
Circrna
ARN-urile circulare (CircRNAs) sunt ARN-uri care nu codifică care formează structuri circulare și au mai multe roluri de reglementare, inclusiv concurența cu miRNA pentru genele țintă și legarea proteinelor. Conducta CircRNA BMKCLOUD este proiectată pentru analiza bibliotecilor epuizate de ARNR cu un genom de referință de înaltă calitate și de înaltă calitate. Analiza începe cu tunderea citirii și controlul calității, urmată de alinierea citită la genomul de referință și predicția noilor circRNA -uri, cuplată cu identificarea circRNA -urilor cunoscute din bazele de date. Obiectivele miRNA corespunzătoare și gazdele CircRNA sunt identificate ulterior. Analiza expresiei diferențiale dezvăluie circRNA -uri exprimate diferențial, iar gazdele corespunzătoare sunt adnotate funcțional pentru a extrage funcții biologice îmbogățite.
Bioinformatică
