Secvențiere CircRNA-Illumina
Caracteristici
● Epuizarea ARNm urmată de pregătirea bibliotecii direcționale, permițând date de secvențiere specifice catenelor.
● Fluxul de lucru bioinformatic permite predicția CircRNA și cuantificarea expresiei
Avantaje de serviciu
●Bibliotecile ARN mai cuprinzătoare:Folosim epuizarea ARNR în loc de epuizarea ARN liniară în prepararea noastră pre-bibliotecă, asigurându-ne că datele de secvențiere includ nu numai CircRNA, ci și mRNA și lncRNA, permițând analiza comună a acestor seturi de date
●Analiza opțională a rețelelor ARN endogene competitive (CERNA): Furnizarea de informații mai profunde asupra mecanismelor de reglare celulară
●Expertiză extinsă: Cu un palmares de prelucrare a peste 20.000 de probe la BMKGENE, care se întinde pe diverse tipuri de eșantioane și proiecte LNCRNA, echipa noastră aduce o bogată experiență pentru fiecare proiect.
●Control riguros al calității: Implementăm puncte de control de bază pe toate etapele, de la pregătirea eșantionului și a bibliotecii până la secvențiere și bioinformatică. Această monitorizare minuțioasă asigură livrarea de rezultate constant de înaltă calitate.
● Suport post-vânzare: Angajamentul nostru se extinde dincolo de finalizarea proiectului cu o perioadă de serviciu după vânzare de 3 luni. În acest timp, oferim urmărirea proiectului, asistență de depanare și sesiuni de întrebări și întrebări pentru a aborda orice întrebări legate de rezultate.
Cerințe de eșantion și livrare
| Bibliotecă | Platformă | Date recomandate | Date QC |
| biblioteca direcțională epuizată de rRNA | Illumina PE150 | 16-20 GB | Q30≥85% |
Cerințe de eșantion:
Nucleotide:
| Conc. (Ng/µl) | Cantitate (μg) | Puritate | Integritate |
| ≥ 80 | ≥ 0,8 | OD260/280 = 1,7-2,5 OD260/230 = 0,5-2,5 Contaminare limitată sau fără proteină sau ADN prezentată pe gel. | Rin≥6.0; 5.0≥28S/18S≥1.0; limitat sau fără altitudine de bază |
● Plante:
Rădăcină, tulpină sau petală: 450 mg
Frunze sau semințe: 300 mg
Fructe: 1,2 g
● Animal:
Inima sau intestinul: 450 mg
Viscera sau creier: 240 mg
Mușchi: 600 mg
Oase, păr sau piele: 1,5g
● Artropode:
Insecte: 9g
Crustacea: 450 mg
● Sânge întreg:2 tuburi
● Celule: 106 celule
● ser și plasmă: 6 ml
Eșantionul recomandat
Container: 2 ml tub de centrifugă (folia de staniu nu este recomandată)
Etichetare de probă: grup+replică de exemplu A1, A2, A3; B1, B2, B3.
Expediere:
1. ICE uscat: probele trebuie să fie ambalate în pungi și îngropate în gheață uscată.
2. Tuburi RNASTABLE: Probele de ARN pot fi uscate în tubul de stabilizare ARN (de exemplu, RNASTABLE®) și expediate la temperatura camerei.
Flux de lucru de serviciu
Proiectare experiment
Livrare de probe
Extracția ARN
Construcția bibliotecii
Secvențiere
Analiza datelor
Servicii după vânzare
Bioinformatică
Predicție CircRNA: distribuție cromozomială
CircRNA -uri exprimate diferențial - Vulcanul complot
CircRNA -uri exprimate diferențial - clustering ierarhic
Îmbogățirea funcțională a genelor gazdă ale Circna
Explorați progresele de cercetare facilitate de serviciile de secvențiere CircRNA BMKGENE 'printr -o colecție curată de publicații.
Wang, X. și colab. (2021) 'CPSF4 reglează formarea CircRNA și reducerea la reducerea genelor mediate de microARN în carcinomul hepatocelular', Oncogene 2021 40:25, 40 (25), p. 4338–4351. doi: 10.1038/s41388-021-01867-6.
Xia, K. și colab. (2023) 'X Transcriptomul responsabil de oo relevă rolul ARN-ului circular133 în rezistența la boli prin reglarea expresiei Osarab în orez', Fitopatologie Cercetare, 5 (1), pp. 1-14. doi: 10.1186/s42483-023-00188-8/figuri/6.
Y, H. și colab. (2023) 'CPSF3 modulează echilibrul transcrierilor circulare și liniare în carcinomul hepatocelular'. doi: 10.21203/rs.3.rs-2418311/v1.
Zhang, Y. și colab. (2023) „Evaluarea cuprinzătoare a CircRNA -urilor în cardiomiopatia cirotică înainte și după transplantul de ficat”, Imunofarmacologie internațională, 114, p. 109495. Doi: 10.1016/j.intimp.2022.109495.
