat înainte de secvențiere, evaluare a sumei bibliotecii și fragmentare.
Secvențiere Raport QC
Tabelul 1. Statistici privind secvențierea datelor.
| Eșantion ID | Bmkid | Citiri brute | Date brute (BP) | Citiri curate (%) | Q20 (%) | Q30 (%) | GC (%) |
| C_01 | BMK_01 | 22.870.120 | 6.861.036.000 | 96.48 | 99.14 | 94.85 | 36.67 |
| C_02 | BMK_02 | 14.717.867 | 4.415.360.100 | 96.00 | 98.95 | 93.89 | 37.08 |
Figura 1. Distribuția calității de -a lungul citirilor din fiecare eșantion
Figura 2. Distribuția conținutului de bază
Figura 3. Distribuția conținutului de citire în secvențarea datelor
