
Mapa de calor
A ferramenta Heatmap aceita um arquivo de dados de matriz como entrada e permite aos usuários filtrar, normalizar e agrupar dados. O principal caso de uso para mapas de calor é a análise de agrupamento do nível de expressão gênica entre diferentes amostras.

Anotação genética
A ferramenta Gene Annotation realiza anotação genética com base no alinhamento de sequência de arquivos FASTA de entrada em vários bancos de dados.

Ferramenta básica de pesquisa de alinhamento local (BLAST)
A ferramenta BLAST é uma versão integrada do BMKCloud do NCBI BLAST e pode ser usada para executar as mesmas funções usando dados carregados na conta BMKCloud.

Previsão CDS_UTR
A ferramenta de previsão CDS_UTR foi projetada para prever regiões codificantes (CDS) e regiões não codificantes (UTR) em determinadas sequências de transcrição com base em resultados do BLAST em relação a bancos de dados de proteínas conhecidos e resultados de previsão de ORF.

Conspiração de Manhattan
A ferramenta Manhattan Plot permite a exibição de experimentos com muitas amostras e é comumente usada em estudos de associação genômica ampla (GWAS).

Diagrama de Circos
A ferramenta CIRCOS Diagram fornece visualização eficiente de como as características genômicas estão distribuídas no genoma. As características comuns incluem loci quantitativos, SNPs, InDels, variantes estruturais e de número de cópias.

Enriquecimento de Ontologia Genética (GO)
A ferramenta GO Enrichment fornece análise de enriquecimento funcional. O software principal desta ferramenta é o pacote TopGO-Bioconductor, que inclui análise de expressão diferencial, análise de enriquecimento GO e visualização dos resultados.

Análise de rede de coexpressão genética ponderada (WGCNA)
WGCNA é um método de mineração de dados amplamente utilizado para descobrir módulos de coexpressão genética. É aplicável a vários conjuntos de dados de expressão, incluindo dados de expressão genética de microarray e NGS.

InterProScan
A ferramenta InterProScan fornece análise e classificação de sequências de proteínas InterPro.

Enriquecimento GO KEGG
A ferramenta de enriquecimento GO KEGG foi projetada para gerar um histograma de enriquecimento GO, um histograma de enriquecimento KEGG e uma via de enriquecimento KEGG com base em um conjunto de genes fornecido e na anotação correspondente.