Faça login no BMKCloud

Ferramentas poderosas de análise

wps_doc_13

Mapa de calor

A ferramenta Heatmap aceita um arquivo de dados de matriz como entrada e permite aos usuários filtrar, normalizar e agrupar dados. O principal caso de uso para mapas de calor é a análise de agrupamento do nível de expressão gênica entre diferentes amostras.

 

wps_doc_14

Anotação genética

A ferramenta Gene Annotation realiza anotação genética com base no alinhamento de sequência de arquivos FASTA de entrada em vários bancos de dados.

wps_doc_15

Ferramenta básica de pesquisa de alinhamento local (BLAST)

A ferramenta BLAST é uma versão integrada do BMKCloud do NCBI BLAST e pode ser usada para executar as mesmas funções usando dados carregados na conta BMKCloud.

wps_doc_16

Previsão CDS_UTR

A ferramenta de previsão CDS_UTR foi projetada para prever regiões codificantes (CDS) e regiões não codificantes (UTR) em determinadas sequências de transcrição com base em resultados do BLAST em relação a bancos de dados de proteínas conhecidos e resultados de previsão de ORF.

wps_doc_17

Conspiração de Manhattan

A ferramenta Manhattan Plot permite a exibição de experimentos com muitas amostras e é comumente usada em estudos de associação genômica ampla (GWAS).

wps_doc_18

Diagrama de Circos

A ferramenta CIRCOS Diagram fornece visualização eficiente de como as características genômicas estão distribuídas no genoma. As características comuns incluem loci quantitativos, SNPs, InDels, variantes estruturais e de número de cópias.

wps_doc_19

Enriquecimento de Ontologia Genética (GO)

A ferramenta GO Enrichment fornece análise de enriquecimento funcional. O software principal desta ferramenta é o pacote TopGO-Bioconductor, que inclui análise de expressão diferencial, análise de enriquecimento GO e visualização dos resultados.

wps_doc_20

Análise de rede de coexpressão genética ponderada (WGCNA)

WGCNA é um método de mineração de dados amplamente utilizado para descobrir módulos de coexpressão genética. É aplicável a vários conjuntos de dados de expressão, incluindo dados de expressão genética de microarray e NGS.

wps_doc_17

InterProScan

 A ferramenta InterProScan fornece análise e classificação de sequências de proteínas InterPro.

 

wps_doc_21

Enriquecimento GO KEGG

A ferramenta de enriquecimento GO KEGG foi projetada para gerar um histograma de enriquecimento GO, um histograma de enriquecimento KEGG e uma via de enriquecimento KEGG com base em um conjunto de genes fornecido e na anotação correspondente.

obter uma cotação

Escreva aqui sua mensagem e envie para nós

Envie sua mensagem para nós: