RNA pequeno

Os pequenos RNAs são RNAs curtos não codificantes, com um comprimento médio de 18 a 30 nt, incluindo miRNA, siRNA e PIRNA, que desempenham papéis importantes nos processos regulatórios. O pipeline BMKCloud SRNA fornece análise padrão e personalizada para identificação de miRNA. Após o corte e o controle de qualidade da leitura, as leituras estão alinhadas com vários bancos de dados para classificar SRNAs e selecionar miRNAs e mapeados para o genoma de referência. Os miRNAs são identificados com base em bancos de dados de miRNA conhecidos, fornecendo informações sobre estrutura secundária, família miRNA e genes -alvo. A análise de expressão diferencial identifica miRNAs expressos diferencialmente e os genes alvo correspondentes são anotados funcionalmente para encontrar categorias enriquecidas.