Pequeno sequenciamento de RNA-ilumina
Características
● A preparação da biblioteca inclui uma etapa de seleção de tamanho
● Análise bioinformática centrada em torno da previsão do miRNA e seus alvos
Vantagens de serviço
●Análise abrangente de bioinformática:Habilitando a identificação de miRNAs conhecidos e novos, identificação de alvos de miRNAs e anotação funcional correspondente e enriquecimento com vários bancos de dados (KEGG, GO)
●Controle de qualidade rigoroso: Implementamos pontos de controle principal em todos os estágios, desde a preparação da amostra e da biblioteca até o sequenciamento e a bioinformática. Esse monitoramento meticuloso garante a entrega de resultados consistentemente de alta qualidade.
●Suporte pós-venda: Nosso compromisso se estende além da conclusão do projeto com um período de serviço pós-venda de três meses. Durante esse período, oferecemos acompanhamento do projeto, assistência de solução de problemas e sessões de perguntas e respostas para abordar quaisquer consultas relacionadas aos resultados.
●Extensa experiência: Com um histórico de fechamento com sucesso em vários projetos de SRNA, cobrindo mais de 300 espécies em vários domínios de pesquisa, nossa equipe traz uma riqueza de experiência a todos os projetos.
Requisitos de amostra e entrega
| Biblioteca | Plataforma | Dados recomendados | Dados QC |
| Tamanho selecionado | Illumina SE50 | LEITAS DE 10M-20M | Q30≥85% |
Requisitos de amostra:
Nucleotídeos:
| Conc. (Ng/μl) | Quantidade (μg) | Pureza | Integridade |
| ≥ 80 | ≥ 0,8 | OD260/280 = 1,7-2.5 OD260/230 = 0,5-2,5 Contaminação limitada ou sem proteína ou DNA mostrado em gel. | Rin≥6,0; 5.0≥28s/18s≥1,0; elevação limitada ou sem linha de base |
● Plantas:
Raiz, haste ou pétala: 450 mg
Folha ou semente: 300 mg
Fruta: 1,2 g
● Animal:
Coração ou intestino: 450 mg
Vísceras ou cérebro: 240 mg
Músculo: 600 mg
Ossos, cabelo ou pele: 1.5g
● Artrópodes:
Insetos: 9g
Crustacea: 450 mg
● Sangue inteiro: 2 tubos
● Células: 106 células
● soro e plasma:6 ml
Entrega de amostra recomendada
Contêiner: 2 ml de tubo de centrífuga (folha de estanho não é recomendada)
Rotulagem de amostra: grupo+replicar por exemplo A1, A2, A3; B1, B2, B3.
Remessa:
1. Gelo seco: as amostras precisam ser embaladas em sacos e enterradas em gelo seco.
2. Tubos RNASTABLE: As amostras de RNA podem ser secas no tubo de estabilização de RNA (por exemplo, rnastable®) e enviadas em temperatura ambiente.
Fluxo de trabalho de serviço
Projeto de experimento
Entrega de amostra
Extração de RNA
Construção da biblioteca
Sequenciamento
Análise de dados
Serviços pós-venda
Bioinformática
● Controle de qualidade de dados brutos
● Classificação SRNA
● Alinhamento a um genoma de referência
● Identificação de miRNA conhecido e novo
● Análise diferencial de expressão de miRNA
● Anotação funcional de alvos de miRNA
Identificação do miRNA: estrutura e profundidade
Expressão diferencial do miRNA - agrupamento de pêlos hi -pesquisadores
Anotação funcional do alvo de miRNAs diferencialmente expressos
Explore os avanços da pesquisa facilitados pelos Serviços de Sequenciamento SRNA da BMKGENE por meio de uma coleção de publicações com curadoria.
Chen, H. et al. (2023) 'Infecções virais inibem a biossíntese e a fotossíntese da saponina em Panax Notoginseng', Plant Physiology and Bioquemistry, 203, p. 108038. Doi: 10.1016/j.Plaphy.2023.108038.
Li, H. et al. (2023) 'A proteína que contenha o domínio do domínio da planta se associa aos componentes do microprocessador para reprimir a biogênese do miRNA', relata o EMBO, 24 (1). doi: 10.15252/bocousem.
Yu, J. et al. (2023) 'O Microrna AME-Bantam-3p controla o desenvolvimento da pupal larval, visando os múltiplos domínios do tipo fator de crescimento epidérmico 8 gene (MEGF8) na abelha, apis mellifera', International Journal of Molecular Sciences, 24 (6), p, p, . 5726. Doi: 10.3390/ijms24065726/s1.
Zhang, M. et al. (2018) 'Análise integrada do miRNA e genes associados à qualidade da carne revela que o GGA-MIR-140-5P afeta a deposição de gordura intramuscular em galinhas, fisiologia celular e bioquímica, 46 (6), pp. 2421–2433. doi: 10.1159/000489649.
